应用DNA甲基化芯片技术研究Dicer对CpG岛甲基化和组蛋白修饰的调节作用
批准号:
30971612
项目类别:
面上项目
资助金额:
30.0 万元
负责人:
唐开福
依托单位:
学科分类:
遗传物质结构与功能
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
王鹏飞、王波、吴进峰、曾贵利、杨梅、胡文艳、田绿
中文摘要
虽然Dicer能够在很多物种中调节DNA甲基化和组蛋白修饰,但是,Dicer能不能在哺乳动物细胞中调节DNA甲基化和组蛋白修饰,目前尚有争议。在NSFC(30700708)资助下,我们发现:虽然抑制Dicer的表达并不显著影响细胞总DNA的甲基化水平和总组蛋白的修饰,但Dicer可以在基因组的某些局部区域调节DNA甲基化和组蛋白修饰。本项目拟应用DNA甲基化芯片技术筛选DNA甲基化和组蛋白修饰受Dicer调节的CpG岛,研究哪些CpG岛能够转录出双链RNA并被Dicer切割,探索Dicer调节CpG岛甲基化和组蛋白修饰的机理:是通过含有siRNA的RITS复合物介导的,还是通过其他间接途径介导的。在此基础上,研究Dicer是否通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。
英文摘要
虽然Dicer能够在很多物种中调节DNA甲基化和组蛋白修饰,但是,Dicer能不能在哺乳动物细胞中调节DNA甲基化和组蛋白修饰,目前尚不十分清楚。本项目主要研究Dicer对CpG岛DNA甲基化和组蛋白修饰受的调节作用,并探索Dicer调节CpG岛甲基化和组蛋白修饰的机理:是通过含有siRNA的RITS复合物介导的,还是通过其他间接途径介导的。在此基础上,研究Dicer是否通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。我们发现,Dicer能够调节一些CpG岛的DNA甲基化和组蛋白修饰。但是,我们的结果提示DNA甲基化和组蛋白修饰之间不一定具有直接联系:Dicer能够调节一些CpG岛的组蛋白修饰,但并不能调节其DNA甲基化修饰。通过Solexa测序,我们发现Dicer knockdown导致的CpG岛甲基化和组蛋白修饰可能不是通过含有siRNA的RITS复合物介导的。另外,我们还发现一些内源的小RNA如来源于7SL RNA的小RNA并不能通过调节该基因的表观遗传学修饰来调节7SL RNA的转录。我们推测抑制Dicer表达导致的CpG岛DNA甲基化和组蛋白修饰改变可能是通过其他间接途径介导的,具体机理有待于进一步研究。另外,我们的结果提示Dicer能够通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。
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Dicer knockdown induces fibronectin-1 expression in HEK293T cells via induction of Egr1
Dicer 敲除通过诱导 Egr1 诱导 HEK293T 细胞中纤连蛋白-1 的表达。
DOI:
10.1016/j.bbagen.2009.11.009
发表时间:
2010-03-01
期刊:
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS
影响因子:
3
作者:
[Tang, Kai-Fu, Song, Guan-Bin, Li, Yong-Hua]
通讯作者:
Li, Yong-Hua
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
中华肝脏病杂志
影响因子:
--
作者:
[唐开福]
通讯作者:
唐开福
The role of dicer in DNA damage repair.
Dicer 在 DNA 损伤修复中的作用
DOI:
10.3390/ijms131216769
发表时间:
2012-12-07
期刊:
International journal of molecular sciences
影响因子:
5.6
作者:
[Tang KF, Ren H]
通讯作者:
Ren H
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
CSCD(已接受,待发表)
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Decreased dicer expression enhances SRP-mediated protein targeting.
Dicer 表达减少增强 SRP 介导的蛋白质靶向
DOI:
10.1371/journal.pone.0056950
发表时间:
2013
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Ren YF, Li G, Xue YF, Zhang XJ, Song YJ, Lv L, Wu J, Fang YX, Wang YQ, Shi KQ, Chen YP, Tang KF]
通讯作者:
Tang KF
共 9 条
Dicer/TGF-β/ALDOA信号轴通过调节RNA剪接和DNA损伤修复参与慢性肝炎向肝癌恶性转化
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:54.7万元
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批准年份:2021
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负责人:唐开福
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依托单位:
HBV抑制MHC I类链相关基因A(MICA)转录的分子机理研究
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批准号:30700708
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:19.0万元
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批准年份:2007
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负责人:唐开福
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依托单位:
国内基金
海外基金