作物RI群体NCIII和TTC设计的QTL作图法：理论方法、软件及应用

本课题经过三年研究，建立了作物RI群体NCIII设计的基于混合线性模型的加性-显性效应联合检测的QTL作图法，TTC设计的基于贝叶斯的全基因组QTL上位性作图方法和NCII设计的配合力QTL定位法。分别对这些方法进行了理论推导、程序编译、模拟数据和实例数据分析。这些方法的建立为杂种优势和配合力遗传基础的研究奠定了一定的基础。对基于RI群体NCIII设计下的两优良水稻杂交组合的9个农艺性状进行分析，研究表明，杂种优势和数量性状表型均受各种遗传效应尤其是上位性的影响，杂交组合不同、性状不同，各种遗传组分在性状的遗传基础中所占的比例也不同。对基于BCRIL群体NCII设计下水稻的9个农艺性状进行分析，结果表明：一般配合力（Gca）由多个QTL位点控制，gca-QTL散布在多个染色体的不同区段；用RIL和gca值能检测到相同的QTL，说明gca-QTL主要是加性效应；控制不同性状的gca-QTL，可能存在于相同的染色体区段或一因多效。