非编码RNA MicF调控假结核耶尔森氏菌耐酸机理研究

批准号:
31100051
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
张勇
依托单位:
学科分类:
C0102.微生物生理与生化
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
卢培、胡杨波、杨宝玉、李云龙、黄莉
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中文摘要
近来研究发现非编码RNA(又称为small RNA, sRNA)广泛存在于原核生物,并且具有多种调控功能,对其研究越来越受到关注。肠道致病菌主要通过污染的水和食物等途径传播,抵抗宿主胃部的酸性环境是其成功感染面临的第一道屏障。我们的前期研究发现肠道致病菌假结核耶尔森氏菌编码sRNA的micF基因缺失使其耐酸能力明显增强,本项目将在此基础上,围绕MicF调控病原细菌耐酸过程及机理开展研究。首先采用比较蛋白组学的方法寻找MicF调控耐酸过程的作用靶基因,并通过gfp融合和Northern杂交验证MicF对靶基因的调控;然后检测这些靶基因的突变株对细菌耐酸的影响;最后通过EMSA、RNA structure probing等方法分析MicF调控靶基因的机制,达到阐明MicF抑制耐酸的作用机理的目的。项目的实施将揭示sRNA在肠道致病菌耐酸系统中的功能及作用机理。
英文摘要
假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotuberculosis, Yp)是耶尔森氏菌属三种人类致病菌之一,在人体之间主要通过污染的水和食物等途径传播。作为肠道致病菌,Yp成功感染需要耐受宿主胃部的强酸性环境,但其耐酸机理并不是十分清楚。近来研究发现小的调控RNA(small regulatory RNA, sRNA)是细菌重要的转录后调控因子,调控细菌生长代谢及毒力等各个方面。我们研究发现sRNA MicF过表达使Yp耐酸能力增强,小蛋白sprotein YPK_2840过表达使Yp耐酸能力减弱,sRNA MicF通过顺式作用调控小蛋白sprotein YPK_2840的表达来影响菌株的耐酸表型。通过构建Yp的Tn插入突变库并进行体外耐酸能力筛选,我们发现几个可能的sRNA参与调控耐酸。此外,通过比较蛋白组学发现sRNA SraG在转录后水平调控YPK_1205与YPK_1206这个操纵子的表达,YPK_1206的编码区(+30 - +38)对于SraG调控其表达是必须的,且不需要Hfq的辅助。顺式编码的sRNA YsrH抑制脂肪酸合成所需基因fabH2的表达,多核苷酸磷酸化酶PNPase参与该调控过程中,且参与介导sRNA YsrH的降解。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1016/j.febslet.2014.04.005
发表时间:2014-05
期刊:FEBS Letters
影响因子:3.5
作者:Pei Lu;Yong Zhang;Yangbo Hu;M. Francis;Shiyun Chen
通讯作者:Pei Lu;Yong Zhang;Yangbo Hu;M. Francis;Shiyun Chen
Small non-coding RNA SraG regulates the operon YPK_1206-1205 in Yersinia pseudotuberculosis.
小非编码 RNA SraG 调节假结核耶尔森氏菌中的操纵子 YPK_1206-1205。
DOI:10.1111/j.1574-6968.2012.02548.x
发表时间:2012-06
期刊:FEMS Microbiology Letters
影响因子:2.1
作者:张勇
通讯作者:张勇
噬菌体NM1的Gp29 通过NadE参与控制金黄色葡萄球菌的机制研究
- 批准号:31670176
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:62.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:张勇
- 依托单位:
国内基金
海外基金
