鳄目现存23种，隶属3科8属；在分类及系统发生关系上历来争议很大，并集中在马来假食鱼鳄的分类地位及其与食鱼鳄的系统关系、鼍科中属间的亲缘关系、非洲狭吻鳄的分类地位、以及鼍属、食鱼鳄属等分歧时间等问题上。作为动物分子系统发生最有力的证据之一，线粒体基因组全序列是目前唯一能够从基因组水平上来分析动物系统发生的分子标记（Saccone，1999）；ZENK基因是一个可以用于分子系统发生研究的新的核基因分子标记（Chubb, 2004）。本项目将通过测定非洲狭吻鳄、食鱼鳄、马来假食鱼鳄、尼罗鳄、侏古鳄、黑鳄及骨喉鳄等6属7种鳄的线粒体基因组全序列并与已发表的扬子鳄等2属3种鳄的线粒体全序列进行比较，同时测定上述7种鳄及扬子鳄(鼍属)和凯门鳄(凯门鳄属)的ZENK基因序列，并进行分子系统分析，探讨并力争解决现存鳄类属间的分子系统发生关系、分类地位及分歧时间等问题上存在的争议。