应用DNA甲基化芯片技术研究Dicer对CpG岛甲基化和组蛋白修饰的调节作用
批准号:
30971612
项目类别:
面上项目
资助金额:
30.0 万元
负责人:
唐开福
依托单位:
学科分类:
C0601.遗传物质结构与功能
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
王鹏飞、王波、吴进峰、曾贵利、杨梅、胡文艳、田绿
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中文摘要
虽然Dicer能够在很多物种中调节DNA甲基化和组蛋白修饰,但是,Dicer能不能在哺乳动物细胞中调节DNA甲基化和组蛋白修饰,目前尚有争议。在NSFC(30700708)资助下,我们发现:虽然抑制Dicer的表达并不显著影响细胞总DNA的甲基化水平和总组蛋白的修饰,但Dicer可以在基因组的某些局部区域调节DNA甲基化和组蛋白修饰。本项目拟应用DNA甲基化芯片技术筛选DNA甲基化和组蛋白修饰受Dicer调节的CpG岛,研究哪些CpG岛能够转录出双链RNA并被Dicer切割,探索Dicer调节CpG岛甲基化和组蛋白修饰的机理:是通过含有siRNA的RITS复合物介导的,还是通过其他间接途径介导的。在此基础上,研究Dicer是否通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。
英文摘要
虽然Dicer能够在很多物种中调节DNA甲基化和组蛋白修饰,但是,Dicer能不能在哺乳动物细胞中调节DNA甲基化和组蛋白修饰,目前尚不十分清楚。本项目主要研究Dicer对CpG岛DNA甲基化和组蛋白修饰受的调节作用,并探索Dicer调节CpG岛甲基化和组蛋白修饰的机理:是通过含有siRNA的RITS复合物介导的,还是通过其他间接途径介导的。在此基础上,研究Dicer是否通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。我们发现,Dicer能够调节一些CpG岛的DNA甲基化和组蛋白修饰。但是,我们的结果提示DNA甲基化和组蛋白修饰之间不一定具有直接联系:Dicer能够调节一些CpG岛的组蛋白修饰,但并不能调节其DNA甲基化修饰。通过Solexa测序,我们发现Dicer knockdown导致的CpG岛甲基化和组蛋白修饰可能不是通过含有siRNA的RITS复合物介导的。另外,我们还发现一些内源的小RNA如来源于7SL RNA的小RNA并不能通过调节该基因的表观遗传学修饰来调节7SL RNA的转录。我们推测抑制Dicer表达导致的CpG岛DNA甲基化和组蛋白修饰改变可能是通过其他间接途径介导的,具体机理有待于进一步研究。另外,我们的结果提示Dicer能够通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。
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Dicer knockdown induces fibronectin-1 expression in HEK293T cells via induction of Egr1
Dicer 敲除通过诱导 Egr1 诱导 HEK293T 细胞中纤连蛋白-1 的表达。
DOI:10.1016/j.bbagen.2009.11.009
发表时间:2010-03-01
期刊:BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS
影响因子:3
作者:Tang, Kai-Fu;Song, Guan-Bin;Li, Yong-Hua
通讯作者:Li, Yong-Hua
DOI:--
发表时间:--
期刊:中华肝脏病杂志
影响因子:--
作者:唐开福
通讯作者:唐开福
The role of dicer in DNA damage repair.
Dicer 在 DNA 损伤修复中的作用
DOI:10.3390/ijms131216769
发表时间:2012-12-07
期刊:International journal of molecular sciences
影响因子:5.6
作者:Tang KF;Ren H
通讯作者:Ren H
DOI:--
发表时间:--
期刊:CSCD(已接受,待发表)
影响因子:--
作者:
通讯作者:
Decreased dicer expression enhances SRP-mediated protein targeting.
Dicer 表达减少增强 SRP 介导的蛋白质靶向
DOI:10.1371/journal.pone.0056950
发表时间:2013
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Ren YF;Li G;Xue YF;Zhang XJ;Song YJ;Lv L;Wu J;Fang YX;Wang YQ;Shi KQ;Chen YP;Tang KF
通讯作者:Tang KF
Dicer/TGF-β/ALDOA信号轴通过调节RNA剪接和DNA损伤修复参与慢性肝炎向肝癌恶性转化
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:54.7万元
- 批准年份:2021
- 负责人:唐开福
- 依托单位:
HBV抑制MHC I类链相关基因A(MICA)转录的分子机理研究
- 批准号:30700708
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:19.0万元
- 批准年份:2007
- 负责人:唐开福
- 依托单位:
国内基金
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