杀菌剂使用与人体病原菌抗药性关系是近期从流行病学角度提出的新命题，但其中的形成机制和传播途径有待科学解析。项目围绕田间土壤中烟曲霉抗药性及其与杀菌剂使用关系问题，研究了作物和土壤中抗多菌灵的烟曲霉的抗性、抗性菌株对多菌灵和奥硝唑的代谢及其机制、烟曲霉抗药性分子机制、多菌灵诱导的烟曲霉抗性、抗性菌株在番茄-土壤系统中的可迁移性等。同时，开展了禽蓄有机肥投入与抗生素抗性菌形成以及不同年份棚龄设施土壤中抗生素抗性菌发展特征等研究。.结果显示，抗多菌灵的烟曲霉对奥硝唑、甲硝唑、罗硝唑、塞克硝唑、地美硝唑（MIC ≥ 500 mg/L）和替硝唑（MIC=100 mg/L）等咪唑类抗真菌药物产生了交互抗性。长期接触农用唑类杀菌剂，烟曲霉面临选择压力，易对多菌灵产生抗性，且对与农用唑类杀菌剂结构类似的医用咪唑类抗真菌药物产生高水平的交互抗性。.烟曲霉的抗药性存在2种途径：1）代谢抗性 如菌株YT可代谢6种抗真菌药物，通过脱卤、氧化还原作用使奥硝唑转化为1-（2-羟丙基）-2-甲基-5-硝基咪唑和2-甲基-5-氨基咪唑；2）cyp51A突变 包括40位的氨基酸由V-G、54位的氨基酸由G-V、G-E，236位的氨基酸由M-V、248位的氨基酸由N-T、297位的氨基酸S-T、54位和297位保守氨基酸的突变等。. 烟曲霉在土壤-作物系统中可发生迁移，土壤中的烟曲霉可迁移至番茄叶片和果实。. 大棚土壤样品中ARGs相对丰度是大田土壤的5.5-8.9倍，其优势ARGs是MDR、MLS、吖啶类、四环素类、膦胺霉素类等，大棚土壤中MDR基因相对丰度比大田土壤高4.7-12.5倍。大棚土壤中ARGs相对丰度随着大棚棚龄的上升而逐步增加，大棚土壤中抗性人类病原菌相对丰度也随着大棚棚龄的上升而逐步增加。揭棚处理能显著缩减MDR基因丰度。. 项目研究结果基本明确了田间土壤烟曲霉对多菌灵等咪唑类杀菌剂和咪唑类抗真菌药物的抗药性及其机制、烟曲霉抗药性与多菌灵等咪唑类杀菌剂使用之间的关系、多菌灵诱导可导致烟曲霉的抗药性、烟曲霉在番茄-土壤系统中的可迁移性、禽蓄有机肥投入与抗生素抗性菌形成关系、设施棚龄与土壤中抗生素抗性菌发展的关系，为抗药性来源的认识提供了科学依据，也为抗药性管理提供可资参考的途径。