腺嘌呤去甲基化酶FTO对2型糖尿病糖脂代谢关键基因的调控作用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81472023
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    72.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2605.分子生物学检验
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

N6-methyladenosine (m6A) is the most prevalent internal modification in mRNA, which has a fundamental role in regulation of gene expression. Recent studies demonstrated that the fat mass and obesity-associated (FTO) protein, as a risk factor for type 2 diabetes mellitus (T2DM) and obesity, is an m6A-demethylase. Our previous studies have already demonstrated that a significant higher expression level of FTO and lower m6A content were in peripheral blood of T2DM patients and diabetic rats, compared with the normal controls; our results further confirmed that m6A content was not only negatively correlated with fasting blood glucose and triglycerides (TG), but correlated with high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C), which implied that decreased m6A content was a risk factor for T2DM. Thus, we hypothesize that FTO regulates m6A dynamic modification and affects the expression levels of the regulatory genes involved in glucose and lipid metabolism, which will lead to impaired functional glucose homeostasis and lipid disorder. To verify the hypothesis, we will analyze T2DM specific expression profiles with contained m6A and confirm FTO plays a key regulation function in those genes involved in glucose and lipid metabolism using m6A-seq and liquid chromatography-electrospray ionization-tandem mass spectrometry (LC-ESI-MS/MS) analysis. These results will provide new insights into the pathogenesis of impaired glucose homeostasis and lipid disorder induced by mRNA methylation and novel ideals for the prevention of T2DM and its complications.
N6-甲基腺嘌呤(m6A)是mRNA修饰中最常见类型,在调控基因表达中起重要作用。最新研究表明,与2型糖尿病(T2DM)和肥胖相关的FTO基因编码的蛋白是m6A的特异性去甲基化酶。我们前期发现:①T2DM患者外周血FTO基因高表达,m6A含量明显下降,在糖尿病大鼠血液中存在相同的现象;②m6A含量与空腹血糖、甘油三酯负相关,而与高密度脂蛋白胆固醇正相关;③m6A含量下降是T2DM的风险因子。据此假设:去甲基化酶FTO通过调控m6A修饰而影响糖脂代谢关键基因表达,导致T2DM糖脂代谢紊乱。本课题拟采用最新的m6A修饰的mRNA深度测序(m6A-seq)和液质联用(LC-ESI-MS/MS)技术,从个体、细胞及动物水平明确FTO对糖脂代谢关键基因的调控作用,发现T2DM特异性的差异甲基化基因。本研究将从RNA甲基化新角度探讨糖脂代谢紊乱的发生机制,为T2DM及其并发症的防治提供新思路。

结项摘要

糖尿病是全球性的卫生和经济问题,95%以上患者是2型糖尿病,在中国成年人中的发病率近11%。心血管事件是2型糖尿病就诊和死亡的主要因素,而糖脂代谢紊乱是主要诱因。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是mRNA修饰中最常见类型,在调控基因表达中起重要作用。研究m6A对T2DM糖脂代谢关键基因的调控作用,为糖尿病合并心血管疾病的防治提供新的分子靶标,具有重要的社会、经济和科学意义。然而,目前研究T2DM外周血表观遗传学改变的报道仍很少。. 围绕项目的总体研究目标,开展m6A高通量测序(m6A-Seq)、DNA修饰、RNA修饰、脂肪酸、microRNA和SNP的高灵敏检测方法学研究,一方面应用这些新发展的方法检测临床糖尿病患者血液标本,另一方面在细胞水平及糖尿病动物模型中进行研究,探索DNA, RNA表观遗传学、miR-33及脂代谢关键基因SNP在糖尿病、糖尿病脂代谢紊乱、糖尿病心血管疾病中的可能作用。. 通过研究,成功进行糖尿病外周血m6A-Seq,数据正在分析中;成功建立了高灵敏的液质联用技术平台,检测人类外周血、DNA、RNA甲基化、羟甲基化修饰检测;完成细胞模型和动物模型的构建;建立HRM技术的DNA突变和SNP分型的高灵敏检测方法,并应用于临床标本检测;发现糖尿病合并冠心病患者的血浆脂肪酸特征谱,发现m6A和5hmC分别具有作为糖尿病诊断以早期预警的分子标志物价值,明确去甲基化酶FTO对m6A及糖脂代谢关键基因(G6PC,FASN,FOXO1,DGAT2)的调控。

项目成果

期刊论文数量(17)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
2型糖尿病患者代谢清除率与血清游离脂肪酸的相关性
  • DOI:
    10.13241/j.cnki.pmb.2018.13.013
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    现代生物医学进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈邵旻;胡玲;邓浩华;胡红兵;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
FTO Genotype and Type 2 Diabetes Mellitus: Spatial Analysis and Meta-Analysis of 62 Case-Control Studies from Different Regions.
FTO 基因型与 2 型糖尿病:来自不同地区的 62 项病例对照研究的空间分析和荟萃分析
  • DOI:
    10.3390/genes8020070
  • 发表时间:
    2017-02-11
  • 期刊:
    Genes
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Yang Y;Liu B;Xia W;Yan J;Liu HY;Hu L;Liu SM
  • 通讯作者:
    Liu SM
Polymorphisms in FADS1 and FADS2 alter plasma fatty acids and desaturase levels in type 2 diabetic patients with coronary artery disease.
FADS1 和 FADS2 的多态性改变患有冠状动脉疾病的 2 型糖尿病患者的血浆脂肪酸和去饱和酶水平
  • DOI:
    10.1186/s12967-016-0834-8
  • 发表时间:
    2016-03-22
  • 期刊:
    Journal of translational medicine
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Li SW;Wang J;Yang Y;Liu ZJ;Cheng L;Liu HY;Ma P;Luo W;Liu SM
  • 通讯作者:
    Liu SM
Next Generation Digital PCR Measurement of Hepatitis B Virus Copy Number in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Hepatocellular Carcinoma Tissue
福尔马林固定石蜡包埋的肝细胞癌组织中乙型肝炎病毒拷贝数的新一代数字 PCR 测量
  • DOI:
    10.1373/clinchem.2014.230227
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    CLINICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    9.3
  • 作者:
    Huang, Jing-Tao;Liu, Ying-Juan;Liu, Song-Mei
  • 通讯作者:
    Liu, Song-Mei
In-hospital free fatty acids levels predict the severity of myocardial ischemia of acute coronary syndrome.
院内游离脂肪酸水平可预测急性冠脉综合征心肌缺血的严重程度
  • DOI:
    10.1186/s12872-016-0199-1
  • 发表时间:
    2016-02-01
  • 期刊:
    BMC cardiovascular disorders
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Ma P;Han L;Lv Z;Chen W;Hu H;Tu J;Zhou X;Liu SM
  • 通讯作者:
    Liu SM

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其他文献

N~6-甲基腺嘌呤修饰在临床恶性肿瘤中的研究进展
  • DOI:
    10.13376/j.cbls/2019022
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄景涛;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
DNA甲基化在肝癌中的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨超祺;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    临床肝胆病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    冉若曦;肖梦瑶;黎安玲;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
中国人群线粒体基因C3394T及A12026G突变与2型糖尿病相关性的Meta分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国糖尿病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    夏维;齐佳会;胡红兵;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅
葡萄糖-6-磷酸脱氢酶表达与肝细胞肝癌的预后研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    临床肝胆疾病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘明君;刘颖娟;杨桂;刘松梅
  • 通讯作者:
    刘松梅

其他文献

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基于微量样本多维组学技术的新型布尼亚病毒感染预后标志物研究
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    2021
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  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    70.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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  • 批准号:
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  • 批准年份:
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  • 资助金额:
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  • 项目类别:
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相似海外基金

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  • 财政年份:
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  • 项目类别:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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