扬子鳄（Alligator sinensis）是我国特有濒危物种。该物种的生物学研究已在多个层面上展开，繁殖行为学方面的研究却不够深入，对于扬子鳄生殖过程中性选择机制和交配制度等方面的研究仍属空白。本项目将分子生物学技术与行为生态学相结合，深入研究扬子鳄繁殖行为的相关机制，探究扬子鳄生殖过程中性选择机制和交配制度：通过繁殖行为观察、形态学测量并结合分子生物学手段，分析雌性鳄在配偶选择时是否将雄性体型特征作为择偶标准；通过对观察到发生交配行为的雌雄个体的MHC基因进行测序，分析扬子鳄存在选型交配的可能性；通过微卫星分子标记分析同窝卵孵化出的扬子鳄幼体的基因型，弄清扬子鳄的遗传婚配制度。在对扬子鳄生殖行为学深入研究的基础上，为制定扬子鳄的保护措施提供科学依据。