转运蛋白相关的代谢转运网络建立及其在肝脏疾病转运网络中的功能研究

批准号:
31171270
项目类别:
面上项目
资助金额:
50.0 万元
负责人:
曲红
依托单位:
学科分类:
C0608.生物数据资源与分析方法
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
曲大成、赵汗青、唐星、高华、陈燕明
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中文摘要
利用生物信息学和系统生物学工具,从基因家族与功能、遗传特性、调控模式、表达模式以及疾病相关性等方面对转运蛋白进行全面系统注释,并进一步对转运蛋白的宏观性质进行系统分析。通过对代谢通路中与转运蛋白密切相关的代谢物及其催化酶的收集整理,构建以转运蛋白为主要角色的代谢转运网络,为研究转运蛋白在与肝脏重要疾病相关的代谢网络中的作用打下基础,同时也可以建立一个可供高通量蛋白质组学检测的分子列表,以检测在特定生理或病理状态下转运蛋白与疾病的关联。结合转运蛋白在代谢转运网络中的作用分析,着重探讨与肝脏重要疾病相关的转运蛋白在代谢转运网络中受上下游调控的影响,为特定代谢疾病的研究带来新的思路,并为高通量的蛋白质组学肝脏疾病研究以及检测提供候选的靶标。
英文摘要
项目的背景:.至今为止人们都是针对单个转运蛋白或针对单个代谢通路来研究转运蛋白,并没有从全局系统地研究过某个物种或者某种细胞中的所有的转运蛋白。通过将转运蛋白在代谢网络中进行定位并构建以转运蛋白为主的代谢转运网络,进而挖掘代谢转运网络中的重要节点,以研究在特定生理或病理状态下转运蛋白与疾病的关联。..主要研究内容:.利用生物信息学和系统生物学工具,从基因家族与功能、遗传特性、调控模式、表达模式以及疾病相关性等方面对转运蛋白进行全面系统注释,构建以转运蛋白为主要角色的代谢转运网络。结合转运蛋白在代谢转运网络中的作用分析,着重探讨与疾病相关的转运蛋白在代谢转运网络中受上下游调控的影响,为特定代谢疾病的研究带来新的思路,并为癌症等疾病研究以及检测提供候选的靶标。..重要结果:.系统地整合和注释了转运蛋白的数据,对转运蛋白的宏观性质进行了系统的分析。.系统收集整理了转运蛋白有关的代谢物和催化酶,构建了以转运蛋白为主的代谢转运网络。.对疾病相关的转运蛋白在代谢转运网络中的作用以及受上下游调控的影响进行了研究。..关键数据及其科学意义:.在国内外高水平学术期刊上发表论文12篇,培养研究生3名。.通过系统地整合和注释转运蛋白的数据,从系统生物学的角度对转运蛋白进行了系统的分析。通过对代谢通路中与转运蛋白底物及其催化酶的收集整理,构建了以转运蛋白为主的代谢转运网络。通过对转运蛋白在代谢转运网络中的作用以及受上下游调控的影响的研究,为癌症等疾病研究以及检测提供候选的靶标。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
METSP: a maximum-entropy classifier based text mining tool for transporter-substrate identification with semistructured text.
METSP:基于最大熵分类器的文本挖掘工具,用于半结构化文本的转运蛋白底物识别
DOI:10.1155/2015/254838
发表时间:2015
期刊:BioMed research international
影响因子:--
作者:Zhao M;Chen Y;Qu D;Qu H
通讯作者:Qu H
DOI:10.1038/srep11459
发表时间:2015-06-23
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Zhao M;Kong L;Liu Y;Qu H
通讯作者:Qu H
IQdb: an intelligence quotient score-associated gene resource for human intelligence.
IQdb:人类智力的智商分数相关基因资源。
DOI:10.1093/database/bat063
发表时间:2013
期刊:Database : the journal of biological databases and curation
影响因子:--
作者:Kong L;Cheng L;Fan LY;Zhao M;Qu H
通讯作者:Qu H
DOI:10.1371/journal.pone.0076041
发表时间:2013
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Chen D;Jiang B;Xing J;Liu M;Cui M;Liu Y;Wang Z;Chen L;Yang H;Zhang C;Yao Z;Zhang N;Ji J;Qu H;Su X
通讯作者:Su X
DOI:10.1038/srep15478
发表时间:2015-10-21
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Zhao M;Li Z;Qu H
通讯作者:Qu H
Circular RNA作为竞争性内源RNA在癌症转移中的调控网络研究
- 批准号:31671375
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:60.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:曲红
- 依托单位:
国内基金
海外基金
