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胃癌相关血浆circRNA标志物的筛选及RT-ddPCR同时定量检测血浆hsa_circ_0001017和hsa_circ_0061276方法的建立

批准号:
81772279
项目类别:
面上项目
资助金额:
52.0 万元
负责人:
郭俊明
依托单位:
学科分类:
分子生物学检验
结题年份:
2021
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
孙伟亮、张新军、杜艳涛、郁芮、廖奇、葛嘉欣、李田文、谢依、朱林文

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
环状RNA(circRNA)在肿瘤发生发展过程中起重要作用,而它们的结构高稳定特性使其在作为新型肿瘤标志物方面呈现优势。课题组最近筛选出一些胃癌相关circRNA,并经细胞实验发现hsa_circ_0001017和hsa_circ_0061276调控胃癌发生。由于血浆是最常用的临床检验标本,而逆转录-微滴数字PCR(RT-ddPCR)技术具有灵敏度高、干扰少、绝对定量等优点,特别适用于检测血浆RNA类标志物。为此,本课题将优化扩增片段大小和引物浓度,建立RT-ddPCR同时定量检测血浆hsa_circ_0001017和hsa_circ_0061276的方法;分析影响血浆circRNA稳定性的因素;比较健康人、良性胃病、胃癌前病变、早期胃癌和晚期胃癌等5组人血浆hsa_circ_0001017和hsa_circ_0061276拷贝数的变化规律,分析其诊断价值,希望提高胃癌的非创性诊断水平。
英文摘要
Circular RNAs (circRNAs) play important roles in the occurrence and development of tumors. The property of structural stable makes circRNAs advantage as a new type of tumor markers. Recently, our group screened some gastric cancer-associated circRNAs and found that hsa_circ_0001017 and hsa_circ_0061276 regulated gastric cancer occurrence. Since that plasma is the most commonly used sample in laboratory medicine; and that reverse transcription-droplet digital polymerase chain reaction (RT-ddPCR) is more suitably used in the detection of plasma RNA-typed markers for its advantages such as high sensitivity, less interference, and absolutely quantitative detection, in this study, we will optimize the size of amplified fragments and primers' concentrations; establish a simultaneously quantitative method of plasma hsa_circ_0001017 and hsa_circ_0061276; analyze the factors that affect the stability of plasma circRNAs; compare the copy changes of plasma hsa_circ_0001017 and hsa_circ_0061276 among health controls, patients with benign gastric cancer, gastric precancerous lesion, early gastric cancer and advantaged gastric cancer; and finally analyze their diagnostic values. The study may improve the non-invasive diagnostic levels of gastric cancer.
环状RNA(circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性RNA分子。近年来研究表明,circRNA的异常表达可导致肿瘤的发生,而它们是否可作为标志物用于肿瘤的诊断、特别是它们与胃癌的关系在本课题立项之前尚未明确。. 本课题的主要内容包括:(1)采用circRNA芯片筛选出胃癌患者血浆中与癌细胞中同步变化的circRNA;确定胃癌相关circRNA。(2)通过优化扩增片段大小和引物浓度,建立RT-ddPCR技术同时绝对定量地检测血浆hsa_circ_0001017和hsa_circ_0061276的方法。证明常规贮存条件可否满足临床检验要求和外泌体是否对circRNA具有保护作用。(3)通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线,确定血浆hsa_circ_0001017和hsa_circ_0061276在胃癌辅助诊断中的临床价值。. 本课题首次揭示了胃癌相关circRNA的表达谱,筛选得到17种在胃癌组织和血浆中同步变化的circRNA。设计了用于染料法RT-ddPCR的特异性引物,优化了引物浓度的配比,错开扩增片段大小50bp左右,发现hsa_circ_0001017、hsa_circ_0061276和GAPDH能够在同一个反应中被有效区分并同时定量检测,节省了临床检测试剂和时间,为临床检验血浆样本中circRNA的定量检测提供了新方法。证实了胃癌细胞可通过外泌体将circRNA释放至细胞外。证明常规贮存温度和贮存时间对血浆circRNA的稳定性影响不明显。血浆hsa_circ_0001017在区分早期胃癌患者和健康人时,具备较高的早期诊断价值。随着正常胃黏膜发展成慢性萎缩性胃炎-胃溃疡-胃黏膜异型增生-早期-晚期胃癌,血浆中hsa_circ_0001017的绝对拷贝数逐步降低。同时发现,血浆hsa_circ_0061276拷贝数在健康人、早癌组和进展期胃癌组中呈现逐渐降低的趋势。. 本课题揭示了胃癌相关circRNA的表达谱,明确了血浆hsa_circ_0001017和hsa_circ_0061276在胃癌辅助诊断中的价值,对于提高胃癌的诊治水平做出一些贡献。共发表论文8篇,国内学术会议报告4篇,培养研究生3名。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Biological roles and potential clinical values of circular RNAs in gastrointestinal malignancies.
环状RNA在胃肠道恶性肿瘤中的生物学作用和潜在临床价值
DOI: 10.20892/j.issn.2095-3941.2020.0348
发表时间: 2021-03-12
期刊: Cancer biology & medicine
影响因子: 5.5
作者: [Tao X, Shao Y, Yan J, Yang L, Ye Q, Wang Q, Lu R, Guo J]
通讯作者: Guo J
Downregulated Expression of hsa_circ_0005556 in Gastric Cancer and Its Clinical Significance
hsa_circ_0005556在胃癌中的表达下调及其临床意义
DOI: 10.1155/2019/2624586
发表时间: 2019-11
期刊: Disease Markers
影响因子: --
作者: [Yang Liangwei, Yu Yu, Yu Xiuchong, Zhou Jiaming, Zhang Zhiping, Ying Shibo, Guo Junming, Yan Zhilong]
通讯作者: Yan Zhilong
Identification of hsa_circ_0005654 as a new early biomarker of gastric cancer
鉴定 hsa_circ_0005654 作为胃癌新的早期生物标志物
DOI: 10.3233/cbm-190561
发表时间: 2019-01-01
期刊: CANCER BIOMARKERS
影响因子: 3.1
作者: [Wang, Yezhao, Xu, Suyuan, Guo, Junming]
通讯作者: Guo, Junming
DOI: 10.1080/17474124.2020.1715211
发表时间: 2020
期刊: Expert Review of Gastroenterology & Hepatology
影响因子: 3.9
作者: [Ruan Yao, Li Zhe, Shen Yijing, Li Tianwen, Zhang Haiyan, Guo Junming]
通讯作者: Guo Junming
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    tRF-30-87R8WP9N1EWJ作为新的胃癌标志物及其通过下调CDK5R2表达抑制胃癌细胞增殖和转移的机制研究
    • 批准号:
      82372333
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      48万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      郭俊明
    • 依托单位:
    tRF-5026a作为胃癌新型诊断标志物的价值及其作用机制研究
    • 批准号:
      81974316
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      55.0万元
    • 批准年份:
      2019
    • 负责人:
      郭俊明
    • 依托单位:
    长链非编码RNA影响胃癌发生的机制研究及其诊断价值分析
    • 批准号:
      81171660
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      58.0万元
    • 批准年份:
      2011
    • 负责人:
      郭俊明
    • 依托单位:
    胃癌相关piRNA的鉴定及其诊断价值分析
    • 批准号:
      30872420
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      31.0万元
    • 批准年份:
      2008
    • 负责人:
      郭俊明
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金