西瓜果肉质地相关基因精细定位与功能预测

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31772333
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1506.蔬菜与瓜果生长发育
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Due to the continuous improvement of modern life and fruit market globalization, the quality requirements for watermelon people and increasing attention as the texture of fruit quality of watermelon and an important component of the evaluation index, directly affects the fruit taste, storage and transport, so by the fruit industry attention. Watermelon fruit flesh is a quantitative trait controlled by multiple genes, which is the result of the interaction of genotype and environment. In this study, 300 different types of watermelon as the research object, carries on the preliminary positioning related to watermelon texture gene by GWAS method, the difference of cultivated watermelon fruit texture significantly and sticky watermelon preparation of F2 populations (>3000 strain), and re sequencing of two parent materials, combined with high-throughput SNP genotyping means to complete the fine mapping of the target gene; at the same time 10 servings of fruit texture of watermelon materials of different developmental stages of the cell structure, chemical composition and transcriptome analysis, through correlation analysis, gene mining and watermelon fruit texture formation and control network; and the key gene function identification. The study aimed to provide the basis for further study on the formation mechanism of watermelon flesh texture and the improvement of watermelon quality.
由于现代生活水平的不断提高和果品市场全球化进程的加快,人们对西瓜的品质要求和关注度不断提高,其中质地作为西瓜果实品质的重要组成部分和评价指标,直接影响果实的口感、贮藏与运输。.西瓜果肉质地是多基因调节的数量性状,其变化是基因型和环境共同作用的结果,受众多基因和代谢网络的共同调控。.本研究以300份不同类型西瓜为研究对象,通过GWAS方法对与西瓜质地相关基因进行初步定位,将果肉质地差异极显著的栽培西瓜和黏籽西瓜配制F2分离群体(>3000株),并对两亲本材料进行重测序,结合高通量SNP基因分型手段完成目标基因的精细定位;同时进行10份果肉质地有代表性的西瓜材料不同发育阶段的细胞组织结构、理化成分和转录组分析,通过相关性分析,挖掘与西瓜果肉质地形成的基因及调控网络;并进行关键基因功能鉴定。为进一步探明西瓜果肉质地形成机理以及改良西瓜品质提供依据。

结项摘要

本研究利用软果肉栽培西瓜品系“W1-1”和硬果肉黏籽西瓜品系“PI186490”开展西瓜中心果肉硬度主效基因精细定位及候选基因分析等研究,以“W1-1”为母本,“PI186490”为父本,构建六世代群体,分析中心果肉硬度遗传规律,通过BSA-seq和构建遗传连锁图谱,定位控制西瓜中心果肉硬度的主效基因。同时测量6份不同果肉质地西瓜品种不同发育时期中心果肉质地参数、细胞壁物质含量、激素含量、细胞大小及排列和基因表达水平,并结合定位结果,鉴定目标区段内候选基因,对候选基因进行克隆,以期为西瓜中心果肉硬度分子标记辅助选择育种和西瓜果肉质地种质改良奠定理论基础,加快育种进程。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ClaMADS12基因克隆及在西瓜果实发育中的表达特性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    分子植物育种
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘钰彤;高忠琦;张晏航;孙蕾;朱子成;刘宏宇;王学征
  • 通讯作者:
    王学征
Linkage Mapping and Comparative Transcriptome Analysis of Firmness in Watermelon (Citrullus lanatus)
西瓜 (Citrullus lanatus) 硬度的连锁图谱和比较转录组分析
  • DOI:
    10.3389/fpls.2020.00831
  • 发表时间:
    2020-06-16
  • 期刊:
    FRONTIERS IN PLANT SCIENCE
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Sun, Lei;Zhang, Yushu;Wang, Xuezheng
  • 通讯作者:
    Wang, Xuezheng
甜瓜属FRK基因家族的鉴定与特征分析
  • DOI:
    10.13271/j.mpb.017.004954
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    分子植物育种
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    徐雅菲;孙宇蛟;崔浩楠;王学征
  • 通讯作者:
    王学征
西瓜PME基因生物信息学分析及克隆
  • DOI:
    10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2021.04.004
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    东北农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王学征;李钰婷;张博;张雨桐;张晏航;韩文灏;朱子成;刘识;刘宏宇
  • 通讯作者:
    刘宏宇
Genome-Wide Analysis of the Peroxidase Gene Family and Verification of Lignin Synthesis-Related Genes in Watermelon.
西瓜过氧化物酶基因家族的全基因组分析及木质素合成相关基因的验证
  • DOI:
    10.3390/ijms23020642
  • 发表时间:
    2022-01-07
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Yang T;Zhang P;Pan J;Amanullah S;Luan F;Han W;Liu H;Wang X
  • 通讯作者:
    Wang X

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其他文献

甜瓜抗枯萎病和白粉病育种研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    生物技术通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邱果;王学征
  • 通讯作者:
    王学征
Controlling fusarium wilt disease in melon (Cucumis melo L.) using tillered onion bulb exteact
利用分蘖洋葱鳞茎提取物防治甜瓜枯萎病(Cucumis melo L.)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Pakistan Journal of Botany
  • 影响因子:
    1.2
  • 作者:
    张裕舒;邱果;王学征
  • 通讯作者:
    王学征
EMS诱变西瓜种子条件分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    东北农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王学征;朱娜娜;高清宇
  • 通讯作者:
    高清宇
外源物质诱导对甜瓜枯萎病抗性和防御酶活性的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    北方园艺
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘璐;孙蕾;王学征
  • 通讯作者:
    王学征
西瓜果实几个性状的QTL分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    果树学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈欣;栾非时;王学征;姜羽
  • 通讯作者:
    姜羽

其他文献

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王学征的其他基金

甜瓜枯萎病抗性基因Fom-2作用的分子机制研究
  • 批准号:
    31372088
  • 批准年份:
    2013
  • 资助金额:
    82.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
甜瓜枯萎病抗性基因的克隆、亚细胞定位和功能研究
  • 批准号:
    31000917
  • 批准年份:
    2010
  • 资助金额:
    21.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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