多重耐药鲍曼不动杆菌全基因组测序和“耐药岛”的比较基因组学分析
结题报告
批准号:
30970113
项目类别:
面上项目
资助金额:
36.0 万元
负责人:
俞云松
依托单位:
学科分类:
C0108.病原细菌学
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
魏泽庆、蒋琰、沈萍、季淑娟、张俊丽、符一骐、曲燕燕
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中文摘要
鲍曼不动杆菌具有强大的获得各类抗菌药物耐药基因的能力,对目前所有抗菌药物均可产生耐药。多重耐药鲍曼不动杆菌在世界范围的广泛流行,是目前最受关注的微生物耐药问题之一。我国是世界上多重耐药克隆流行极为严重的国家之一,许多省份均已出现播散和流行。当前,主要着眼于单一种类抗菌药物耐药机制的研究方法无法揭示鲍曼不动杆菌快速获得对几乎所有抗菌药物耐药性的机制,因此有必要通过快速发展的高通量测序技术和生物信息学技术深入全面了解鲍曼不动杆菌的耐药特性。本项目拟通过对鲍曼不动杆菌的全基因组测序,识别耐药基因聚集的"耐药岛"区域,发现新的耐药基因,并进行多个克隆多个地区的多重耐药鲍曼不动杆菌"耐药岛"的比较分析,从而揭示我国多重耐药鲍曼不动杆菌耐药基因的获得和传播机制。本项目的实现对我国多重耐药鲍曼不动杆菌的控制,提高我国耐药研究的技术水平,促进相关新技术的开发和应用等方面有重要意义。
英文摘要
鲍曼不动杆菌是临床常见致病菌,其多重耐药问题严重,我国也是世界上多重耐药克隆流行极为广泛的国家之一,亟需了解和阐明鲍曼不动杆菌的基因组背景和快速获得广谱耐药性的本质。本研究通过高通量测序平台完成了一株属于流行克隆复合体CC92的多重耐药鲍曼不动杆菌菌株MDR-ZJ06的全基因组测序工作,获得了3.99Mbp长度、编码3887个蛋白的基因组全序列和一个20kbp长度、编码29个蛋白的质粒。通过对全基因组序列的基本分析,阐明了MDR-ZJ06菌株与欧洲流行克隆II菌株的进化亲缘关系,并明确了碳青霉烯类耐药基因blaOXA-23的基因周围环境,发现blaOXA-23基因的水平转移和CC92克隆传播是我国鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类抗生素高耐药率的主要原因。通过多个鲍曼不动杆菌的比较基因组学分析,在我国流行克隆MDR-ZJ06基因组上发现一个长度为18kb、由15个基因组成的耐药岛,命名为AbaGI,此耐药岛在国内外均尚未报道。通过不同克隆型的菌株对该耐药岛进行相关性验证,证明此耐药岛AbaGI和鲍曼不动杆菌的多重耐药性直接相关。另外本研究在筛查blaOXA-23基因结构过程中,还发现了一株同时产B类金属酶blaSIM-1和D类碳青霉烯酶blaOXA-23的baylyi不动杆菌,显示了不动杆菌属细菌对耐药基因的强大整合能力。鲍曼不动杆菌MDR-ZJ06全序列是我国首个完成的临床流行克隆全基因组,耐药岛AbaGI的发现在国际上也尚属首次,对多重耐药鲍曼不动杆菌的分子流行病学研究意义重大。对基因组全序列的深入分析可以加深我们对鲍曼不动杆菌遗传背景的理解,方便我们探讨其多重耐药机制,为后续研究打下坚实基础。
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Genomic Analysis of the Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii Strain MDR-ZJ06 Widely Spread in China
中国广泛传播的多重耐药鲍曼不动杆菌MDR-ZJ06的基因组分析
DOI:10.1128/aac.01134-10
发表时间:2011-07
期刊:Antimicrobial Agents and Chemotherapy
影响因子:4.9
作者:Zhou, Hua;Zhang, Tongwu;Yu, Dongliang;Pi, Borui;Yang, Qing;Zhou, Jianying;Hu, Songnian;Yu, Yunsong
通讯作者:Yu, Yunsong
DOI:10.1128/aac.00425-11
发表时间:2011-08
期刊:Antimicrobial Agents and Chemotherapy
影响因子:4.9
作者:Zhi-hui Zhou;Xiaoxing Du;Li Wang;Qing Yang;Yi-qi Fu;Yunsong Yu
通讯作者:Zhi-hui Zhou;Xiaoxing Du;Li Wang;Qing Yang;Yi-qi Fu;Yunsong Yu
碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌新抗菌药物耐药及克隆演化机制研究
  • 批准号:
    U22A20338
  • 项目类别:
    联合基金项目
  • 资助金额:
    255.00万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
碳青霉烯耐药革兰阴性菌传播及耐药机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    国际(地区)合作与交流项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌耐药机制与毒力因子及其进化研究
  • 批准号:
    81830069
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    294.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
鲍曼不动杆菌基因组突变和移动元件在多重耐药形成中的作用
  • 批准号:
    31670135
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
鲍曼不动杆菌主要抗菌药物耐药机制研究
  • 批准号:
    81230039
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    280.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
中国产NDM-1超级细菌毒力及耐药传播分子机制研究
  • 批准号:
    31170130
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
碳青霉烯类抗生素耐药鲍曼不动杆菌MLST分型方法和分型数据库的建立
  • 批准号:
    30770116
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万元
  • 批准年份:
    2007
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
非发酵菌碳青霉烯类抗生素耐药机制研究
  • 批准号:
    30370073
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    20.0万元
  • 批准年份:
    2003
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
超广谱B-内酰胺酶编码基因及功能研究
  • 批准号:
    30270074
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2002
  • 负责人:
    俞云松
  • 依托单位:
国内基金
海外基金