水稻种子老化相关lncRNA与染色质重塑蛋白调控种子活力的作用机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31871716
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Long non-coding RNAs (lncRNAs) are widely involved in various biological processes (such as growth and development) and pathological processes (such as stress resistance) . Studies have shown that lncRNAs play an important role in aging, however, its effect on seed vigor during seed aging remains unclear. With the support of the previous national grant, we studied two aging-related lncRNAs (SARlncRNA1,2) systematically and obtained corresponding transformed rice plants. Furthermore, we identified that during seed aging, differentially expressed lncRNAs were closely associated wtih chromatin remodeling factors (Os01g0636700, protein CHROMATIN REMODELING24). Therefore, this study will focus on the interaction of SARlncRNAs and chromatin remodeling factors to affect seed vigor. Through the combination of genetics, molecular biology and bioinformatics, we will continue to screen and identify the characteristics of SARlncRNA transgenic homozygous mutants, carry out function-gained and function-lost studies to explore the potential role of chromatin remodeling factors in seed vigor, thus eventually elucidating the molecular mechanism of how SARlncRNAs and protein chromatin remodeling 24 concerted regulate seed vigor. This study should enrich and expand the understanding of plant lncRNA functions, and help reveal the molecular mechanism related to the change of rice seed vigor, which is of great significance for improving seed vigor with genetic engineering. and monitoring seed quality.
长链非编码RNA(lncRNA)广泛参与生物的生长发育、抗逆、生理和病理过程,与老化密切相关,但在作物种子老化与活力保持的研究尚无报道。我们前期对2条种子老化相关lncRNA(SARlncRNA1,2)进行了研究,并创制获得了遗传转化材料;而且发现种子活力下降过程的差异lncRNA与染色质重塑蛋白有密切关系。因此本研究将聚焦于SARlncRNA与染色质重塑蛋白在调控种子老化过程活力变化的功能。我们通过遗传学、分子生物学和生物信息学相结合的方法,在继续筛选并观察SARlncRNA转基因纯合突变材料的性状基础上,开展功能获得性研究和功能缺失性研究确证染色质重塑蛋白OsPCHR24与种子活力变化的关系,进而研究lncRNA与染色质重塑蛋白共同作用调控种子活力的机制。该工作将有助于丰富人们对植物lncRNA功能的认识,有助于完善种子活力保持与寿命调控机制,有助于水稻分子育种。

结项摘要

长链非编码RNA(lncRNA)广泛参与生物的生长发育、抗逆、生理和病理过程,与老化密切相关,但在作物种子老化与活力保持方面的研究报道罕见。我们在前期研究基础上,开展了水稻长链非编码lncRNA、水稻染色质重塑蛋白、组蛋白修饰酶调控水稻种子活力的分子机制研究。研究发现水稻长链非编码lncRNA565参与种子活力的调控;lncRNA565具有很强的组织表达特异性,在授粉后25 d的胚表达量最高;lncRNA565在基因敲除突变体中显著下调表达,其种子发芽率较野生型高。进一步发现ZOS1-22是lncRNA565的共定位基因, ZOS1-22和lncRNA565在人工老化过程中的表达模式相似,ZOS1-22的表达可能受到lncRNA565调控。研究证实水稻染色质重塑蛋白OsBRM参与种子活力调控过程,水稻OsBRM T-DNA插入突变体经人工老化10天后种子发芽率显著低于野生型水稻。在研究水稻lncRNA与染色质重塑蛋白调控种子活力时的协同作用机制时,我们发现水稻组蛋白修饰酶在调控种子活力中也有重要作用。发现组蛋白去乙酰化OsHDT701负调控水稻种子寿命,OsHDT701基因可用于提高作物种子寿命。发现野生型与组蛋白去甲基化酶OsJMJ718过表达及突变体的种子活力有差异。研究还发现具有修复DNA损伤功能的水稻OsPARP1与种子活力有关,还影响到水稻结实率。.项目期间项目负责人以通讯作者(含共通讯)发表已标注相关论文10篇(SCI 7篇)。项目期间新申请专利3件,获得授权发明专利7件。本项目已培养硕士3名,博士2名。.本项目有助于丰富人们对植物lncRNA功能的认识,有助于完善种子活力调控机制,有助于提升水稻的种子活力及种子质量。以本项目揭示的种子活力调控新机理为指导,以发明专利相应产品为载体,研发的种子活力提升关键技术,2021年和2022年连续2年被评为广东省农业主推技术。“作物种子质量调控关键技术研发与应用”成果获2021年广东省农业科学院科技奖一等奖。成果转化推广可提高种子质量与市场竞争力,增加农民收入,促进现代种业健康发展。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(7)
Poly ADP-ribose polymerase-1 promotes seed-setting rate by facilitating gametophyte development and meiosis in rice (Oryza sativa L.).
聚 ADP-核糖聚合酶-1 通过促进水稻 (Oryza sativa L.) 配子体发育和减数分裂来提高结实率。
  • DOI:
    10.1111/tpj.15344
  • 发表时间:
    2021-05
  • 期刊:
    The Plant journal : for cell and molecular biology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xiumei Li;Yixin Zhang;Qinjian Liu;Songquan Song;Jun Liu
  • 通讯作者:
    Jun Liu
细胞分裂素调控种子发育、休眠与萌发的研究进展
  • DOI:
    10.11983/cbb20141
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    植物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    宋松泉;刘军;杨华;张文虎;张琪;高家东
  • 通讯作者:
    高家东
Coumarin-Induced Delay of Rice Seed Germination Is Mediated by Suppression of Abscisic Acid Catabolism and Reactive Oxygen Species Production
香豆素诱导的水稻种子发芽延迟是通过抑制脱落酸分解代谢和活性氧产生来介导的
  • DOI:
    10.3389/fpls.2019.00828
  • 发表时间:
    2019-06-27
  • 期刊:
    FRONTIERS IN PLANT SCIENCE
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Chen, Bing-Xian;Peng, Yuan-Xuan;Liu, Jun
  • 通讯作者:
    Liu, Jun
赤霉素代谢与信号转导及其调控种子萌发与休眠的分子机制
  • DOI:
    10.1360/ssv-2019-0289
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    中国科学. 生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    宋松泉;刘军;黄荟;伍贤进;徐恒恒;张琪;李秀梅;梁娟
  • 通讯作者:
    梁娟
种子耐脱水性的生理及分子机制研究进展
  • DOI:
    10.3864/j.issn.0578-1752.2022.06.001
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    中国农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    宋松泉;刘军;唐翠芳;程红焱;王伟青;张琪;张文虎;高家东
  • 通讯作者:
    高家东

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其他文献

寄生扁棘象的野姬蜂属(膜翅目,姬蜂科)中国新纪录种
  • DOI:
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    --
  • 作者:
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  • 作者:
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  • 期刊:
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  • 作者:
    孙策策;吴文涛;刘军;臧家业
  • 通讯作者:
    臧家业
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  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘军;许世峰;杨凤辉;李春友;于光圣;公伟;孟凡迎;徐延田;李光兵;郑顺贞;曹昱琨;郑元文;王建平;司伟
  • 通讯作者:
    司伟
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  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    海洋科学进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    臧家业;王昊;刘军;于志刚;吴念;冉祥滨
  • 通讯作者:
    冉祥滨

其他文献

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刘军的其他基金

水稻谷氧还蛋白和乙二醛酶在种子贮藏中的功能及机制研究
  • 批准号:
    31371715
  • 批准年份:
    2013
  • 资助金额:
    80.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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