课题基金 / 基金详情

水稻体内与水稻条纹病毒侵染相关的新miRNA鉴定与分析

批准号:
31101414
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
24.0 万元
负责人:
燕飞
依托单位:
学科分类:
植物病理学
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
林林、程晔、鲁宇文、彭杰军、吴根土、姜珊珊

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
miRNA是生物体内对基因表达起调控作用的20-24nt小RNA。近年研究表明,植物病毒侵染能够导致寄主miRNA表达变化。针对水稻病毒,国内科学家目前已开展了基于miRNA芯片的水稻miRNA表达谱分析,然而对水稻体内是否存在与病毒侵染相关、但目前尚未报道的新miRNA,还不清楚,我们拟对此开展工作。项目前期工作已获得病毒侵染前后的水稻小RNA序列数据库,并通过分析其中病毒基因组来源的siRNA,建立了海量序列的数据分析平台。目前已利用该平台获得部分差异表达的小RNA序列,初步分析发现有19条小RNA的前体具有类似pre-miRNA的发夹结构,推测其中可能包括了未知的新miRNA。本项目将继续分析预测具有前体结构的小RNA,并对这些小RNA进行表达验证、靶基因分析、切割位点分析,以及候选miRNA在水稻体内的超表达、下调表达后的水稻表型分析,最终确定新miRNA并了解其功能。
英文摘要
课题完成预期研究内容,发现23条新产生于19条水稻已知miRNA前体的新miRNA序列,7条产生于新前体的miRNAs;获得了33个超表达特定miRNA的水稻、2个miRNA特异性下调的水稻;其中osa-miR171b超表达水稻生育期延长,而同时体内的赤霉素(GA)合成相关基因在水稻萌发期,秧苗期和分蘖期大多低于对照植株,而在抽穗期却明显高于对照植株,推测osa-miR171b通过调节GA途径而导致了相关表型的出现,而osa-miR171b功能抑制的植株表现出植株矮小、分蘖减少和不结实的表型,这与RSV侵染后的水稻症状表现相一致,我们推测RSV侵染后miR171b表达下调可能参与了RSV侵染后病症的发生。对一条新miRNA(nmiR119)开展深入研究工作发现,RSV侵染导致其表达轻微上调,超表达水稻增强对RSV的敏感性,但水稻体内的RSV RNA积累水平却没有明显增多,而nmiR119功能抑制的植株同样表现出对RSV的敏感,并且病毒RNA积累量处于极低水平。推测nmiR119在水稻体内的正常表达可能是水稻对抗RSV侵染必需的分子之一,其表达水平的改变导致植株对RSV极度敏感。要揭示nmiR119的功能细节,可能还需要结合靶基因的研究来做深入分析。与此同时,为方便开展miRNA功能研究,我们还建立了一种构建人工miRNA的简易方法和一种基于病毒表达抑制miRNA功能的方法,促进了相关工作的开展。研究发表SCI论文5篇。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI: 10.1371/journal.pone.0046443
发表时间: 2012
期刊: PloS one
影响因子: 3.7
作者: [Guo W, Wu G, Yan F, Lu Y, Zheng H, Lin L, Chen H, Chen J]
通讯作者: Chen J
DOI: 10.1016/j.jbiotec.2012.02.015
发表时间: 2012-08
期刊: Journal of biotechnology
影响因子: 4.1
作者: [Fei Yan;Yuwen Lu;Gentu Wu;Jiejun Peng;Hongying Zheng;Lin Lin-Lin;Jianping Chen]
通讯作者: Fei Yan;Yuwen Lu;Gentu Wu;Jiejun Peng;Hongying Zheng;Lin Lin-Lin;Jianping Chen
DOI: 10.1016/j.virusres.2013.04.009
发表时间: 2013-07
期刊: Virus research
影响因子: 5
作者: [Gentu Wu;Yuwen Lu;Hongying Zheng;Lin Lin-Lin;Fei Yan;Jianping Chen]
通讯作者: Gentu Wu;Yuwen Lu;Hongying Zheng;Lin Lin-Lin;Fei Yan;Jianping Chen
DOI: 10.1002/biot.201300523
发表时间: 2014-05
期刊: Biotechnology journal
影响因子: 4.7
作者: [Fei Yan;Weixia Guo;Gentu Wu;Yuwen Lu;Jiejun Peng;Hongying Zheng;Lin Lin-Lin;Jianping Chen]
通讯作者: Fei Yan;Weixia Guo;Gentu Wu;Yuwen Lu;Jiejun Peng;Hongying Zheng;Lin Lin-Lin;Jianping Chen
eIF4A基因在水稻条纹病毒侵染过程中的作用机制研究
  • 批准号:
    31772239
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    燕飞
  • 依托单位:
国内基金
海外基金