拟南芥染色体重塑酶BRAHMA相互作用蛋白 BRIP1/2调节植物发育的分子机理研究
批准号:
31870289
项目类别:
面上项目
资助金额:
60.0 万元
负责人:
李陈龙
依托单位:
学科分类:
植物生殖与发育
结题年份:
2022
批准年份:
2018
项目状态:
已结题
项目参与者:
俞尧光、徐建区、梁振威、阮九霄、宋欣
中文摘要
染色体重塑复合体通过改变染色质结构来调节基因转录,确保细胞内各种生物学过程的正确运行。和其它真核生物类似,植物染色体重塑蛋白通过调节相关靶基因的表达来控制植物的发育,然而其识别靶基因的分子机理依然不清楚。申请人前期的研究发现植物SWI/SNF染色体重塑酶BRAHMA(BRM)对靶基因的识别部分依赖于组蛋白去甲基化酶REF6,暗示还有其它未知的因子参与对BRM的招募。通过对我们前期BRM免疫沉淀蛋白质谱数据的分析,我们获得了2个全新的同源的BRM相互作用蛋白BRM Interacting Protein 1 (BRIP1)和BRIP2。本项目拟通过综合运用分子生物学、遗传学、表观遗传组学等手段,系统研究BRIP1/2在植物SWI/SNF染色体重塑复合体中所起的角色,阐明它们是否以及如何影响SWI/SNF复合体的装配及对靶基因的识别,解析它们在调节开花时间上的作用机理。
英文摘要
Chromatin remodelling complexes regulate gene transcription activity by changing the structure of chromatin, which in turn assures the proper biological function in eukaryote cells. Similar to other eukaryotes, plant chromatin remodelling complexes mediate plant development through regulating the transcription of target genes, however, the molecular mechanisms by which they recognize target genes are still unclear. Our previous work demonstrated that the binding of plant SWI/SNF chromatin remodelling complex to DNA partially depends on histone demethylase REF6, suggesting that other unknown factors are also involved in recruiting BRM. Through analyzing our previously published BRM immunoprecipitation-mass spectrometry data, we have identified two novel BRM Interacting Protein 1 (BRIP1) and BRIP2. In this proposal, we propose to combine molecular biology, genetics, and epigenomics to investigate the roles of BRIP1/2 in plant SWI/SNF complexes, uncover whether and how they affect the assemble of SWI/SNF complex and the recognition of the complex to its target genes, reveal the functional roles of the complex in regulating flowering time.
染色体重塑复合体通过改变染色质结构来调节基因转录,确保细胞内各种生物学过程的正确运行。和其它真核生物类似,植物染色体重塑蛋白通过调节相关靶基因的表达来控制植物的发育,然而其识别靶基因的分子机理依然不清楚。本项目前期的研究发现植物SWI/SNF染色体重塑酶BRAHMA(BRM)对靶基因的识别部分依赖于组蛋白去甲基化酶REF6,暗示还有其它未知的因子参与对BRM的招募。通过对我们前期BRM免疫沉淀蛋白质谱数据的分析,获得了多个全新的同源的BRM相互作用蛋白。本项目通过综合运用分子生物学、遗传学、表观遗传组学等手段,系统研究这些新亚基在植物SWI/SNF染色体重塑复合体中所起的角色,阐明它们是否以及如何影响SWI/SNF复合体的装配及对靶基因的识别,解析它们在调节植物发育包括开花时间上的作用机理。本项目发现了植物染色体重塑复合体组装的新亚基,对解析其组装机制奠定的基础。相关数据发表在Nature Plants上,本项目是第一标注。另外,本项目还发现了植物中SWI/SNF复合物的三个新核心亚基(BRD1,BRD2和BRD13),并揭示了这些亚基在帮助植物SWI/SNF复合物在全基因组上去结合靶基因的相关分子机理,为理解植物SWI/SNF复合体的研究提供了重要的参考价值。相关数据发表在Molecular Plant上,本项目是第二标注。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:
10.1016/j.molp.2021.03.018
发表时间:
2021-03
期刊:
Molecular plant
影响因子:
27.5
作者:
[Yaoguang Yu;Wei Fu;Jianqu Xu;Y. Lei;Xin Song;Zhenwei Liang;Tao Zhu;Yuhui Liang;Yuanhao Hao;Liangbing Yuan;Chenlong Li]
通讯作者:
Yaoguang Yu;Wei Fu;Jianqu Xu;Y. Lei;Xin Song;Zhenwei Liang;Tao Zhu;Yuhui Liang;Yuanhao Hao;Liangbing Yuan;Chenlong Li
BRAHMA-interacting proteins BRIP1 and BRIP2 are core subunits of Arabidopsis SWI/SNF complexes
BRAHMA 相互作用蛋白 BRIP1 和 BRIP2 是拟南芥 SWI/SNF 复合物的核心亚基
DOI:
10.1038/s41477-020-0734-z
发表时间:
2020-08
期刊:
Nature Plants
影响因子:
18
作者:
[Yu Yaoguang, Liang Zhenwei, Song Xin, Fu Wei, Xu Jianqu, Lei Yawen, Yuan Liangbing, Ruan Jiuxiao, Chen Chen, Fu Wenqun, Cui Yuhai, Huang Shangzhi, Li Chenlong]
通讯作者:
Li Chenlong
组蛋白乙酰化酶HAC1调控植物开花的分子机制研究
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批准号:--
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项目类别:省市级项目
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资助金额:15.0万元
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批准年份:2024
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负责人:李陈龙
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依托单位:
染色体重塑酶PICKLE抑制种子成熟基因表达的分子机制解析
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:54万元
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批准年份:2022
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负责人:李陈龙
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依托单位:
植物SWI/SNF染色体重塑复合体新亚基的鉴定及其调控植物发育的研究
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批准号:--
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2021
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负责人:李陈龙
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依托单位:
两个新的拟南芥SWI/SNF染色体重塑复合体亚基的鉴定及其调控植物发育的机制研究
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批准号:32070212
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2020
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负责人:李陈龙
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依托单位:
国内基金
海外基金