微生物次生代谢的起源相对古老，和动物的初级代谢可能存在"功能同源性"，所以微生物次生代谢产物才可能对动物有生理活性。本项目研究以"次生代谢是生物对环境的适应机制之一，是自然选择的结果"为理论依据，开展两个方面的研究：1、植物共生放线菌多源基因组学(metagenomics)研究。建立云南美登木和滑桃树中未经纯培养放线菌的混合DNA文库；根据代谢组学的分析结果、活性筛选结果和异源探针杂交或基因组扫描结果筛选出候选质粒；结合活性和LC-ESI-MS追踪分离活性成分，进行微量成分的结构测定；确定活性成分的生物合成途径和调控机理，通过组合生物合成和定向进化(如DNA shuffling)对活性先导化合物进行结构改造。2、研究宿主植物化学成分对共生放线菌次生代谢途径的影响，从次生代谢的角度探讨植物-微生物的协同进化。本项目研究将拓宽微生物化学的研究领域，探索微生物次生代谢的起源和进化。