Cycloclasticus sp. P1是本实验室从西太平洋深海沉积物中富集分离得到的一株能利用芘为唯一碳源降解菌，也是第一株从深海环境中获得的解环菌。它能降解萘、2-甲基萘、2,6-二甲基萘、苊、菲、蒽、芴、氧芴、硫芴、芘、联苯等多环芳烃；对PAHs降解范围广泛，并且可以以芘为唯一碳源生长，使得该菌区别于该属的其他菌。本研究通过Roche 454 测序技术对全基因组进行测序，并通过PCR扩增和ABI 3730测序技术对其进行 genome finishing，最终获得了该菌完整的基因组序列。Cycloclasticus sp. P1基因组由一个环状染色体构成，gap closing后共得到全长2,363,215 bp的核酸序列，GC含量42%。经软件glimmer和zcurve预测，该基因组共编码2,249个开放阅读框（ORF）。所有编码序列占基因组全长的91.2%，编码序列平均长度为958bp。此外，该还有1个rRNA操纵元，35个tRNA编码基因对应全部20种氨基酸。.通过转录组实验，将转录表达显著差异的基因进行COG分类，发现差异表达的基因主要集中在多环芳烃降解路径，细胞运动性，双组分信号转导系统，膜转运系统，核糖体蛋白等相关基因。这些差异表达基因直接或间接地参与多环芳烃的降解，通过对差异表达系统的分析阐述P1菌的PAHs降解机制。同时，本研究还深入研究了PAHs降解机制。从P1菌中发现了对多环芳烃感应、信号转导、趋化、摄取、调控、降解等重要过程所涉及的功能基因，并通过生物化学和分子生物学的技术手段验证了这些功能基因。.此外, 本课题还从北冰洋深海表层沉积物样品PAHs富集菌群中新获分离了三株Cycloclasticus的菌株纯培养，并验证了其高效的PAHs降解能力。值得注意的是，在维度最高的样点原位环境中有大量的Cycloclasticus的菌株存在。.总之,本研究通过运用基因组、转录组和相关生化与分子生物的方法，基本完成了Cycloclasticus sp. P1菌对多环芳烃感应、信号转导、趋化、摄取、调控、降解降解等重要过程的研究。