拟南芥启动子区串联重复序列鉴定及其对基因表达的影响

串联重复序列是一类特殊的DNA片段，它广泛存在于多种生物体基因组中，其功能研究一直备受人们关注。本课题立足于已有科学发现及当前基因表达调控研究热点，首次系统并完整地鉴定拟南芥启动子区串联重复序列及其分布特征。通过生物信息学、生物统计学、Microarray数据、报告基因系统、转基因等途径研究串联重复序列与基因表达之间的关系。我们首先在拟南芥启动子区系统鉴定了10833个串联重复序列，这些序列在启动子区的分布呈现不均匀性；另外，特定串联重复序列在不同生态型拟南芥植株中的多态性分布和在同一基因家族中的保守性特征暗示着这些序列可能具有功能性；我们利用瞬时和稳定转基因系统筛选并鉴定了一个串联重复序列，其上重复单元的改变能显著引起该启动子的活性，该串联重复序列已申请国家发明专利（ZL201210087731.5）；最后，我们通过酵母单杂及EMSA实验鉴定了一Dof蛋白因子可以结合该串联重复序列（专利号：201410192408.3），这些为后续进一步研究提供坚实的基础。该研究有助于阐明植物启动子区串联重复序列所介导的基因表达调控机制，最终达到更好地服务于农业生产的目的。