DNA脱碱基位点的药物小分子识别:电化学研究及其作用模式分析
批准号:
21075112
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
邵勇
依托单位:
学科分类:
B0402.电分析化学
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
缪煜清、吴小华、谢云龙、刘继伟、吴兰菊、崔清华、马坤、周炳江
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中文摘要
本项目拟研究药物小分子对DNA脱碱基位点的识别及其作用模式,这是一种小分子作用于DNA的新的识别结合模式。基于脱碱基位点的结构特点,拟研究的药物小分子的识别能力表现在:药物小分子对脱碱基位点有强的结合能力,而对结构完整的DNA结合很弱或没有结合。以人类p53基因片段为例,拟采用电化学方法并结合谱学技术研究具有氢键结构及环平面结构的蝶呤小分子药物对DNA脱碱基位点的识别特异性, 同时阐明小分子结构上的微小变化(取代基团的大小、种类、亲/疏水性等)以及DNA脱碱基位点附近序列的变化(氢键未配对碱基)对结合的影响, 阐明识别作用模式。这种小分子作用模式将不同于广为人们所熟知的静电、嵌入、沟槽结合模式。DNA脱碱基位点以一定的浓度真实存在于活体中,因此阐明药物小分子对其的识别作用将对正确理解药物小分子在基因水平的影响及基于新作用靶点的新型药物开发具有重要意义。
英文摘要
研究了有机小分子及贵金属纳米簇对DNA脱碱基位点的识别及其作用模式。这是一种不为人们所广泛注意的探针选择性识别DNA的结合模式, 其识别特征表现为:对脱碱基位点结构有强的结合能力,而对结构完整的DNA结合很弱或没有结合。以人类p53基因片段为模型,采用激发态电化学方法并结合谱学技术研究了黄酮类化合物、异喹啉生物碱、吩嗪类染料、苯并噻唑类染料、银纳米簇等探针对DNA脱碱基位点的识别特异性, 研究了这些探针结构上的微小变化(取代基团的大小、种类、取代位置、亲/疏水性等)以及DNA脱碱基位点附近序列的变化(氢键未配对碱基、侧翼碱基等)对结合的影响, 表明脱碱基位点大小及碱基序列对探针的结合起决定作用。研究了探针分子在脱碱基位点结合后的光物理性质,发展了荧光增强型脱碱基位点识别新方法及DNA单核苷酸多态型分析新方法。此外,研究了以DNA为模板,合成荧光性的金、铜纳米结构,这些纳米结构探针也有望在DNA识别方面得到广泛应用。这种脱碱基位点识别模式不同于广为人们所熟知的静电、嵌入、沟槽结合模式;且DNA脱碱基位点以一定的浓度真实存在于活体中,因此阐明具有药用价值的小分子对其的识别作用对正确理解药物小分子在基因水平的影响及基于新作用靶点的新型药物开发具有重要意义。
期刊论文列表
专著列表
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专利列表
DNA abasic site-based aptamer for selective fluorescence light-up detection of fisetin by excited-state intramolecular proton transfer
基于DNA脱碱基位点的适体,用于通过激发态分子内质子转移选择性荧光照明检测非瑟酮
DOI:10.1016/j.snb.2012.05.051
发表时间:2012-08
期刊:Sensors and Actuators B: Chemical
影响因子:--
作者:Xu Shujuan;Shao Yong;Ma Kun;Cui Qinghua;Liu Guiying;Wu Fei
通讯作者:Wu Fei
DOI:10.1016/j.snb.2013.07.034
发表时间:2013-11
期刊:Sensors and Actuators B-chemical
影响因子:8.4
作者:Yanwei Sun;Yong Shao;Jian Peng;Lingling Liu;Botao Teng
通讯作者:Yanwei Sun;Yong Shao;Jian Peng;Lingling Liu;Botao Teng
DOI:10.1371/journal.pone.0048251
发表时间:2012
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Wu F;Sun Y;Shao Y;Xu S;Liu G;Peng J;Liu L
通讯作者:Liu L
DOI:10.1016/j.aca.2012.02.044
发表时间:2012-04
期刊:Analytica chimica acta
影响因子:6.2
作者:Qinghua Cui;Kun Ma;Yong Shao;Shu-juan Xu;Fei Wu;Guiying Liu;N. Teramae;H. Bao
通讯作者:Qinghua Cui;Kun Ma;Yong Shao;Shu-juan Xu;Fei Wu;Guiying Liu;N. Teramae;H. Bao
Base-Stacking-Determined Fluorescence Emission of DNA Abasic Site-Templated Silver Nanoclusters
DNA 无碱基位点模板银纳米团簇的碱基堆积测定荧光发射
DOI:10.1021/la301957m
发表时间:2012-10-30
期刊:LANGMUIR
影响因子:3.9
作者:Ma, Kun;Shao, Yong;Liu, Guiying
通讯作者:Liu, Guiying
人类端粒G-quadruplex结构的植物源分子靶向聚类浓集及活性调控机理
- 批准号:D25C050003
- 项目类别:省市级项目
- 资助金额:0.0万元
- 批准年份:2025
- 负责人:邵勇
- 依托单位:
极性掺杂驱动的G-四链体可塑性调控及结构开关传感器构建
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:54万元
- 批准年份:2022
- 负责人:邵勇
- 依托单位:
人类端粒G-四链体碱基损伤缺失位点的选择性识别及回稳研究
- 批准号:21675142
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:邵勇
- 依托单位:
国内基金
海外基金















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