TARBP2和m6A依赖的外泌体miRNAs筛选、鉴定及作为肝癌转移标志物的评价

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81772276
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    52.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2605.分子生物学检验
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

miRNAs play a critical role in tumor initiation and progression of hepatocellular carcinoma (HCC). The alterations of TARBP2 (the core component for miRNA biogenesis) contribute to miRNA dysregulation, affecting tumor growth, invasion and metastasis in several cancers. Recent findings reveal that the m6A mark acts as a key post-transcriptional modification that promotes the initiation of miRNA biogenesis,and METTL14 suppresses the metastatic potential of HCC by modulating m6A-dependent pri-miRNA processing, and HCC-derived exosomes promote motility of immortalized hepatocyte through transfer of oncogenic miRNAs. Our previous studies found there was a C430G mutation of TARBP2 in normal hepatocyte and HCC cell lines such as L02, HepG2, Hep3B, Bel-7402 and Qgy-7701, but not in metastatic HCC cell lines (HCC-LM9 and MHCC-97L). Most important, we also investigated that TARBP2 C430G mutation caused the repression of TARBP2 mRNA and protein expression. GSE data showed that the mRNA expression of TARBP2 in patients with metastatic HCC significantly increased compared with patients with primary HCC. Thus, we hypothesize that TARBP2 C430G mutation and m6A may induce tumor invasion and change the expression level of exosomal miRNAs. To verify the hypothesis, we will first analyze exosomal miRNA profiles of different HCC cell lines with or without TARBP2 C430G mutation, and with METTL3/14 knockdown or overexpression using miRNA expression microarray, m6A-seq will be next utilized to obtain m6A profiling of pri-miRNAs, also the exosomal miRNA in serum of patients with primary HCC or metastatic HCC will be determined by droplet digital PCR. These results will provide novel predictive biomarkers for hepatocellular carcinoma metastasis.
miRNA与肝癌发生发展相关。最新发现:① miRNA合成关键蛋白TARBP2异常与多种肿瘤的侵袭转移相关;② m6A影响pri-miRNA成熟,与肝癌侵袭转移相关;③高转移性肝癌细胞外泌体通过miRNA诱导非转移性肝细胞侵袭迁移。我们发现:TARBP2基因C430G突变仅存在于正常肝细胞和非转移性肝癌细胞,并导致mRNA和蛋白表达明显下降;转移性肝癌患者TARBP2较非转移性明显升高。据此假设:TARBP2和m6A依赖的外泌体miRNA调控肝癌的侵袭转移。本项目拟用miRNA芯片筛选TARBP2野生/突变型、METTL3/14敲减/过表达型的肝癌细胞外泌体差异miRNA;m6A-seq分析pri-miRNA的m6A;实时无标记细胞分析系统观察外泌体受体细胞增殖迁移,及其在裸鼠体内成瘤性、转移性;ddPCR检测血清外泌体候选miRNA。研究将为肝癌转移的精准诊断和治疗提供新的分子标志物。

结项摘要

肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是世界范围内高发生率高死亡率的恶性肿瘤之一。除了HBV感染之外,microRNA, N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)修饰等表观遗传因素也参与了其发生发展。TARBP2(Transactivation Response Element RNA-binding Protein, TARBP2)是 microRNA在生成和成熟过程中的一种关键蛋白。现有研究表明TARBP2和m6A对多种恶性肿瘤的发生和发展具有一定调控作用;但TARBP2和m6A在在HCC中的作用和分子机制尚未阐明。因此,本项目首先利用不同的肝癌细胞系、病人组织标本和外周血标本进行研究,通过表达、敲减、回补实验,证实TARBP2-miR-145-SERPINE1轴在肝癌进展中的作用。同时,针对乙肝病毒感染是我国肝癌的主要风险因素,建立了高灵敏特异性的HBV-DNA和cccDNA的微滴式数字PCR检测方法,可以实验单细胞和不同的临床样本检测,发现联合检测血清中HBV cccDNA拷贝数和HBV DNA拷贝数可以作为HCC 早期诊断的指标。我们还利用液质联用技术检测组织中m6A修饰水平,发现m6A在肝癌组织中升高,METTL3、METTL14和FTO在肝癌组织中表达下降,且均与m6A水平呈现负相关。进一步的FTO过表达、敲减和回补实验,证实m6A修饰可影响肝癌的发生发展。

项目成果

期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Plasma mtDNA copy numbers are associated with GSTK1 expression and inflammation in type 2 diabetes
血浆 mtDNA 拷贝数与 2 型糖尿病中 GSTK1 表达和炎症相关
  • DOI:
    10.1111/dme.14132
  • 发表时间:
    2019-09-17
  • 期刊:
    DIABETIC MEDICINE
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Deng, X.;Yang, G.;Liu, S-M.
  • 通讯作者:
    Liu, S-M.
DNA甲基化在肝癌中的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨超祺;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
Clinical significance of exosomal miRNAs and proteins in three human cancers with high mortality in China
外泌体 miRNA 和蛋白质在中国三种高死亡率人类癌症中的临床意义
  • DOI:
    10.3892/ol.2018.9631
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    ONCOLOGY LETTERS
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Li, Li-Man;Liu, Huan;Liu, Song-Mei
  • 通讯作者:
    Liu, Song-Mei
葡萄糖-6-磷酸脱氢酶表达与肝细胞肝癌的预后研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    临床肝胆疾病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘明君;刘颖娟;杨桂;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
Chronological Changes of Viral Shedding in Adult Inpatients With COVID-19 in Wuhan, China
中国武汉市成人 COVID-19 住院患者病毒排毒的时间变化
  • DOI:
    10.1093/cid/ciaa631
  • 发表时间:
    2020-10-15
  • 期刊:
    CLINICAL INFECTIOUS DISEASES
  • 影响因子:
    11.8
  • 作者:
    Huang, Jing-Tao;Ran, Ruo-Xi;Li, Yan
  • 通讯作者:
    Li, Yan

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其他文献

脂肪酸去饱和酶基因单倍型对2型糖尿病患者血浆脂质和脂肪酸影响的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    刘松梅
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中国糖尿病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    庞志宇;张红;邓浩华;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
2型糖尿病患者代谢清除率与血清游离脂肪酸的相关性
  • DOI:
    10.13241/j.cnki.pmb.2018.13.013
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    现代生物医学进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈邵旻;胡玲;邓浩华;胡红兵;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
中国人群线粒体基因C3394T及A12026G突变与2型糖尿病相关性的Meta分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国糖尿病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    夏维;齐佳会;胡红兵;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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