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长链非编码RNA AFAP1-AS1促进鼻咽癌侵袭转移的机制研究
结题报告
批准号:
81572787
项目类别:
面上项目
资助金额:
57.0 万元
负责人:
熊炜
依托单位:
学科分类:
H1805.肿瘤表观遗传
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
邓超、陈雄、龚朝建、唐艳艳、李俏、魏芳、孛昊、荆益州、武迎芬
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中文摘要
我们发现长链非编码RNA AFAP1-AS1在鼻咽癌中表达上调且与不良预后相关,但其功能和机制还鲜有研究;体内外实验证实敲低AFAP1-AS1可影响细胞骨架重构,抑制侵袭和迁移;利用蛋白组学技术发现Rho/Rac通路多个分子表达改变;结合临床资料分析、CHIP-Seq、RNA pull-down及生物信息学预测,本项目提出了“MYC及SWI/SNF染色质重构复合物共同调控AFAP1-AS1的转录,转录出的AFAP1-AS1 RNA又作为SWI/SNF复合物的组分之一,影响SWI/SNF复合物的组装和活性,进而调节Rho/Rac通路多个关键分子的表达,Rho/Rac通路则通过调控微管微丝组装和细胞骨架重构,促进鼻咽癌细胞的侵袭和转移”这一假说。本项目将初步明晰AFAP1-AS1在MYC-SWI/SNF-Rho/Rac信号通路中的表达调控规律,并阐释它在鼻咽癌发生发展中的作用和机制。
英文摘要
In our previous projects, we have found that a long non-coding RNA, termed AFAP1-AS1, is overexpressed in nasopharyngeal carcinoma and that AFAP1-AS1 levels predict poor outcomes; however, the biological function of AFAP1-AS1 and its mechanism are largely unknown. We have further elucidated that knock-down of AFAP1-AS1 could inhibit invasion and migration of nasopharyngeal carcinoma cells by regulating the assembly of microtubules and microfilaments, and the reorganization of the cytoskeleton, both in vivo and in vitro. Using a proteomics strategy, we have also shown that several key molecules of the Rho/Rac signaling pathway were significantly dysregulated in cancer cells by knock-down of AFAP1-AS1. In light of these findings, clinical data analysis of a large cohort of cancer patients, the results of our CHIP-sequencing and RNA pull-down experiments, and bioinformatics prediction, we hypothesize that the well-known oncogene MYC and the SWI/SNF chromatin remodeling complex regulate the transcription of the AFAP1-AS1 gene. Acting as a component of the SWI/SNF complex, transcribed AFAP1-AS1 RNA affects the organization of the SWI/SNF complex, modulates SWI/SNF genomic binding, and antagonizes the SWI/SNF-mediated regulation of multiple genes of the Rho/Rac signaling pathway; in turn, the Rho/Rac signaling pathway regulates the assembly of microtubules and microfilaments, and the reorganization of the cytoskeleton, thus promoting invasion and migration of cancer cells. In this study, we aim to elucidate in detail the role and mechanism of AFAP1-AS1 in promoting nasopharyngeal carcinoma progression through regulating MYC-SWI/SNF-Rho/Rac gene signaling transduction.
我们前期发现长链非编码RNA AFAF1-AS1在包括鼻咽癌在内的多种恶性肿瘤中均表达显著上调,且与肿瘤转移及不良预后密切相关。但AFAP1-AS1促进鼻咽癌转移的分子机制,以及它为何会在肿瘤中表达上调却不清楚。.在本项目资助下,我们发现AFAP1-AS1通过竞争性内源RNA (ceRNA)形式,通过miR-423-5p调控Rho/Rac通路RAB11B、LASP1的表达,AFAP1-AS1还可以通过miR-423-5p调控AP1家族成员FOSL2的表达,并通过FOSL2启动LASP1的转录,最终通过Rho/Rac通路促进鼻咽癌细胞侵袭和迁移能力。此外,我们还通过生物信息学分析锁定了AFAP1-AS1潜在启动子区域,通过ChIP等实验证实AFAP1-AS1启动子区域存在c-Myc的结合位点,并进一步证实c-Myc可以调控AFAP1-AS1的表达,这可能是AFAP1-AS1在多种恶性肿瘤中表达升高的原因之一。.本研究从ceRNA角度解析了AFAP1-AS1在鼻咽癌发生发展中的作用机理,并首次克隆和鉴定了AFAP1-AS1的启动子区域,为理解AFAP1-AS1在多种肿瘤中表达上调的机制提供了线索。上述发现表明AFAP1-AS1及其相关上下游调控分子有可能成为鼻咽癌诊断治疗的潜在靶点和标记。
期刊论文列表
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Genome-Wide Analysis of 18 Epstein-Barr Viruses Isolated from Primary Nasopharyngeal Carcinoma Biopsy Specimens
从原发性鼻咽癌活检标本中分离出的 18 种 Epstein-Barr 病毒的全基因组分析
DOI:10.1128/jvi.00301-17
发表时间:2017-09-01
期刊:JOURNAL OF VIROLOGY
影响因子:5.4
作者:Tu, Chaofeng;Zeng, Zhaoyang;Xiong, Wei
通讯作者:Xiong, Wei
Cloning and characterization of the putative AFAP1-AS1 promoter region
假定的 AFAP1-AS1 启动子区域的克隆和表征
DOI:10.7150/jca.29049
发表时间:2019-01
期刊:Journal of Cancer
影响因子:3.9
作者:Wei Fang;Jing Yi Zhou;He Yi;Tang Yon Yon;Yang Li Ting;Wu Ying Fen;Tang Le;Shi Lei;Gong Zhao Jian;Guo Can;Zhou Ming;Xiang Bo;Li Xiao Ling;Li Yong;Li Gui Yuan;Xiong Wei;Zeng Zhao Yang;Xiong Fang
通讯作者:Xiong Fang
DOI:10.1186/s12943-018-0827-8
发表时间:2018
期刊:Molecular Cancer
影响因子:37.3
作者:Zhong Y.;Du Y.;Yang X.;Mo Y.;Fan C.;Xiong F.;Ren D.;Ye X.;Li C.;Wang Y.;Wei F.;Guo C.;Wu X.;Li X.;Li Y.;Li G.;Zeng Z.;Xiong W.
通讯作者:Xiong W.
LncRNAs regulate the cytoskeleton and related Rho/ROCK signaling in cancer metastasis.
LncRNA 调节癌症转移中的细胞骨架和相关 Rho/ROCK 信号传导
DOI:10.1186/s12943-018-0825-x
发表时间:2018-04-04
期刊:Molecular cancer
影响因子:37.3
作者:Tang Y;He Y;Zhang P;Wang J;Fan C;Yang L;Xiong F;Zhang S;Gong Z;Nie S;Liao Q;Li X;Li X;Li Y;Li G;Zeng Z;Xiong W;Guo C
通讯作者:Guo C
circMAN1A2 could serve as a novel serum biomarker for malignant tumors
circMAN1A2可以作为恶性肿瘤的新型血清生物标志物
DOI:10.1111/cas.14034
发表时间:2019-07-01
期刊:CANCER SCIENCE
影响因子:5.7
作者:Fan, Chun-Mei;Wang, Jin-Peng;Zeng, Zhao-Yang
通讯作者:Zeng, Zhao-Yang
tRNA 及其衍生片段驱动鼻咽癌淋巴转移的调控网络研究
  • 批准号:
    2024JJ3035
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
适配体功能化纳米氧化铈药物递送体系阻断免疫炎症介导的TAO眼眶成纤维细胞活化的研究
  • 批准号:
    82371104
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    49万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
EB病毒编码的环状RNA在鼻咽癌放疗抵抗中的作用及机制研究
  • 批准号:
    U21A20382
  • 项目类别:
    --
  • 资助金额:
    260万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
双特异性核酸适体抑制CD34+眼眶成纤维细胞活化治疗Graves’眼病的功能和机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    --
  • 资助金额:
    55万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
LncRNA AFAP1-AS1结合TDP43调控RNA可变剪接促进鼻咽癌拟血管生成
  • 批准号:
    82071006
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
EBV-miR-BART11协同调控PD-L1/PD-1促进鼻咽癌免疫逃逸的机制研究
  • 批准号:
    81772928
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    51.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
低密度脂蛋白-罗格列酮-壳聚糖海藻酸钙纳米微囊靶向性缓释系统抗青光眼术后瘢痕化的研究
  • 批准号:
    81371013
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    69.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
FOXP1在鼻咽上皮"炎-癌"演进过程中的作用机制研究
  • 批准号:
    81372907
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
TP53基因调控的microRNAs用于鼻咽癌基因治疗和预后预测
  • 批准号:
    81172189
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
染色体3p21区域鼻咽癌候选易感/抑瘤基因LTF的功能研究
  • 批准号:
    30871282
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    34.0万元
  • 批准年份:
    2008
  • 负责人:
    熊炜
  • 依托单位:
国内基金
海外基金