超嗜热古菌DNA重组修复解旋酶和核酸酶的作用机制及体内功能
批准号:
30930002
项目类别:
重点项目
资助金额:
175.0 万元
负责人:
申玉龙
依托单位:
学科分类:
C0103.微生物组学与代谢
结题年份:
2013
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
倪金凤、盛多红、洪烨、马小清、梁朋娟、王蕾、黄奇洪、韩文元、初明珠
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中文摘要
同源重组修复是DNA双链断裂(DSB)和停顿复制叉修复的主要途径之一,在基因组稳定中起重要作用,人类多种疾病都与该途径蛋白或其关联蛋白的缺陷密切相关。在超嗜热古菌基因组中,编码新型解旋酶HerA、新型核酸酶NurA、重要的重组修复核酸内切和外切酶Mre11和ATP酶Rad50的基因常位于同一操纵子。前期我们对HerA和NurA的生化性质及其与其它蛋白的相互作用作了研究,但其参与DSB修复的详细机理和体内功能尚不清楚;另外发现硫化叶菌中RecQ家族解旋酶Hjm,可使复制叉回退产生Holliday junction(HJ),且能够和 HJ特异性核酸内切酶 Hjc相互作用,但二者相互作用的机制及其在细胞内的功能还不明了。本项目拟对解旋酶HerA、Hjm和核酸酶NurA、Hjc的体外生化性质、作用机制、结构域与晶体构造以及它们在古菌细胞内的功能进行研究,预期结果将为真核生物相关研究提供重要启示。
英文摘要
本项目原计划利用生物化学、分子生物学、遗传学和结构生物学的方法,研究超嗜热古菌硫化叶菌(Sulfolobus)中参与DNA双链断裂修复的解旋酶HerA、Hjm, 核酸酶NurA及Hjc等蛋白的性质、结构、体外功能和体内功能等。经过四年的研究,课题组在这些蛋白的生化性质、体内外功能等方面进展良好并取得成果(Hong et al., 2012,DNA Repair; Zheng et al., 2012, Applied and Environmental Microbiology; Wei et al., 2011, Extremophiles)。课题组还分析和鉴定了DNA双链断裂修复相关蛋白重组酶RadA及其同源蛋白RadC1和RadC2,Holliday junction解离酶Hje,DNA修复解旋酶Xpb1、Xpb2和Bax1等的性质和功能并取得成果(Wang, 2013,Science in China; Liang et al., 2013; Journal of Genetics and Genomics; Ma et al., 2011, Extremophiles)。为了完善硫化叶菌遗传操作体系,我们建立了一种抗生素辛伐他汀筛选标记成功用于基因功能遗传分析中(Zheng et al., 2012, Applied and Environmental Microbiology)。本项目还开展了相关基因敲除菌株、超表达菌株的细胞学和蛋白质组学分析,进一步分析了蛋白的功能,相关结果正在投稿中(Huang et al., Molecular Microbiology)。更重要的,通过组学分析,我们发现了与Holliday junction解离酶Hjc互作古菌中保守的新型ATP酶,发现HerA过表达导致细胞分裂关联的ESCRTIII同源蛋白转录水平下调等,为后续硫化叶菌DNA修复机制和其它分子机制的研究确定新的研究方向和课题。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Single-stranded DNA binding activity of XPBI, but not XPBII, from Sulfolobus tokodaii causes double-stranded DNA melting
来自托科代硫化叶菌的 XPBI(而非 XPBII)的单链 DNA 结合活性导致双链 DNA 熔化
DOI:10.1007/s00792-010-0338-z
发表时间:2011-01-01
期刊:EXTREMOPHILES
影响因子:2.9
作者:Ma, Xiaoqing;Hong, Ye;Shen, Yulong
通讯作者:Shen, Yulong
Development of a Simvastatin Selection Marker for a Hyperthermophilic Acidophile, Sulfolobus islandicus
超嗜热嗜酸菌岛硫化叶菌辛伐他汀选择标记的开发
DOI:10.1128/aem.06095-11
发表时间:2012-01-01
期刊:APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
影响因子:4.4
作者:Zheng, Tao;Huang, Qihong;Shen, Yulong
通讯作者:Shen, Yulong
DOI:10.1016/j.dnarep.2011.10.009
发表时间:2012-02-01
期刊:DNA REPAIR
影响因子:3.8
作者:Hong, Ye;Chu, Mingzhu;Shen, Yulong
通讯作者:Shen, Yulong
Knockouts of RecA-Like Proteins RadC1 and RadC2 Have Distinct Responses to DNA Damage Agents in Sulfolobus islandicus
RecA 样蛋白 RadC1 和 RadC2 的敲除对岛硫化叶菌中的 DNA 损伤剂有不同的反应
DOI:10.1016/j.jgg.2013.05.004
发表时间:2013-10-01
期刊:JOURNAL OF GENETICS AND GENOMICS
影响因子:5.9
作者:Liang, Peng-Juan;Han, Wen-Yuan;Shen, Yu-Long
通讯作者:Shen, Yu-Long
DOI:10.1007/s00792-010-0351-2
发表时间:2010
期刊:Extremophiles
影响因子:2.9
作者:Tao Wei;Song-tao Zhang;Linlin Hou;J. Ni;Duohong Sheng;Yulong Shen
通讯作者:Tao Wei;Song-tao Zhang;Linlin Hou;J. Ni;Duohong Sheng;Yulong Shen
硫化叶菌及其病毒多种RHH家族转录因子调控细胞周期的分子机制
- 批准号:32370033
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:50万元
- 批准年份:2023
- 负责人:申玉龙
- 依托单位:
硫化叶菌新型错配修复蛋白EndoMS的生化性质鉴定与体内功能的遗传分析
- 批准号:31970546
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:58.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:申玉龙
- 依托单位:
冰岛硫化叶菌新型ATP酶PINA的生化性质与结构及其在同源重组修复中的作用研究
- 批准号:31670061
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:63.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:申玉龙
- 依托单位:
硫化叶菌Holliday junction解离酶Hje的体内功能与作用机制研究
- 批准号:31470184
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:88.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:申玉龙
- 依托单位:
超嗜热古菌Sulfolobus islandicus核酸切除修复途径研究
- 批准号:31170072
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2011
- 负责人:申玉龙
- 依托单位:
古菌Hjm解旋酶参与复制叉回退和Holliday junction加工的机制
- 批准号:30870046
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:35.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:申玉龙
- 依托单位:
超嗜热古菌Pyrococcus horikoshii几丁质降解酶研究
- 批准号:30570012
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2005
- 负责人:申玉龙
- 依托单位:
超嗜热古菌DNA复制、修复及重组酶的研究
- 批准号:30470386
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:20.0万元
- 批准年份:2004
- 负责人:申玉龙
- 依托单位:
国内基金
海外基金















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