珍稀濒危植物马蹄参的亲缘地理学和分子系统学研究
批准号:
31270700
项目类别:
面上项目
资助金额:
63.0 万元
负责人:
王丽
依托单位:
学科分类:
林木遗传育种
结题年份:
2016
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
颜金鹏、刘新发、吴敏、文志、宋云澎
中文摘要
以濒危植物马蹄参(Diplopanax stachyanthus Hand. - Mazz.)为研究对象,通过测定核DNA和叶绿体DNA非编码区序列,以基因谱系方法研究其种群的遗传变异水平、遗传变异的分配状况和分化程度,探讨种群系统地理格局形成机制、系统发育关系和现有分布特征。根据核苷酸多样性、单倍型多样性和系统发育关系推测进化事件发生的时间。为保护和可持续利用该植物提供理论依据,为该植物遗传资源的保护和恢复提供基础资料。另外,由于该属植物系统位置存在争议,因此本项目拟筛选合适的序列,如nrDNA ITS、rbcL、trnL-F和trnS-G等,来分析五加科和山茱萸科植物尤其是木本植物的系统发育关系,期望借助分子系统学证据探讨马蹄参属植物的系统位置,同时结合形态和地理分布讨论该分类群的起源与系统演化关系。
英文摘要
Diplopanx stachyanthus, a rare species distributed across southern China will be investigated in this study. We aimed at addressing the questions on the formation of the genetic spatial patterns of the Diplopanx populations, and examining the phylogenetic relationship between taxa from Araliaceae and Cornaceae. The molecular population genetics approaches will by employed as described below. The coding and nonecoding genes including nrDNA, ITS, rbcL, trnL-F and trnS-G from the nuclear or chloroplast will be sequenced, to represent the genetic variation and genetic divergence among populations. The nucleotide polymorpholism and haplotype diversity, will be used in the phylogenetic infernces and divergence time estimation. This will not only help to clarify the phylogenetic relationship between the members from Araliaceae and Cornaceae, especially for the woody species, but also could shed light on the origin of the genera Diplopanx by integrating the molecular evidence and the information from morphology and distributional patterns. Our study will provide theoretical basis for conservation and sustainable exploitment, and additionally, for the conservation and recover of the genetic resources of the plants.
以马蹄参天然种群为研究对象,通过测定叶绿体DNA非编码区序列对其谱系地理学展开研究,结果表明,三个叶绿体序列共检测到16种单倍型,单倍型H7为祖先单倍型,为YBS(元宝山)和HP(花坪)居群共享,其余15个都为私有单倍型,总的遗传多样性(HT)和居群内平均遗传多样性(HS)都较高(HT = 0.963, HS = 0.653)。分子变异分析(AMOVA)结果表明马蹄参的遗传变异主要位于组间,存在显著的谱系地理结构(GST = 0.768, NST = 0.964, NST>GST, P < 0.05)和较低的居群间基因流(Nm = 0.05),遗传距离与地理距离没有显著的相关性。单倍型系统进化树和网络图具有相似的拓扑结构,16种单倍型可聚为东部,中部及西部三支,分化时间位于上新世和更新世。Bayesian skyline plots结果表明马蹄参有效群体减小的时间大约在30,000年前。根据马蹄参单倍型多样性、单倍型谱系结构特征和分化时间,推测其在亚热带地区存在多个冰期避难所。生境片段化和新生代以来的气候变化是影响马蹄参遗传变异及现今分布格局的主要因素。另外,由于马蹄参的系统位置存在争议,我们结合nrDNA和cpDNA目的基因对马蹄参进行分子系统学的研究,结果表明:ITS、trnL-trnF、matK和atpB-rbcL序列排列后的总长度分别为736 bp、1105 bp、973 bp和1448 bp,变异位点数分别为135、384、192和130,其中信息位点数分别为84、214、172和74。马蹄参无论在核基因(ITS)还是叶绿体基因(trnL-trnF、matK和atpB-rbcL)的联合分析中,都显示与广义山茱萸科植物聚在了一个分支,此分支的支持率分别为84%、86%。在核基因和叶绿体基因的联合系统树中也得到相似的结果,都表明马蹄参与单室茱萸属、珙桐、喜树和蓝果树有较近的亲缘关系。本研究支持将马蹄参置于广义山茱萸科的观点。
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The complete mitochondrial genome sequence of Heliconius hecale (Insecta: Lepidoptera: Nymphalidae)
Heliconius hecale 的完整线粒体基因组序列(昆虫纲:鳞翅目:蛱蝶科)
DOI:
10.3109/19401736.2014.945561
发表时间:
2016-03
期刊:
Mitochondrial DNA
影响因子:
--
作者:
[Qing-Qing Shen, Li Wang]
通讯作者:
Li Wang
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
生态学杂志
影响因子:
--
作者:
[王丽, 王效科, 李丽, 崔健]
通讯作者:
崔健
The complete chloroplast genome sequence of the evergreen plant Dendropanax dentiger (Araliaceae)
常绿植物 Dendropanax dentiger(五加科)的完整叶绿体基因组序列
DOI:
10.3109/19401736.2014.1003909
发表时间:
2016-11
期刊:
Mitochondrial DNA
影响因子:
--
作者:
[Li Wang, Xia-Jin Du, XiaoFeng Li]
通讯作者:
XiaoFeng Li
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
西北植物学报
影响因子:
--
作者:
[文志, 孙名皓, 沈昱, 黎啸峰]
通讯作者:
黎啸峰
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
湖南师范大学自然科学学报
影响因子:
--
作者:
[杜夏瑾, 黎啸峰, 吴敏, 王丽]
通讯作者:
王丽
基于Ti3AlC相调控的高温TiAl合金设计及蠕变性能优化
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批准号:2026JJ50038
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项目类别:省市级项目
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资助金额:0.0万元
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批准年份:2026
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负责人:王丽
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依托单位:
花岗伟晶岩粗粒石英浮选过程的界面反应性调控机制研究
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:54万元
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批准年份:2022
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负责人:王丽
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依托单位:
铝硅酸盐矿物浮选界面组装化学
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批准号:2021JJ20064
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项目类别:省市级项目
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资助金额:0.0万元
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批准年份:2021
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负责人:王丽
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依托单位:
高铌TiAl 合金中碳化物稳定性以及强化机制的研究
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批准号:2021JJ40761
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项目类别:省市级项目
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资助金额:0.0万元
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批准年份:2021
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负责人:王丽
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依托单位:
新型多组元CoNi基高温合金γ′相稳定性以及变形机制的研究
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批准号:52001334
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2020
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负责人:王丽
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依托单位:
低品位氧化锌矿浮选体系中矿物交互作用及界面性质转化调控机制研究
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批准号:2020JJ5749
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项目类别:省市级项目
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资助金额:0.0万元
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批准年份:2020
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负责人:王丽
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依托单位:
药剂组装缔合体形成与调控机制及在云母型稀有金属资源浮选中的应用
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批准号:51974365
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项目类别:面上项目
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资助金额:57.0万元
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批准年份:2019
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负责人:王丽
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依托单位:
层状铝硅酸盐矿物表面活性位点对组合捕收剂界面组装的影响机制
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批准号:51704329
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:25.0万元
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批准年份:2017
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负责人:王丽
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依托单位:
中国特有属马蹄参属植物的胚胎学和保护遗传学研究
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批准号:30800088
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:19.0万元
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批准年份:2008
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负责人:王丽
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依托单位:
国内基金
海外基金