基于blaCTX-M-15质粒数据库探讨NDM-1在我国传播的可能性

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81271881
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2206.病原生物变异与耐药
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

To evaluate the possibility of dissemination of the NDM-1-encoding gene (blaNDM-1) in enterobacter strains based on CTX-M-15-encoding epidemic plasmid databases. The information of resistance and the backbone area in plasmid were studied with reverse line blot assay (RLB), gene cloning and shotgun method, and identification of plasmids by PCR-based replicon typing. To construct the plasmid multilocus sequence typing (pMLST) method and learn the complete sequence of IncFII,IncA/C and IncL/M type plasmid habouring blaCTX-M-15,respectively. To learn genetic relationship between the plasmid habouring blaCTX-M-15 and the plasmid habouring blaNDM-1 published in PUBMED. Fitness cost of plasmid carriage was performed with competition test to count growth rates of blaCTX-M-15 or/and blaNDM-1 transformant of E.coli.
以本实验室分离携blaNDM-1的阴沟肠杆菌QT11的质粒为切入点,运用酶切克隆和鸟枪法获得质粒耐药区和骨干区序列信息。利用前期获得临床分离菌携blaCTX-M-15质粒,分析其不相容群,并针对IncFII、IncA/C和IncL/M型,利用反向线性杂交方法,分析质粒的耐药区基因结构;利用genebank已有这3个不相容群质粒全序列数据库,设计特异引物,筛选质粒骨干区看家基因,构建质粒MLST方法,了解blaCTX-M-15质粒间内在联系,构建blaCTX-M-15质粒数据库。将blaCTX-M-15数据库与QT11质粒及其它公布携blaNDM-1质粒全序列进行比较,了解两者间的遗传背景关系。根据质粒不相容群原理,将携blaCTX-M-15的IncFII质粒与携blaNDM-1的IncA/C质粒导入工程菌DH5a,研究质粒在宿主菌中的适应性代价。预测blaNDM-1在肠杆菌中传播的可能性.

结项摘要

本项目是基于4年前我国出现对碳青霉烯耐药的金属酶NDM-1,根据国外相关报道,利用质粒生物学理论,预测我国NDM-1未来的发生和流行趋势。按照计划书要求,完成了我国CTX-M型ESBL和NDM-1型碳青霉烯水解酶的分子流行病学及传播机制研究。发现CTX-M-14一直是我国最常见的ESBL,而可水解头孢他定的CTX-M-15在近年正演变为其变异体CTX-M-55,成为仅次于CTX-M-14的常见ESBL. IncFII质粒PC15-K(genebank ID: HQ202266)是介导CTX-M-15传播的主要载体,而IncI1/ST16和质粒IncF/F18:A-:B1共同介导了CTX-M-55在我国多省市的传播。NDM-1型碳青霉烯水解酶基因主要通过质粒IncX3传播。与申报计划不同的是, blaNDM-1并未携带CTX-M-15或CTX-M-55基因,也未发现IncX3质粒与携blaCTX-M-15或CTX-M-55的质粒共存菌株。结合试验与竞争性试验发现,双质粒转化C600的频率明显低于单质粒;但转化成功的双质粒接合菌C1527+J330和单质粒的接合菌C1527和J330均表现出适应性优势,尤其是C1527+J330表现更为突出,似乎更有利于质粒的广泛传播。但蜡蛾试验发现两个质粒接合菌的毒力低于单质粒接合菌。.结合IncX3和IncF质粒多见于食源性动物株的特点,本研究认为我国blaNDM-1可借助质粒在肠杆菌(尤其是大肠埃细菌)传播,但与bla CTX-M的传播并无直接相关性,由于菌株携带blaNDM-1质粒后的毒力水平下降,并未形成优势感染株,但因质粒对菌株并未出现适度性代价,使菌株在环境中易于存在。这个结论可基本解释我国目前blaNDM-1临床感染分离株一直存散发状态,未形成大规模流行的流行病学现状。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
产NDM-1酶肠杆菌科细菌的耐药机制和其感染的临床研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中华临床感染病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    卓超
  • 通讯作者:
    卓超
Prevalence of ST1193 clone and IncI1/ST16 plasmid in Escherichia coli isolates carrying blaCTX-M-55 gene from patients with urinary tract infections in China.
中国尿路感染患者携带 blaCTX-M-55 基因的大肠杆菌中 ST1193 克隆和 IncI1/ST16 质粒的流行情况。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Sci report
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    卓超
  • 通讯作者:
    卓超
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    第三军医大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    卓超
  • 通讯作者:
    卓超

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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