基于CRISPR-Cas9基因编辑及微流控芯片系统研究噬菌体介导的肺炎克雷伯菌耐药性沉默机制

批准号:
81870010
项目类别:
面上项目
资助金额:
57.0 万元
负责人:
高占成
依托单位:
学科分类:
H0102.呼吸系统感染、炎症与免疫
结题年份:
2022
批准年份:
2018
项目状态:
已结题
项目参与者:
黄勇、尚颖、赵丽丽、李冉、王克强、李待兮、郑雅莉、郭亚涛、刘艳楠
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中文摘要
肺炎克雷伯菌(简称肺克)是临床上引起院内外感染的重要致病菌之一,其耐药性不断增强和广泛传播导致临床管理难度不断增大。本项目组前期研究发现泛耐药肺克基因组和质粒上同时携带多种类型抗生素抗性基因是其引起对抗菌药物耐药和导致难治性感染的主要原因,并通过改变超广谱β-内酰胺酶(ESBL)耐药基因操纵子元件可以沉默ESBL的耐药性,可消减肺克的耐药表型。本研究拟利用CRISPR-Cas9基因编辑技术,设计能够有效沉默其耐药表型的基因序列,以此构建携带此序列的肺克溶原性噬菌体耐药沉默转导体系,通过感染临床分离的全耐药肺克菌株,探讨其沉默肺克耐药性的效果和机制;其次,通过微流控芯片细菌耐药检测系统的体外实时监测结果及动物感染模型的体内辅助治疗作用,研究溶原性噬菌体耐药沉默转导体系消减和沉默肺克耐药性的能力及其对机体炎症反应的影响,从而为应对广泛耐药或全耐药肺克引起的难治性肺部感染提供新的路径和治疗策略。
英文摘要
Drug-resistant Kelebsiella pneumoniae (KP) is one of the major culprit pathogens causing refractory community-acquired and nosocomial infections with the advent of enhancement and extensive spread of its antibiotic resistant capacity. In previous research, we found that the chromosomes and plasmids of pan-drug resistant K. pneumoniae carried different types of antibiotic resistance genes, which mainly caused antibiotic resistance and intractable infections. In addition, our investigation data suggests that antibiotic resistance of Extended-Spectrum β-Lactamases (ESBL) could be silenced by modifying ESBL gene operon element and the antibiotic resistant phenotype of K. pneumoniae could be transformed as antibiotic sensitive status. In the current proposal project, optimizing sequences are applied to effectively silence drug-resistant phenotype with CRIPSR-Cas9 gene editing technology. Then, K. pneumoniae lysogenic phage carrying antibiotic resistance silencing system will be constructed to explore the efficiency and mechanism of silencing the drug-resistant phenotypes of K. pneumoniae. Furthermore, the capacity of lysogenic phage extinguishing and silencing antibiotic resistance and its adjuvant therapeutic traits will be validated by the drug-resistant microfluidic chip detection system in vitro and infected animal models in vivo respectively. This project will provide an innovative management pathway and strategies to deal with refractory pulmonary infections caused by extensive- or pan-drug resistant K. pneumoniae.
肺炎克雷伯菌是临床上引起院内外感染的重要致病菌之一,其耐药性不断增强导致广泛传播和临床管理难度增大。新抗生素发现越来越难,开发新的治疗策略具有广阔的应用前景。.本项目组前期研究发现泛耐药肺克基因组和质粒上同时携带多种类型抗生素抗性基因,是其引起抗菌药物耐药和导致难治性感染的主要原因。我们首先探讨了噬菌体解聚酶对肺炎克雷伯菌的辅助治疗作用。鉴于噬菌体靶向肺炎克雷伯菌具有菌株特异性,我们创新性地应用仿生纳米囊泡递送系统递送靶向耐药基因的CRISPR-Cas9质粒,该系统不仅可以应用于所有耐药性肺炎克雷伯菌,也可以应用于其它革兰氏阴性耐药菌,具有更广阔的应用前景。通过体外和体内实验,证实了该系统可以有效沉默肺炎克雷伯菌耐药基因并且逆转其耐药表型。这些研究为应对广泛耐药或全耐药肺炎克雷伯菌引起的难治性肺部感染提供新的路径和治疗策略。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Genomic characterization of an emerging Enterobacteriaceae species: the first case of co-infection with a typical pathogen in a human patient
新兴肠杆菌科物种的基因组特征:首例人类患者与典型病原体共同感染的病例
DOI:10.1186/s12864-020-6720-z
发表时间:2020-03
期刊:BMC Genomics
影响因子:4.4
作者:Zhang Zhao;Li Daixi;Shi Xing;Zhai Yao;Guo Yatao;Zheng Yali;Zhao Lili;He Yukun;Chen Yusheng;Wang Zhanwei;Su Jianrong;Kang Yu;Gao Zhancheng
通讯作者:Gao Zhancheng
Genetic factors related to the widespread dissemination of ST11 extensively drug-resistant carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae strains within hospital.
医院内ST11广泛耐药碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌广泛传播的遗传因素
DOI:10.1097/cm9.0000000000001101
发表时间:2020-11-05
期刊:Chinese medical journal
影响因子:6.1
作者:Li DX;Zhai Y;Zhang Z;Guo YT;Wang ZW;He ZL;Hu SN;Chen YS;Kang Y;Gao ZC
通讯作者:Gao ZC
Identification of Two Depolymerases From Phage IME205 and Their Antivirulent Functions on K47 Capsule of Klebsiella pneumoniae
噬菌体IME205中两种解聚酶的鉴定及其对肺炎克雷伯菌K47荚膜的抗毒作用
DOI:10.3389/fmicb.2020.00218
发表时间:2020-02-14
期刊:FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
影响因子:5.2
作者:Liu, Yannan;Leung, Sharon Shui Yee;Gao, Zhancheng
通讯作者:Gao, Zhancheng
Shared and Specific Lung Microbiota with Metabolic Profiles in Bronchoalveolar Lavage Fluid Between Infectious and Inflammatory Respiratory Diseases.
传染性和炎症性呼吸系统疾病的支气管肺泡灌洗液中共有和特定的肺微生物群及其代谢特征
DOI:10.2147/jir.s342462
发表时间:2022
期刊:Journal of inflammation research
影响因子:4.5
作者:He Y;Yu W;Ning P;Luo Q;Zhao L;Xie Y;Yu Y;Ma X;Chen L;Zheng Y;Gao Z
通讯作者:Gao Z
Characteristics of lower respiratory tract microbiota in the patients with post-hematopoietic stem cell transplantation pneumonia.
造血干细胞移植后肺炎患者下呼吸道微生物群特征
DOI:10.3389/fcimb.2022.943317
发表时间:2022
期刊:Frontiers in cellular and infection microbiology
影响因子:5.7
作者:
通讯作者:
基于组学与微流控芯片技术的肺炎克雷伯菌ESBL耐药表型发生与转换机制的研究
- 批准号:81470207
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:高占成
- 依托单位:
IFN-gamma转基因对小鼠哮喘模型治疗机制的研究
- 批准号:30370609
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:22.0万元
- 批准年份:2003
- 负责人:高占成
- 依托单位:
γ- 干扰素转基因控制哮喘气道炎性反应的分子作用机制
- 批准号:39800067
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:10.0万元
- 批准年份:1998
- 负责人:高占成
- 依托单位:
国内基金
海外基金
