依托高场固体核磁共振设施揭示原位条件下跨膜蛋白酪氨酸磷酸化后蛋白质特定位点的构象和动态特性变化

批准号:
U1432136
项目类别:
联合基金项目
资助金额:
72.0 万元
负责人:
熊英
依托单位:
学科分类:
A3205.稳态强磁场
结题年份:
2017
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
李冬、李娟、何垚
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中文摘要
蛋白质磷酸化是生物体内非常重要的翻译后修饰作用,在细胞信号转导、基因表达、细胞周期等生理活动中起着关键的调节作用。目前蛋白质磷酸化的检测主要包括放射自显影、抗体免疫反应和质谱检测,但只能鉴定细胞中蛋白质是否磷酸化。目前还不能在原位条件下分析磷酸化后蛋白质不同位点的构象和动态特性变化。申请人前期发展了19F标记非天然氨基酸方法实现原位条件下蛋白质核磁共振信号检测。申请人将进一步在稳态强磁场实验装置的支撑下:(1)应用19F-tfmF定点标记方法实现原位条件下磷酸化蛋白主链和侧链核磁共振化学位移、弛豫分析,(2)质谱和固体核磁相结合,特别是结合磷脂盘方法分析细菌跨膜酪氨酸激酶(ETK)在磷酸化后不同位点的构象变化和动态特性响应。相关方法的发展,将对丝氨酸、苏氨酸等其他蛋白质磷酸化检测和磷酸化后蛋白结构和动态特性变化提供新的研究方法,有助于进一步理解蛋白质磷酸化在细胞活动中的重要作用机制。
英文摘要
Protein phosphorylation is an essential cellular post-translational modification, which is playing critical roles in signal transduction, gene transcription regulation, cell cycles. Currently, protein phosphorylation can be detected using immuno-antibody reaction and mass spectrometry, providing only qualitative information of protein phosphorylation. Previously, the applicant has achieved in situ protein nuclear magnetic resonance signal detection using 19F labeled unnatural amino acids. Then, using the solid state NMR instrument in stable high magnetic field facility, the applicant will: (1) developed the in situ site-specific conformation and dynamic study methods using site-specific labeled 19F-tfmF, (2) analyzing conformational and dynamic variations or responses at different sites of E. coli tyrosine kinase (ETK) after protein phosphorylation, using the combinational methods of mass spectrometry, solid sate NMR and lipodisq techniques. The method developments will be helpful for further serine, thronine phosphorylation detection, consequent conformational and dynamic variations and for molecular mechanism illustration of protein phosphorylation in essential cellular processes.
蛋白质磷酸化是生物体内非常重要的翻译后修饰作用,但是目前还不能在原位条件下分析磷酸化后蛋白质不同位点的构象和动态特性变化。申请人前期发展了19F标记非天然氨基酸方法实现原位条件下蛋白质核磁共振信号检测。我们在稳态强磁场实验装置的支撑下,(1)应用19F-tfmF定点标记探针实现了原位条件下磷酸化蛋白质主链和侧链核磁共振化学位移、弛豫分析,并分析了蛋白质相互作用界面等(Protein Cell, 2017);(2)质谱和固体NMR相结合,特别是结合磷脂盘方法分析细菌跨膜酪氨酸激酶(ETK)在磷酸化后不同位点的构象变化和动态特性响应(Protein cell 2015);(3)应用基于荧光非天然氨基酸实现离子通道定点标记并分析NaK通道对K+,Na+的结合偏好(Chem Commun 2015);(4)比较和分析了基于NMR方法与基于动力学模拟方法的蛋白质动态特性分析(BBRC 2015).
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K+ preference at the NaK channel entrance revealed by fluorescence lifetime and anisotropy analysis of site-specifically incorporated (7-hydroxycoumarin-4-yl)ethylglycine
通过荧光寿命和位点特异性掺入的 (7-羟基香豆素-4-基)乙基甘氨酸的各向异性分析揭示了 NaK 通道入口处的 K 偏好
DOI:10.1039/c5cc06124e
发表时间:2015
期刊:CHEMICAL COMMUNICATIONS
影响因子:4.9
作者:Liu Sanling;Lv Pei;Li Dong;Guo Xiaoqi;Zhang Bo;Yu Mu;Li D;an;Xiong Ying;Zhang Longhua;Tian Changlin
通讯作者:Tian Changlin
General order parameter based correlation analysis of protein backbone motions between experimental NMR relaxation measurements and molecular dynamics simulations
基于通用序参数的实验 NMR 弛豫测量和分子动力学模拟之间蛋白质主链运动的相关性分析
DOI:--
发表时间:2015
期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications
影响因子:3.1
作者:Liu Q.;Shi C.;Yu L.;Zhang L.;Xiong Y.;Tian C.
通讯作者:Tian C.
DOI:10.1007/s13238-016-0336-8
发表时间:2017
期刊:PROTEIN & CELL
影响因子:--
作者:Li Dong;Zhang Yanan;He Yao;Zhang Chengwei;Wang Jiefei;Xiong Ying;Zhang Longhua;Liu Yangzhong;Shi Pan;Tian Changlin
通讯作者:Tian Changlin
综合应用质谱、核磁共振方法研究病原性大肠杆菌酪氨酸磷酸化激酶的自磷酸化、互磷酸化的动力学和分子机制
- 批准号:31100563
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:23.0万元
- 批准年份:2011
- 负责人:熊英
- 依托单位:
国内基金
海外基金
