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在K-rasG12D和Cas9/dCas9条件性敲除小鼠中建立基于CRISPR基因敲除和过表达的肺腺癌遗传学筛选和功能研究模型
结题报告
批准号:
81874236
项目类别:
面上项目
资助金额:
82.0 万元
负责人:
孙书国
依托单位:
学科分类:
H1826.肿瘤学研究新技术与新方法
结题年份:
2022
批准年份:
2018
项目状态:
已结题
项目参与者:
罗贤雯、彭会明、徐姗、王星、彭政鑫、李莎莎、严文婷、王路路、杨永琴
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中文摘要
肺癌是癌症死亡的首要因素,我国由于空气污染和控烟不力,每年约有70万新增患者。研究显示,在占肺癌40%的肺腺癌中,有超过1000个基因展现一定频率的突变或表观遗传改变,如何鉴别驱动突变是困扰精准医疗的关键问题。本课题将围绕这一核心困扰,拟在K-rasG12D和Cas9/dCas9条件敲除小鼠中建立基于CRISPR-Cas9基因敲除/过表达的遗传学筛选和功能研究的肺腺癌模型。在此基础上,联用激光微切割技术,在该敲除模型中进行表观驱动基因的筛选和功能验证,并在此模型中引入近红外荧光iRFP和透明化技术在肺的原位分析肿瘤的表型和微环境。前期的敲除预实验显示,这个系统支持一定规模的遗传学筛选以及候选基因的功能分析。该模型的建成既能极大地缩短肺癌的在体遗传学研究周期从3-5年至1-2年,又能通过筛选找到新的抑癌基因,可基本克服小鼠遗传学资源缺乏问题。
英文摘要
Lung cancer is the leading cause of cancer death. China has about 700,000 new patients each year due to air pollution and poor control of tobacco. Studies have shown that more than 1,000 genes exhibit mutations or epigenetic changes in lung adenocarcinoma which occupies 40% of lung cancer. How to identify driver mutations is a key issue for precision medicine. This project will focus on this question and propose to establish a lung adenocarcinoma model based on CRISPR-Cas9 knockout/overexpression technology in K-rasG12D and Cas9/dCas9 conditional knockout mice. Based on this model, through combining laser capture microdissection technology, the potential driven genes will be screened and functionally verified in the knock-out model. We will also develop iRFP and tissue clearing technology by uDisco to examine tumor phenotype in situ. The preliminary data show that this system supports sub genome wide genetic screening and functional analysis of candidate genes. The completion of this project can shorten the in vivo lung cancer genetic research from 3-5 years to 1-2 years, find new tumor suppressor genes, and overcome the bottleneck of mouse genetic resources limitation.
在癌症基因组时代,大量基因突变和表观遗传改变被挖掘,但如何鉴别其中真正的癌症驱动基因目前仍然是一个难题。为克服该难点,本课题在K-RasG12DCas9LSLZsGreenLSL条件敲除小鼠中建立了基于CRISPR-Cas9基因敲除的遗传学筛选和功能研究的肺腺癌模型,结合透明化技术和光片显微镜成像技术可在肺脏原位精准定量肿瘤数量、体积和分型,并且联用激光显微切割技术,可在该模型中进行肺癌驱动基因的高通量文库筛选。利用该模型我们鉴定出了约10个驱动基因,并通过高通量文库筛选鉴定出STAG2为肺癌驱动基因。该CRISPR-Cas9条件性敲除模型结合透明化三维成像技术可在短期内鉴定和筛选出肺癌驱动基因,为肺癌发病机制研究和驱动基因的鉴定和发现提供了强有力的工具。通过研究发表了第一标注论文2篇,培养了博士后2名,研究生5名,其中硕士研究生4名,博士研究生1名。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Protocol to establish a lung adenocarcinoma immunotherapy allograft mouse model with FACS and immunofluorescence-based analysis of tumor response.
使用 FACS 和基于免疫荧光的肿瘤反应分析建立肺腺癌免疫治疗同种异体移植小鼠模型的方案
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100595
发表时间:2021-06-18
期刊:STAR protocols
影响因子:--
作者:Peng Z;Yu M;Lin J;Dong T;Zhang X;Shi M;Qin M;Li S;Guo W;Zhang H;Sun S
通讯作者:Sun S
DOI:molcel.2021.01.010
发表时间:2021
期刊:Molecular Cell
影响因子:16
作者:Man Yu;Zhengxin Peng;Min Qin;Yang Liu;Jingning Wang;Cai Zhang;Jiaming Lin;Tianqi Dong;Lulu Wang;Shasha Li;Yongqin Yang;Shan Xu;Wencong Guo;Xiao Zhang;MIngjun Shi;Huiming Peng;Xianwen Luo;Huixia Zhang;Li Zhang;Yan Li;Xiang-Ping Yang;Shuguo Sun
通讯作者:Shuguo Sun
Interferon-g induces tumor resistance to anti-PD-1 immunotherapy by promoting YAP phase separation
干扰素-g 通过促进 YAP 相分离诱导肿瘤对抗 PD-1 免疫疗法的抵抗
DOI:--
发表时间:2021
期刊:Molecular Cell
影响因子:16
作者:Man Yu;Zhengxin Peng;Min Qin;Yang Liu;Jingning Wang;Cai Zhang;Jiaming Lin;Tianqi Dong;Lulu Wang;Shasha Li;Yongqin Yang;Shan Xu;Wencong Guo;Xiao Zhang;MIngjun Shi;Huiming Peng;Xianwen Luo;Huixia Zhang;Li Zhang;Yan Li;Xiang-Ping Yang;Shuguo Sun
通讯作者:Shuguo Sun
DOI:https://doi.org/10.1016/j.xpro.2021.100595
发表时间:2021
期刊:Star Protocol
影响因子:--
作者:Zhengxin Peng;Man Yu;Lin Jiaming;Dong Tianqi;Zhang Xiao;Shi Mingjun;Qin Min;Li Shasha;Guo Wencong;Zhang Huixia;Sun Shuguo
通讯作者:Sun Shuguo
探究LATS2相变机制以及在Hippo信号通路的信号转导和肿瘤转移中的功能
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    54万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    孙书国
  • 依托单位:
国内基金
海外基金