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深海细菌B5及突变文库活性化合物的二维有序分离及核受体靶点生物学机制研究
结题报告
批准号:
81773600
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
吴振
依托单位:
学科分类:
H3402.天然药物化学
结题年份:
2021
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
薛识、敖名涛、晏霞、郭凯强、钱宇卿、周晓晓
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中文摘要
课题选择可产生活性次生代谢产物,代谢产物具有一定结构特点,并完成全基因组测序的几株深海微生物为研究对象,开展以核受体为靶点的先导化合物发现、形成规律及作用机制的研究。本课题以深海细菌B5为主要研究对象,以24碳大环内酯类化合物为参照物,以二维制备色谱有序分离为手段,针对B5沉默基因激活和等离子突变文库,从基因水平上开展新化合物的发现、生物合成途径阐述、核受体靶点生物学机制研究和合成生物学元件探索等工作,力求在发展天然药物化学研究方法、探索天然产物形成规律方面取得一些进展,为先导化合物的发现与研究奠定基础。
英文摘要
In this project, isolation, structural elucidation and molecular mechanism involved in RXR and Nur77 pathway of secondary metabolites from deep-sea Bacillus subtilis B5 and its mutation libraries and some deep sea derived fungi are carried out. By taking the advantages of two-dimensional chromatographic separation techniques, this proposal aims to establish the biological target research platforms for marine drugs or secondary metabolites from deep-sea microorganisms. In order to understand the target molecular mechanism of bioactive molecules and develop new research strategy for natural drug targets, Macrolactins and other secondary metabolites from B5 bacteria via sequencing and mutation analysis will be inverstigated by new approaches for activating silent biogenetic gene clusters in marine microorganisms. It will also help to develop new methods to evaluate the molecular mechanism of marine drugs and build the theoretical basis of lead compound discovery and exploiation, by using modern molecular pharmacology.
课题以深海微生物为资源,开展发现以核受体等为靶点的活性分子研究工作。主要研究成果如下:1)对B5等菌株仿深海条件,高压低温发酵,乙酸乙酯提取,采用硅胶柱色谱层析、薄层层析、中压反相ODS柱层析、HPLC柱色谱层析等色谱方法进行代谢物的分离纯化,并结构表征。2)对B5及其部分突变株等十株菌株大发酵,乙酸乙酯提取,采用硅胶柱色谱层析、薄层层析、中压反相ODS柱层析、HPLC柱色谱层析等色谱方法进行代谢物的分离纯化,质谱检测和核磁共振测试等方法进行结构鉴定,总共得到59个化合物,其中新化合物10个。3)基于新型在线二维分离系统运用于目标菌株次级代谢产物的分离,包括不同环境来源的一株细菌和五株真菌发酵物的乙酸乙酯提取物。从分析放大到制备,共得到 114 个化合物,包括 22 个新化合物。从土曲霉属H768进行发酵分离纯化,得到24个化合物。自红树林棘孢木霉H553,分离鉴定到 23个单体化合物,其中得到3个新化合物。4)以核受体 RXRα 、Nur77、CDK9和CDK1 为靶点,利用计算机辅助药物设计,分别设计合成了286个化合物。基于最新的蛋白降解靶向联合体 (PROTAC),课题以 ICDK9 为功能分子,设计合成20多个小分子探针,其中12-10 进行诱导靶向蛋白降解实验研究。实验结果显示,12-10 可以在纳摩尔浓度下通过 CRBN 依赖的途径特异性地降解 CDK9。实验中通过进一步结合 SILAC 定量蛋白组学技术,鉴定出了那些显著下调的蛋白,从中成功地筛选到 ICDK9 未见报道的新的结合靶点 RXRα。经 ITC 及报告基因验证,ICDK9 在体外能与RXRα-LBD 结合,并诱导 RXRα 的转录激活。PROTAC 技术和靶向 RXRα、Nur77、CDK9和CDK1 的化合物的发现和作用机制研究对新靶点的阐述具有重要意义。
期刊论文列表
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Design, synthesis and biological evaluation of methylenehydrazine-1-carboxamide derivatives with (5-((4-(pyridin-3-yl)pyrimidin-2-yl)amino)-1H-indole scaffold: Novel potential CDK9 inhibitors
具有 (5-((4-(pyridin-3-yl)pyrimidin-2-yl)amino)-1H-indole 支架的亚甲基肼-1-甲酰胺衍生物的设计、合成和生物学评价:新型潜在 CDK9 抑制剂
DOI:10.1016/j.bioorg.2020.104064
发表时间:2020-09-01
期刊:BIOORGANIC CHEMISTRY
影响因子:5.1
作者:Hu, Hongyu;Wu, Jun;Fang, Meijuan
通讯作者:Fang, Meijuan
Synthesis and biological evaluations of N′-substituted methylene-4-(quinoline-4-amino) benzoylhydrazides as potential anti-hepatoma agents
N'-取代的亚甲基-4-(喹啉-4-氨基)苯甲酰肼作为潜在抗肝癌药物的合成和生物学评价
DOI:10.1016/j.bioorg.2020.103592
发表时间:2020-03-01
期刊:BIOORGANIC CHEMISTRY
影响因子:5.1
作者:Li, Baicun;Zhu, Feifeng;Fang, Meijuan
通讯作者:Fang, Meijuan
Design, synthesis, and biological evaluation of AV6 derivatives as novel dual reactivators of latent HIV-1.
AV6 衍生物作为潜在 HIV-1 新型双重激活剂的设计、合成和生物学评价
DOI:10.1039/c8ra01216d
发表时间:2018-05-09
期刊:RSC ADVANCES
影响因子:3.9
作者:Ao, Mingtao;Pan, Zhenrui;Qian, Yuqing;Tang, Bowen;Feng, Zeming;Fang, Hua;Wu, Zhen;Chen, Jingwei;Xue, Yuhua;Fang, Meijuan
通讯作者:Fang, Meijuan
Design, synthesis, and biological evaluation of 5-((8-methoxy-2-methylquinolin-4-yl)amino)-1H-indole-2-carbohydrazide derivatives as novel Nur77 modulators
作为新型 Nur77 调节剂的 5-((8-甲氧基-2-甲基喹啉-4-基)氨基)-1H-吲哚-2-碳酰肼衍生物的设计、合成和生物学评价
DOI:10.1016/j.ejmech.2020.112608
发表时间:2020-10-15
期刊:EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:6.7
作者:Li, Baicun;Yao, Jie;Wu, Zhen
通讯作者:Wu, Zhen
DOI:10.1007/s10337-018-3652-8
发表时间:2018-11
期刊:Chromatographia
影响因子:1.7
作者:Wang Zheng;Xie Ting Ting;Yan Xia;Xue Shi;Chen Jing Wei;Wu Zhen;Qiu Ying Kun
通讯作者:Qiu Ying Kun
基于深海功能基因的活性化合物及其形成机制研究
  • 批准号:
    81273400
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    67.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    吴振
  • 依托单位:
源于深海热液烟囱和多金属结核区的抗肿瘤活性物质及化学生态学研究
  • 批准号:
    81072549
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万元
  • 批准年份:
    2010
  • 负责人:
    吴振
  • 依托单位:
国内基金
海外基金