染色体15q25区段遗传多态与肺癌易感性的分子流行病学研究

批准号:
30901233
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
20.0 万元
负责人:
马红霞
依托单位:
学科分类:
H3010.非传染病流行病学
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
钱志英、易洪刚、张鸣凤、陈维、钮菊英
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中文摘要
肺癌的发生是环境和遗传因素共同作用的结果,但确切的遗传变异尚不明确。来自欧美的最新全基因组关联研究发现染色体15q25区段的多个遗传多态(SNPs)可能是肺癌的重要易感标志,但多态性频率与中国人群不同。本研究以此为依据,借助人类单倍型数据库(Hapmap)和中通量基因型检测技术以及其它先进的分子生物学方法,采用大样本的病例对照研究深入探讨①染色体15q25区段的遗传多态(SNPs)单独或联合与中国人群肺癌易感性的关联;②基因-基因交互作用,基因与环境暴露(如不同吸烟状态)之间的交互作用;③该区段相关基因(如CHRNA3,CHRNA5和CHRNB4)功能性SNP位点的生物学功能(如调控基因表达和蛋白结构、功能等)。
英文摘要
本研究采用大样本的分子流行病学研究设计,通过SNPstream及Illuminia等中高通量基因分型技术检测了15q25区段多个标签SNPs的基因型,发现了该区域存在多个多态性可影响中国人群肺癌易感性的关联,建立了相应的与肺癌发生发展相关的基因SNPs 谱及预测模型。在此基础上,还密切关注国内外全基因组关联研究(GWAS)的进展,参与了中国首个肺癌GWAS,并结合和应用相关数据对于15q25区域的遗传变异与中国人群肺癌易感性的关联进行了更深入的探讨;此外,通过项目所收集的肺癌人群样本,结合随访信息的收集,对多个通路(如细胞周期调控通路、趋化因子家族等)的基因SNPs与肺癌发生发展的关系进行了探讨,发现多个遗传变异可影响肺癌的死亡风险。研究成果有望用于筛选肺癌高危人群或易感个体,预测肺癌患者的预后,对于深入阐释肺癌发生发展的遗传易感机制有重要的学术价值。
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Potentially functional polymorphisms in cell cycle genes and the survival of non-small cell lung cancer in a Chinese population
中国人群细胞周期基因的潜在功能多态性与非小细胞肺癌的生存
DOI:10.1016/j.lungcan.2010.11.001
发表时间:2011-07-01
期刊:LUNG CANCER
影响因子:5.3
作者:Ma, Hongxia;Chen, Jiaping;Shu, Yongqian
通讯作者:Shu, Yongqian
Potentially functional polymorphisms in DNA repair genes and non-small-cell lung cancer survival: A pathway-based analysis
DNA 修复基因和非小细胞肺癌生存的潜在功能多态性:基于通路的分析
DOI:10.1002/mc.20819
发表时间:2012-07-01
期刊:MOLECULAR CARCINOGENESIS
影响因子:4.6
作者:Dong, Jing;Hu, Zhibin;Shen, Hongbing
通讯作者:Shen, Hongbing
DOI:--
发表时间:--
期刊:Clinical Cancer Research
影响因子:--
作者:Hu, Linmin;Chu, Minjie;Dai, Juncheng;Dong, jing;Hu, zhibin;Shen, Hongbing;Wu, Cheng;Zhao, Xueying;Rebecca Heist;Li, Su;Zhao, Yang;Ma, Hongxia;Han, Baohui;Cao, Songyu;
通讯作者:
Association analyses identify multiple new lung cancer susceptibility loci and their interactions with smoking in the Chinese population.
关联分析确定了中国人群中多个新的肺癌易感位点及其与吸烟的相互作用
DOI:10.1038/ng.2351
发表时间:2012-07-15
期刊:Nature genetics
影响因子:30.8
作者:Dong J;Hu Z;Wu C;Guo H;Zhou B;Lv J;Lu D;Chen K;Shi Y;Chu M;Wang C;Zhang R;Dai J;Jiang Y;Cao S;Qin Z;Yu D;Ma H;Jin G;Gong J;Sun C;Zhao X;Yin Z;Yang L;Li Z;Deng Q;Wang J;Wu W;Zheng H;Zhou G;Chen H;Guan P;Peng Z;Chen Y;Shu Y;Xu L;Liu X;Liu L;Xu P;Han B;Bai C;Zhao Y;Zhang H;Yan Y;Amos CI;Chen F;Tan W;Jin L;Wu T;Lin D;Shen H
通讯作者:Shen H
Polymorphisms of key chemokine genes and survival of non-small cell lung cancer in Chinese
关键趋化因子基因多态性与中国人非小细胞肺癌生存
DOI:10.1016/j.lungcan.2011.03.005
发表时间:2011-11-01
期刊:LUNG CANCER
影响因子:5.3
作者:Ma, Hongxia;Shu, Yongqian;Shen, Hongbing
通讯作者:Shen, Hongbing
血浆支链氨基酸代谢物与肺癌发生风险的关联及机制研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:52万元
- 批准年份:2022
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
增强子及其遗传变异在肺癌发生中的作用及机制研究
- 批准号:81973123
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
槟榔相关口腔癌致病基因的鉴定及其机制研究
- 批准号:81773525
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2017
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
驱动基因遗传变异与头颈部鳞癌的分子流行病学研究
- 批准号:81473048
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
中国人群非小细胞肺癌发生发展的全基因组关联分析
- 批准号:81270044
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
国内基金
海外基金
