纤维素酶催化纤维素水解反应的理论研究

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基本信息

  • 批准号：
    20803048
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    19.0万
  • 负责人：
    徐定国
  • 依托单位：
    四川大学
  • 学科分类：
    B0301.化学理论与方法
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

开展纤维素酶催化木质纤维素水解反应的理论研究，在原子级别讨论生物酶催化生物能源转换的过程具有非常重要的科学意义和实际意义。这一水解过程是生物能源转化过程的关键步骤，而生物质能的利用是一项具有国家战略意义的任务。计算生物化学方法目前已经广泛应用于研究复杂生物体系的行为，并且在生物制药方面取得了很大的成就，但在生物质能方面还没有得到很好的利用。本课题的中心任务在于利用计算生物化学方法研究纤维素酶催化纤维素水解反应机理的研究，来最终解决纤维素水解效率低的关键问题。首先用分子动力学模拟方法将讨论纤维素分子与纤维素酶相互作用的模型，然后用混和量子力学与分子力学方法(QM/MM)计算反应的势能面及反应自由能势垒，得到反应的具体进程，最后用蛋白质工程研究提出纤维素酶改进的方案。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（9）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
L1 β-Lactamase催化反应机理研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    高等学校化学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    徐定国;鄢国森
  • 通讯作者：
    鄢国森
QM/MM Studies of Monozinc beta-Lactamase CphA Suggest That the Crystal Structure of an Enzyme-Intermediate Complex Represents a Minor Pathway
单锌 β-内酰胺酶 CphA 的 QM/MM 研究表明酶中间体复合物的晶体结构代表了次要途径
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Journal of Americal Chemical Society
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Wu, Shanshan;Guo, Hua;Xu, Dingguo
  • 通讯作者：
    Xu, Dingguo
Quantum mechanical/molecular mechanical study of anthrax lethal factor catatalysis
炭疽致死因子催化的量子力学/分子力学研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Theoretical Chemistry Accounts
  • 影响因子：
    1.7
  • 作者：
    Zhenxiao Yang;Christopher R. Smith;Hua Guo;Gregory K. Smith;Dingguo Xu
  • 通讯作者：
    Dingguo Xu

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其他文献

鸟嘌呤红外光谱的密度泛函理论研究- - -标度量子力学(SQM)力场处理
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    高等学校化学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    薛英;徐定国;谢代前;鄢国森
  • 通讯作者：
    鄢国森

其他文献

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相似国自然基金

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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