课题基金 / 基金详情

小分子化合物作为Z-DNA探针及诱导剂的设计合成与生物活性研究

批准号:
21102108
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
田沺
依托单位:
学科分类:
生物分子的化学生物学
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
吴骏、郑小龙、吴志国、翟倩倩、徐亮、黄蓉

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
核酸在生物体内呈现极大的弯曲和柔性,能以多种不同构象存在,其中唯一一种左手双螺旋DNA,即Z-DNA的发现及相关研究是对核酸结构及功能研究的重要发展。Z-DNA由于其结构特殊,生物功能复杂多样且在体内处于不稳定状态,近期又发现Z-DNA的形成可能与癌症有关,因此关于它的研究一直是分子遗传学的热点。近年来化学遗传学的方法用于生物体研究为Z-DNA的研究带来了新的思路,小分子化合物作为探针研究Z-DNA成为新的方向。用化学的方法设计和合成小分子探针来研究DNA的二级结构成为又一种快速简便的方法。目前报道的Z-DNA的小分子探针及诱导剂仍然有限,我们希望通针对Z-DNA特有的构象,特殊的形成及稳定因素设计与Z-DNA亲合力强且立体选择性高的分子,并且通过修饰使之具备能对Z型构象诱导稳定且产生明显响应信号,从而为Z-DNA的形成,检测,调控及性质研究提供依据。
英文摘要
核酸是一类重要的生物大分子,是遗传信息的储存者和传递者。作为遗传物质,不仅仅是碱基顺序体现其功能,一些特殊的二级结构对于核酸功能的调控也有着极其重要的作用。Z-DNA是目前生物体内存在的唯一一种左手螺旋DNA,其与转录水平密切相关,对基因调控、染色体的重组、核小体的排列有着重要的作用。Z-DNA,由于其特殊的糖苷键构象和糖环构象所带来的特殊性质,使得对其结构功能的研究和调控,一直以来存在较多的挑战。尤其是对Z-DNA的诱导和稳定,长期以来,能在较低盐浓度下,对G/C交替核酸序列以外的DNA序列产生有效诱导和稳定作用的小分子化合物少有报道。本项目所设计的一个金属钌配合物在这方面有了较大突破,能在25mM NaCl 低盐浓度下诱导B-DNA向Z-DNA的转变,并且不局限于G/C交替的核酸序列。并且,我们发现此化合物在较高浓度下能进入细胞核,与细胞基因组DNA相互作用,与此同时,我们还在此钌配合物的基础上,进行了进一步的结构修饰,尝试与生物素、邻苯二酚等结构单元相连,用于交联及富集。此外,我们还研究了Z-DNA这种特殊二级结构与胞嘧啶表观遗传修饰之间的关系,发现胞嘧啶5-羟甲基化修饰会抑制B型到Z型的转化,而5-醛基化及5-羧基化胞嘧啶修饰会促进B型到Z型的转化。这个发现对DNA表观遗传修饰相关研究有重要意义。除了Z-DNA相关研究,我们还在核酸相关其他方向进行了拓展,包括设计一些新的基于核酸的探针体系,用于检测重要生物靶标。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI: 10.1039/c3cc45423a
发表时间: 2013-10
期刊: Chemical communications
影响因子: 4.9
作者: [Tian Tian-Tian;Xiaoe Zhang;Bo-Shi Fu;Yuelin Long;Shuang Peng;Shaoru Wang;Xiaoping Zhou;Xin Zhou]
通讯作者: Tian Tian-Tian;Xiaoe Zhang;Bo-Shi Fu;Yuelin Long;Shuang Peng;Shaoru Wang;Xiaoping Zhou;Xin Zhou
Systematic Investigations of Different Cytosine Modifications on CpG Dinucleotide Sequences: The Effects on the B‑Z Transition
CpG 二核苷酸序列上不同胞嘧啶修饰的系统研究:对 B-Z 转变的影响
DOI: 10.1021/ja4107012
发表时间: 2014
期刊: J. Am. Chem. Soc.
影响因子: --
作者: [Shaoru Wang, Yuelin Long, Jiaqi Wang, Yushu Ge, Pu Guo, Yi Liu, Tian Tian, Xiang Zhou]
通讯作者: Xiang Zhou
Review: Advances in methodology of DNA methylation assay
综述:DNA 甲基化检测方法学的进展
DOI: 10.1007/s11426-011-4318-7
发表时间: 2011-08
期刊: Science China Chemistry
影响因子: --
作者: [Tian Tian, Wang ShaoRu, Wu JianGuo, Zhou Xiang]
通讯作者: Zhou Xiang
Formation of Sequence-Independent Z-DNA Induced by a Ruthenium Complex at Low Salt Concentrations
低盐浓度下钌络合物诱导形成与序列无关的 Z-DNA
DOI: 10.1002/anie.201104422
发表时间: 2011-01-01
期刊: ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
影响因子: 16.6
作者: [Wu, Zhiguo, Tian, Tian, Zhou, Xiang]
通讯作者: Zhou, Xiang
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    寨卡病毒中特定位点G-四链RNA的结构与功能研究
    • 批准号:
      22377094
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      50万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      田沺
    • 依托单位:
    靶向核酸表观遗传修饰5-羧基胞嘧啶的功能揭示与可逆调控研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      60万元
    • 批准年份:
      2021
    • 负责人:
      田沺
    • 依托单位:
    可调控CRISPR-Cas系统发展及用于核酸表观遗传修饰动态调控研究
    • 批准号:
      91853119
    • 项目类别:
      重大研究计划
    • 资助金额:
      60.0万元
    • 批准年份:
      2018
    • 负责人:
      田沺
    • 依托单位:
    RNA G-四链体在丙肝病毒中的功能研究及G-四链体稳定剂作为活性HCV抑制剂的筛选
    • 批准号:
      21572169
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      65.0万元
    • 批准年份:
      2015
    • 负责人:
      田沺
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金