驱动基因遗传变异与头颈部鳞癌的分子流行病学研究
批准号:
81473048
项目类别:
面上项目
资助金额:
80.0 万元
负责人:
马红霞
依托单位:
学科分类:
H3010.非传染病流行病学
结题年份:
2018
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
袁华、王涛、谢开鹏、朱猛、倪碧娴、韩静
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中文摘要
驱动基因是指在肿瘤发生发展过程中发挥重要作用的基因,其相关研究是目前肿瘤领域研究的热点。多个GWAS表明,驱动基因的生殖系遗传变异与恶性肿瘤的易感性显著相关。因此,本研究拟根据最新研究进展,针对新近发现的多个头颈部鳞癌(HNSCC)相关驱动基因,采用目标区域捕获测序技术确定其潜在功能区(包括外显子区、5'UTR、3'UTR及调控区)内包含低频位点在内的整体遗传变异图谱,检测遗传变异与HNSCC易感性的关联,随后通过大样本的病例-对照研究进行后期验证,并综合应用生物信息学和分子生物学等方法进行生物学机制研究。本课题将进一步阐明HNSCC的易感机制,并为揭示驱动基因的重要作用以及HNSCC发生的生物学机制提供新思路。
英文摘要
Driver genes are defined as those genes causally linked to oncogenesis and have become the focus of recent cancer research. The findings of several GWASs have suggested that germline variants of driver genes have significant associations with the susceptibility to human cancer. In this project, we will focus on some newly identified driver genes of squamous cell carcinomas of the head and neck(HNSCC) and use target region sequencing to investigate the associations between all genetic variants in the potentially functional regions of those genes and risk of HNSCC.Then, the positive variants will be replicated in another case-control study. In combination with bioinformatics and molecular biology methods, we plan to further evaluate the biological mechanisms of identified variants. These efforts may further clarify the susceptibility to HNSCC, provide new insight into the role of driver genes and the etiology of HNSCC and improve the prevention and treatment level for HNSCC.
基于头颈部鳞癌高通量检测数据以及多个独立人群的验证,发现了4个头颈部鳞癌易感性相关的驱动基因遗传变异(6p22.1的rs2517611、6p21.33的rs2524182、6p21.33的rs3131018、9p21.3的 rs1063192和9p21.3的rs1063192)。通过生物信息学分析和功能学实验,进一步阐明了上述关键遗传变异通过调控TCF19基因的表达水平,进而影响头颈部鳞癌发生发展的潜在生物学机制。此外,还通过外显子组测序技术,对113例口腔癌患者癌组织及配对血液样本进行了检测,并对显著突变进行了进一步的实验验证,研究结果既验证了既往研究发现的多个驱动基因突变(TP53, NOTCH1, FAT1, HRAS, CASP8, CDKN2A 和RASA1),同时也发现了多个新的驱动基因,如ATG2A, WEE1, DST等。研究结果可为进一步阐明头颈部鳞癌的发生机制提供一定依据,同时发现的关键遗传变异可作为潜在的生物标志物用于头颈部鳞癌高危人群的筛查,而发现的关键驱动基因可为头颈部鳞癌的靶向治疗提供更多候选靶点。
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Telomere length, genetic variants and risk of squamous cell carcinoma of the head and neck in Southeast Chinese.
中国东南地区端粒长度、遗传变异与头颈部鳞状细胞癌风险
DOI:10.1038/srep20675
发表时间:2016-02-09
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Gu Y;Yu C;Miao L;Wang L;Xu C;Xue W;Du J;Yuan H;Dai J;Jin G;Hu Z;Ma H;Shen H
通讯作者:Shen H
Effects of potentially functional polymorphisms in suppressor of cytokine signaling 3 (SOCS3) on the risk of head and neck squamous cancer
细胞因子信号传导抑制因子 3 (SOCS3) 的潜在功能多态性对头颈鳞状癌风险的影响。
DOI:10.1111/jop.12539
发表时间:2017-09-01
期刊:JOURNAL OF ORAL PATHOLOGY & MEDICINE
影响因子:3.3
作者:Hang, Dong;Yin, Yin;Ma, Hongxia
通讯作者:Ma, Hongxia
Mitochondrial DNA copy number is associated with risk of head and neck squamous cell carcinoma in Chinese population.
线粒体DNA拷贝数与中国人群头颈鳞状细胞癌的风险相关
DOI:10.1002/cam4.1452
发表时间:2018-06
期刊:Cancer medicine
影响因子:4
作者:Wang L;Lv H;Ji P;Zhu X;Yuan H;Jin G;Dai J;Hu Z;Su Y;Ma H
通讯作者:Ma H
KIT polymorphisms were associated with the risk for head and neck squamous carcinoma in Chinese population
KIT多态性与中国人群头颈鳞癌风险相关
DOI:10.1002/mc.22487
发表时间:2017-01-01
期刊:MOLECULAR CARCINOGENESIS
影响因子:4.6
作者:Hang, Dong;Yuan, Hua;Ma, Hongxia
通讯作者:Ma, Hongxia
MicroRNA-101 polymorphisms and risk of head and neck squamous cell carcinoma in a Chinese population
MicroRNA-101多态性与中国人群头颈鳞状细胞癌的风险
DOI:10.1007/s13277-015-4249-6
发表时间:2016
期刊:Tumor Biology
影响因子:--
作者:Miao Limin;Yuan Hua;Zhu Longbiao;Li Bing;Wang Ruixia;Chen Ning;Wang Lihua;Hang Dong;Du Jiangbo;Zhu Xun;Ma Hongxia;Ma Hongxia;Chen Ning;Chen N;Ma HX
通讯作者:Ma HX
血浆支链氨基酸代谢物与肺癌发生风险的关联及机制研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:52万元
- 批准年份:2022
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
增强子及其遗传变异在肺癌发生中的作用及机制研究
- 批准号:81973123
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
槟榔相关口腔癌致病基因的鉴定及其机制研究
- 批准号:81773525
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2017
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
中国人群非小细胞肺癌发生发展的全基因组关联分析
- 批准号:81270044
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
染色体15q25区段遗传多态与肺癌易感性的分子流行病学研究
- 批准号:30901233
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:20.0万元
- 批准年份:2009
- 负责人:马红霞
- 依托单位:
国内基金
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