小分子化合物作为Z-DNA探针及诱导剂的设计合成与生物活性研究

批准号:
21102108
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
田沺
依托单位:
学科分类:
B0702.生物分子的化学生物学
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
吴骏、郑小龙、吴志国、翟倩倩、徐亮、黄蓉
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中文摘要
核酸在生物体内呈现极大的弯曲和柔性,能以多种不同构象存在,其中唯一一种左手双螺旋DNA,即Z-DNA的发现及相关研究是对核酸结构及功能研究的重要发展。Z-DNA由于其结构特殊,生物功能复杂多样且在体内处于不稳定状态,近期又发现Z-DNA的形成可能与癌症有关,因此关于它的研究一直是分子遗传学的热点。近年来化学遗传学的方法用于生物体研究为Z-DNA的研究带来了新的思路,小分子化合物作为探针研究Z-DNA成为新的方向。用化学的方法设计和合成小分子探针来研究DNA的二级结构成为又一种快速简便的方法。目前报道的Z-DNA的小分子探针及诱导剂仍然有限,我们希望通针对Z-DNA特有的构象,特殊的形成及稳定因素设计与Z-DNA亲合力强且立体选择性高的分子,并且通过修饰使之具备能对Z型构象诱导稳定且产生明显响应信号,从而为Z-DNA的形成,检测,调控及性质研究提供依据。
英文摘要
核酸是一类重要的生物大分子,是遗传信息的储存者和传递者。作为遗传物质,不仅仅是碱基顺序体现其功能,一些特殊的二级结构对于核酸功能的调控也有着极其重要的作用。Z-DNA是目前生物体内存在的唯一一种左手螺旋DNA,其与转录水平密切相关,对基因调控、染色体的重组、核小体的排列有着重要的作用。Z-DNA,由于其特殊的糖苷键构象和糖环构象所带来的特殊性质,使得对其结构功能的研究和调控,一直以来存在较多的挑战。尤其是对Z-DNA的诱导和稳定,长期以来,能在较低盐浓度下,对G/C交替核酸序列以外的DNA序列产生有效诱导和稳定作用的小分子化合物少有报道。本项目所设计的一个金属钌配合物在这方面有了较大突破,能在25mM NaCl 低盐浓度下诱导B-DNA向Z-DNA的转变,并且不局限于G/C交替的核酸序列。并且,我们发现此化合物在较高浓度下能进入细胞核,与细胞基因组DNA相互作用,与此同时,我们还在此钌配合物的基础上,进行了进一步的结构修饰,尝试与生物素、邻苯二酚等结构单元相连,用于交联及富集。此外,我们还研究了Z-DNA这种特殊二级结构与胞嘧啶表观遗传修饰之间的关系,发现胞嘧啶5-羟甲基化修饰会抑制B型到Z型的转化,而5-醛基化及5-羧基化胞嘧啶修饰会促进B型到Z型的转化。这个发现对DNA表观遗传修饰相关研究有重要意义。除了Z-DNA相关研究,我们还在核酸相关其他方向进行了拓展,包括设计一些新的基于核酸的探针体系,用于检测重要生物靶标。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1039/c3cc45423a
发表时间:2013-10
期刊:Chemical communications
影响因子:4.9
作者:Tian Tian-Tian;Xiaoe Zhang;Bo-Shi Fu;Yuelin Long;Shuang Peng;Shaoru Wang;Xiaoping Zhou;Xin Zhou
通讯作者:Tian Tian-Tian;Xiaoe Zhang;Bo-Shi Fu;Yuelin Long;Shuang Peng;Shaoru Wang;Xiaoping Zhou;Xin Zhou
Systematic Investigations of Different Cytosine Modifications on CpG Dinucleotide Sequences: The Effects on the B‑Z Transition
CpG 二核苷酸序列上不同胞嘧啶修饰的系统研究:对 B-Z 转变的影响
DOI:10.1021/ja4107012
发表时间:2014
期刊:J. Am. Chem. Soc.
影响因子:--
作者:Shaoru Wang;Yuelin Long;Jiaqi Wang;Yushu Ge;Pu Guo;Yi Liu;Tian Tian;Xiang Zhou
通讯作者:Xiang Zhou
Review: Advances in methodology of DNA methylation assay
综述:DNA 甲基化检测方法学的进展
DOI:10.1007/s11426-011-4318-7
发表时间:2011-08
期刊:Science China Chemistry
影响因子:--
作者:Tian Tian;Wang ShaoRu;Wu JianGuo;Zhou Xiang
通讯作者:Zhou Xiang
Formation of Sequence-Independent Z-DNA Induced by a Ruthenium Complex at Low Salt Concentrations
低盐浓度下钌络合物诱导形成与序列无关的 Z-DNA
DOI:10.1002/anie.201104422
发表时间:2011-01-01
期刊:ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
影响因子:16.6
作者:Wu, Zhiguo;Tian, Tian;Zhou, Xiang
通讯作者:Zhou, Xiang
Advancements in Z-DNA: Development of Inducers and Stabilizers for B to Z Transition
Z-DNA 的进展:B 到 Z 转变的诱导剂和稳定剂的开发
DOI:--
发表时间:2012
期刊:Current Medicinal Chemistry
影响因子:4.1
作者:Yang, L.;Wang, S.;Tian, T.;Zhou, X.
通讯作者:Zhou, X.
寨卡病毒中特定位点G-四链RNA的结构与功能研究
- 批准号:22377094
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:50万元
- 批准年份:2023
- 负责人:田沺
- 依托单位:
靶向核酸表观遗传修饰5-羧基胞嘧啶的功能揭示与可逆调控研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:60万元
- 批准年份:2021
- 负责人:田沺
- 依托单位:
可调控CRISPR-Cas系统发展及用于核酸表观遗传修饰动态调控研究
- 批准号:91853119
- 项目类别:重大研究计划
- 资助金额:60.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:田沺
- 依托单位:
RNA G-四链体在丙肝病毒中的功能研究及G-四链体稳定剂作为活性HCV抑制剂的筛选
- 批准号:21572169
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:田沺
- 依托单位:
G-四链体交联剂的设计合成及其用于G-四链体相关蛋白的钓取和功能研究
- 批准号:21372182
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2013
- 负责人:田沺
- 依托单位:
国内基金
海外基金
