弧菌在我国边缘海的生态分布及在碳循环中的作用研究
结题报告
批准号:
41730530
项目类别:
重点项目
资助金额:
315.0 万元
负责人:
张晓华
依托单位:
学科分类:
D0604.生物海洋学与海洋生物资源
结题年份:
2022
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
姚鹏、于敏、刘吉文、乔延路、王晓磊、赵彬、林禾雨、武彦宏、梁金昌
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中文摘要
异养微生物在驱动有机碳矿化过程中发挥着关键作用,但目前绝大多数微生物类群对有机碳的降解转化过程和机制以及对有机碳矿化的贡献尚不明确,阻碍了人们对海洋碳循环的认识。本项目拟以边缘海中分布广、丰度高且异养代谢活性强的弧菌为研究对象,通过对其在我国边缘海不同环境中的丰度、种类组成和遗传多样性等方面进行研究,阐明弧菌在我国边缘海的分布规律;通过对弧菌地理分布特征和种群遗传学特征与环境因素的相关性分析,找出影响弧菌分布及其生态功能的主控因子;通过检测弧菌对不同类型有机物的降解效率,揭示其在海洋有机碳降解过程中的贡献;通过对典型有机物降解酶基因进行异源表达、降解活性及降解产物的检测,揭示弧菌对有机碳的降解机制。最后,结合弧菌生态分布等的研究结果,估算弧菌在我国边缘海碳循环中的贡献。通过以上研究,加深人们对异养微生物在边缘海碳循环中所发挥作用的认知。
英文摘要
Heterotrophic microorganisms are known to play key roles in driving remineralization of organic carbon. However, the degradation and transformation processes and mechanisms on organic carbon as well as the contribution to organic carbon remineralization of most microbial groups are poorly understood, which hinders our understanding of marine carbon cycle. The study object of this project is Vibrio species, a widespread bacterial species in marginal seas with high abundance and heterotrophic metabolic activities. The abundance, species composition and genetic diversity of Vibrio species in different environments of Chinese marginal seas will be investigated, and their distribution patterns in Chinese marginal seas will be determined; the correlation between geographic distribution patterns as well as population genetics properties of Vibrio species and various environmental factors will be analyzed, and the main control factors that affect the distribution and ecological roles exertion of Vibrio species will be discovered; degradation efficiencies of Vibrio species on different types of organic carbons will be tested, and the contribution of Vibrio species in degradation of marine organic carbon will be revealed; genes encoding hydrolytic enzymes to typical organic carbon will be cloned and heterologous expressed, the degradation activity will be detected and the hydrolysed product will be identified, and the degradation mechanism of Vibrio species to typical organic carbon will be revealed. Finally, all the results will be combined, and the roles of Vibrio species on carbon cycle of Chinese marginal seas will be evaluated. Based on the above studies, the knowledge of the contribution of heterotrophic microbial communities to carbon cycle in marginal seas will be enriched.
异养微生物在驱动有机碳矿化中发挥关键作用,但人们对于异养微生物对有机碳的降解过程和机制及其对有机碳矿化的贡献了解甚少,阻碍了对海洋碳循环的认识。本项目拟以边缘海中分布广、丰度高且异养代谢活性强的弧菌为研究对象,通过对弧菌在我国边缘海的丰度、种类组成、种群遗传学特征、环境响应以及对典型有机物的降解过程和机制等进行研究,阐明其生态分布特征及在碳循环中的作用。研究结果表明,我国边缘海(渤海、黄海、东海、南海及长江口)水体和沉积物中的弧菌丰度高于全球其他海域;弧菌丰度呈显著的时空差异,夏季>冬季,沉积物>水体,海水>淡水,南海>黄海,弧菌呈自由生活或颗粒附着状态;冬季和夏季的优势类群分别为大西洋弧菌和欧文氏弧菌。弧菌分布呈明显的空间异质性和距离衰减模式,受温度、盐度、DO、pH及空间因素等的显著影响。弧菌拥有稳定的核心基因组与趋近无穷大的泛基因组,使其适应多变的海洋环境,弧菌祖先坎贝氏弧菌可能从~385百万年前泥盆纪时期伴随鱼类的繁荣一同出现;几丁质酶基因在弧菌基因组中广泛存在,说明几丁质对弧菌生存非常重要;分离自不同生态位的坎贝氏弧菌具有显著不同的有机物降解基因和遗传特性,说明环境因素对弧菌生态功能具有重要控制作用。发现弧菌对多种大分子有机物有降解作用,但不同菌株的有机物降解谱有较大差异,多数菌株可降解几丁质,许多菌株可降解褐藻胶;发现轮虫弧菌和哈维氏弧菌中两个序列高度相似的几丁质酶具有截然不同的酶学性质;从海弧菌中鉴定出10个褐藻胶裂解酶基因,其中2个为新酶基因,该菌基因组具有3个褐藻胶代谢基因座,该菌在降解褐藻胶过程中会分泌囊泡结构,内含褐藻胶裂解酶,提出了细菌褐藻胶降解代谢的新思路。总之,本项目揭示了弧菌在我国边缘海的生态分布特征、环境因素对弧菌地理分布和生态功能的控制作用及其对不同类型海洋有机碳的降解过程和机制,加深了人们对异养微生物在边缘海碳循环中所发挥作用的认知。
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Comparative Genomic Analysis of Labrenzia aggregata (Alphaproteobacteria) Strains Isolated From the Mariana Trench: Insights Into the Metabolic Potentials and Biogeochemical Functions.
从马里亚纳海沟分离的 Labrenzia aggregata(Alphaproteobacteria)菌株的比较基因组分析:深入了解代谢潜力和生物地球化学功能。
DOI:10.3389/fmicb.2021.770370
发表时间:2021
期刊:Frontiers in microbiology
影响因子:5.2
作者:Zhong H;Sun H;Liu R;Zhan Y;Huang X;Ju F;Zhang XH
通讯作者:Zhang XH
DOI:10.1099/ijsem.0.003732
发表时间:2020
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
影响因子:2.8
作者:Li Bei;Li Yuying;Liu Ronghua;Xue Chunxu;Zhu Xiaoyu;Tian Xiaorong;Wang Xiaolei;Liang Jinchang;Zheng Yanfen;Zhang Xiao-Hua
通讯作者:Zhang Xiao-Hua
Biogenic production of DMSP and its degradation to DMS-their roles in the global sulfur cycle
DMSP 的生物生产及其降解为 DMS - 它们在全球硫循环中的作用
DOI:10.1007/s11427-018-9524-y
发表时间:2019
期刊:Science China Life Sciences
影响因子:--
作者:Zhang Xiao Hua;Liu Ji;Liu Jingli;Yang Guipeng;Xue Chun Xu;Curson Andrew R J;Todd Jonathan D
通讯作者:Todd Jonathan D
Characterization of multiple alginate lyases in a highly efficient lginate-degrading Vibrio strain and its degradation strategy
高效藻酸盐降解弧菌菌株中多种藻酸盐裂解酶的表征及其降解策略
DOI:--
发表时间:2022
期刊:Applied and Environmental Microbiology
影响因子:4.4
作者:He Xinxin;Zhang Yunhui;Wang Xiaolei;Zhu Xiaoyu;Chen Leiran;Liu Weizhi;Lyu Qianqian;Ran Lingman;Cheng Haojin;Zhang Xiao-Hua
通讯作者:Zhang Xiao-Hua
DOI:10.1128/aem.00575-22
发表时间:2022-08
期刊:Applied and Environmental Microbiology
影响因子:4.4
作者:Jinchang Liang;Jiwen Liu;Xiaolei Wang;Hao Sun;Yulin Zhang;F. Ju;F. Thompson;Xiaohua Zhang
通讯作者:Jinchang Liang;Jiwen Liu;Xiaolei Wang;Hao Sun;Yulin Zhang;F. Ju;F. Thompson;Xiaohua Zhang
深海放线菌新型DMSP裂解酶的鉴定及其生理生态功能研究
  • 批准号:
    32370118
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    张晓华
  • 依托单位:
海洋异养细菌对DMSP/DMS产生的贡献及驱动硫循环的机制:以马里亚纳海沟为例
  • 批准号:
    91751202
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    320.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    张晓华
  • 依托单位:
我国边缘海颗粒有机碳中细菌密度感应及其对有机碳降解的调控作用
  • 批准号:
    41476112
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    100.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    张晓华
  • 依托单位:
南太平洋环流区洋底沉积物及海水的微生物群落演化及功能活性研究
  • 批准号:
    41276141
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    87.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    张晓华
  • 依托单位:
海洋拮抗菌假交替单胞菌JG1作用机理的研究
  • 批准号:
    40876067
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    44.0万元
  • 批准年份:
    2008
  • 负责人:
    张晓华
  • 依托单位:
哈维氏弧菌VHH溶血素作用机理的研究
  • 批准号:
    30771656
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    32.0万元
  • 批准年份:
    2007
  • 负责人:
    张晓华
  • 依托单位:
海洋弧菌中溶血素的研究
  • 批准号:
    30371119
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    20.0万元
  • 批准年份:
    2003
  • 负责人:
    张晓华
  • 依托单位:
国内基金
海外基金