应用DNA甲基化芯片技术研究Dicer对CpG岛甲基化和组蛋白修饰的调节作用

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30971612
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    唐开福
  • 依托单位：
    重庆医科大学
  • 学科分类：
    C0601.遗传物质结构与功能
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

虽然Dicer能够在很多物种中调节DNA甲基化和组蛋白修饰，但是，Dicer能不能在哺乳动物细胞中调节DNA甲基化和组蛋白修饰，目前尚有争议。在NSFC（30700708）资助下，我们发现：虽然抑制Dicer的表达并不显著影响细胞总DNA的甲基化水平和总组蛋白的修饰，但Dicer可以在基因组的某些局部区域调节DNA甲基化和组蛋白修饰。本项目拟应用DNA甲基化芯片技术筛选DNA甲基化和组蛋白修饰受Dicer调节的CpG岛，研究哪些CpG岛能够转录出双链RNA并被Dicer切割，探索Dicer调节CpG岛甲基化和组蛋白修饰的机理：是通过含有siRNA的RITS复合物介导的，还是通过其他间接途径介导的。在此基础上，研究Dicer是否通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。

结项摘要

虽然Dicer能够在很多物种中调节DNA甲基化和组蛋白修饰，但是，Dicer能不能在哺乳动物细胞中调节DNA甲基化和组蛋白修饰，目前尚不十分清楚。本项目主要研究Dicer对CpG岛DNA甲基化和组蛋白修饰受的调节作用，并探索Dicer调节CpG岛甲基化和组蛋白修饰的机理：是通过含有siRNA的RITS复合物介导的，还是通过其他间接途径介导的。在此基础上，研究Dicer是否通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。我们发现，Dicer能够调节一些CpG岛的DNA甲基化和组蛋白修饰。但是,我们的结果提示DNA甲基化和组蛋白修饰之间不一定具有直接联系：Dicer能够调节一些CpG岛的组蛋白修饰，但并不能调节其DNA甲基化修饰。通过Solexa测序，我们发现Dicer knockdown导致的CpG岛甲基化和组蛋白修饰可能不是通过含有siRNA的RITS复合物介导的。另外，我们还发现一些内源的小RNA如来源于7SL RNA的小RNA并不能通过调节该基因的表观遗传学修饰来调节7SL RNA的转录。我们推测抑制Dicer表达导致的CpG岛DNA甲基化和组蛋白修饰改变可能是通过其他间接途径介导的，具体机理有待于进一步研究。另外，我们的结果提示Dicer能够通过调节CpG岛的甲基化和组蛋白修饰来调节相应蛋白编码基因的表达。

项目成果

期刊论文数量（9）
专著数量（0）
科研奖励数量（4）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Dicer knockdown induces fibronectin-1 expression in HEK293T cells via induction of Egr1
Dicer 敲除通过诱导 Egr1 诱导 HEK293T 细胞中纤连蛋白-1 的表达。
  • DOI：
    10.1016/j.bbagen.2009.11.009
  • 发表时间：
    2010-03-01
  • 期刊：
    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    Tang, Kai-Fu;Song, Guan-Bin;Li, Yong-Hua
  • 通讯作者：
    Li, Yong-Hua
长片段RNA抑制HepG2．2．1 5细胞中H B V基因的表达和复制
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中华肝脏病杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    唐开福
  • 通讯作者：
    唐开福
The role of dicer in DNA damage repair.
Dicer 在 DNA 损伤修复中的作用
  • DOI：
    10.3390/ijms131216769
  • 发表时间：
    2012-12-07
  • 期刊：
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子：
    5.6
  • 作者：
    Tang KF;Ren H
  • 通讯作者：
    Ren H
Down-regulation of Dicer in hepatocellular carcinoma
肝细胞癌中 Dicer 的下调
  • DOI：
    10.1007/s12032-010-9520-5
  • 发表时间：
    2011-09-01
  • 期刊：
    MEDICAL ONCOLOGY
  • 影响因子：
    3.4
  • 作者：
    Wu, Jin-Feng;Shen, Wei;Tang, Kai-Fu
  • 通讯作者：
    Tang, Kai-Fu
MicroRNA-34a inhibits migration and invasion of colon cancer cells via targeting to Fra-1
MicroRNA-34a 通过靶向 Fra-1 抑制结肠癌细胞的迁移和侵袭
  • DOI：
    10.1093/carcin/bgr304
  • 发表时间：
    2012-03-01
  • 期刊：
    CARCINOGENESIS
  • 影响因子：
    4.7
  • 作者：
    Wu, Jianmin;Wu, Gang;Tang, Kai-Fu
  • 通讯作者：
    Tang, Kai-Fu

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  • 作者：
    唐开福;宋关斌
  • 通讯作者：
    宋关斌

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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