中国人群非小细胞肺癌发生发展的全基因组关联分析

批准号:
81270044
项目类别:
面上项目
资助金额:
70.0 万元
负责人:
马红霞
依托单位:
学科分类:
H3010.非传染病流行病学
结题年份:
2016
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
胡铃敏、秦真真、姜杰、陈佳萍
国基评审专家1V1指导 中标率高出同行96.8%
结合最新热点,提供专业选题建议
深度指导申报书撰写,确保创新可行
指导项目中标800+,快速提高中标率
微信扫码咨询
中文摘要
在青年科学基金项目资助下(批准号:30901233),采用大样本的分子流行病学研究设计检测了15q25区段多个标签SNPs的基因型,建立了相应的与肺癌发生发展相关的基因SNPs 谱及预测模型;在此基础上,密切关注国内外全基因组关联研究(GWAS)的进展,参与了中国首个肺癌GWAS,并应用相关数据对于15q25区域的遗传变异与中国人群肺癌的关联进行了更深入的探讨;此外,探讨了多个通路的基因SNPs与肺癌发生发展的关系,发现了多个SNPs可影响非小细胞肺癌患者的预后。已发表基金标注的SCI论文3篇,投稿1篇。后续项目拟在前期研究成果的基础上,结合首个中国人群的肺癌GWAS数据及临床治疗/预后信息收集,进行中国人群非小细胞肺癌发生发展的全基因组关联分析,以期发现中国人群非小细胞肺癌发生发展的特定标志物,并进行相关SNPs的功能研究,阐述其影响肺癌发生发展的生物学机制。
英文摘要
Our research funded by the National Nature Science Funds of China (Grant No. 30901233) completed the genotyping of tagging SNPs in 15q25 with a design of molecular epidemiology and identified some SNPs associated with lung cancer risk. We also attended the first genome-wide association study of lung cancer in China and did a more in-depth discussion for other genetic variants in 15q25 and lung cancer. Furthermore, we examined the associations between SNPs involved in several biological pathways and the development of lung cancer. Until now, we have published 3 papers and submitted one, which were all fund by the National Nature Science Funds of China (Grant No. 30901233). To extend the research on the development of lung cancer, we will conducted a genome-wide analysis for the development of non-small cell lung cancer in Chinese population on the basis of preliminary research progress and clinical/following-up information of patients. The aim of the study is to find the special biomarkers for non-small cell lung cancer (NSCLC) in China, discuss the difference of biomarkers in patients with different characteristics and determine the biological function of SNPs in the development of NSCLC.
本研究系统整合全基因组遗传变异、临床预后和化疗毒副反应等数据,围绕遗传变异与中国人群非小细胞肺癌(NSCLC)发生发展以及治疗预后的关联及相应的生物学机制等开展了系列研究,创新性地发现了一批与非小细胞肺癌发生发展相关的遗传位点,鉴定了晚期肺癌患者临床预后以及化疗毒副反应相关的多个遗传变异,并通过功能学实验阐明了多个遗传变异可通过影响相关位点的甲基化水平、调控基因/miRNA表达而影响肺癌患者的预后。上述研究结果已发表基金标注SCI论文12篇,累计影响因子(IF)为59.7,其中IF>5的6篇。本研究发现了与我国人群肺癌临床预后相关的生物标志物,可将其用于患者的预后预测,对今后肺癌的个体化治疗及预后改善等均具有重要的现实意义。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Genetic Variations in Key MicroRNAs are Associated With the Survival of Nonsmall Cell Lung Cancer.
关键 MicroRNA 的遗传变异与非小细胞肺癌的生存相关
DOI:10.1097/md.0000000000002084
发表时间:2015-11
期刊:Medicine
影响因子:1.6
作者:Wu S;Shen W;Pan Y;Zhu M;Xie K;Geng L;Wang Y;Liang Y;Xu J;Cao S;Xu W;Chen B;Hu Z;Ma H;Wu J;Shen H
通讯作者:Shen H
Genetic Variants at 6p21.1 and 7p15.3 Are Associated with Risk of Multiple Cancers in Han Chinese
6p21.1 和 7p15.3 的遗传变异与中国汉族患多种癌症的风险相关
DOI:10.1016/j.ajhg.2012.09.009
发表时间:2012-11-02
期刊:AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS
影响因子:9.8
作者:Jin, Guangfu;Ma, Hongxia;Shen, Hongbing
通讯作者:Shen, Hongbing
A potentially functional polymorphism in ABCG2 predicts clinical outcome of non-small cell lung cancer in a Chinese population
ABCG2 的潜在功能多态性可预测中国人群非小细胞肺癌的临床结果
DOI:10.1038/tpj.2016.2
发表时间:2016-03
期刊:PHARMACOGENOMICS JOURNAL
影响因子:2.8
作者:Sun J.;Zhu M.;Shen W.;Wang C.;Dai J.;Xu L.;Jin G.;Hu Z.;Ma H.;Shen H.
通讯作者:Shen H.
DOI:10.1158/1078-0432.ccr-12-1202
发表时间:2012-10-01
期刊:Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
影响因子:--
作者:Hu L;Wu C;Zhao X;Heist R;Su L;Zhao Y;Han B;Cao S;Chu M;Dai J;Dong J;Shu Y;Xu L;Chen Y;Wang Y;Lu F;Jiang Y;Yu D;Chen H;Tan W;Ma H;Chen J;Jin G;Wu T;Lu D;Christiani DC;Lin D;Hu Z;Shen H
通讯作者:Shen H
Genome-wide association study of myelosuppression in non-small-cell lung cancer patients with platinum-based chemotherapy
铂类化疗非小细胞肺癌患者骨髓抑制的全基因组关联研究
DOI:10.1038/tpj.2015.22
发表时间:2016-02-01
期刊:PHARMACOGENOMICS JOURNAL
影响因子:2.8
作者:Cao, S.;Wang, S.;Shen, H.
通讯作者:Shen, H.
血浆支链氨基酸代谢物与肺癌发生风险的关联及机制研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:52万元
- 批准年份:2022
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
增强子及其遗传变异在肺癌发生中的作用及机制研究
- 批准号:81973123
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
槟榔相关口腔癌致病基因的鉴定及其机制研究
- 批准号:81773525
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2017
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
驱动基因遗传变异与头颈部鳞癌的分子流行病学研究
- 批准号:81473048
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
染色体15q25区段遗传多态与肺癌易感性的分子流行病学研究
- 批准号:30901233
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:20.0万元
- 批准年份:2009
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
国内基金
海外基金
