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猪2号染色体上背膘厚日增重QTL重叠区TEF1-MyoD1-CSRP3基因功能研究

批准号:
30771536
项目类别:
面上项目
资助金额:
30.0 万元
负责人:
刘榜
依托单位:
学科分类:
家畜种质资源与遗传育种学
结题年份:
2010
批准年份:
2007
项目状态:
已结题
项目参与者:
徐学文、彭勇波、邢双、邱海芳、孙玲

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项目成果

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中文摘要
在猪2号染色体上背膘厚日增重QTL重叠区域(55-67cM)选择申请者在该区域定位的两个基因(TEF1和CSRP3)及与之连锁的MyoD1基因为候选基因,开展以下工作:(1)在参考家系中检测3个基因的SNPs,并构建遗传连锁图;(2)用染色质免疫共沉淀(ChIP)法钓取TEF1转录因子的靶序列,结合荧光素酶报告系统和EMSA验证ChIP结果,分离鉴定4-6个靶基因;(3)克隆CSRP3基因的启动子并检测其活性;(4)初步揭示TEF1、CSRP3、MyoD1之间的基因表达调控通路;(5)检测3个候选基因和4-6个靶基因的SNPs并进行其与性状的关联分析;(6)综合3基因间基因表达调控通路的揭示与关联分析等结果初步阐述基因的功能。研究结果将为这些基因及重叠区内其他基因的更深入一步的功能研究奠定基础,为标记辅助选择增添新的标记,故有重要的学术价值与应用前景。
英文摘要
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI: --
发表时间: --
期刊: 湖北大学学报(自然科学版)
影响因子: --
作者: [樊斌, 徐学文, 邱海芳, 刘榜]
通讯作者: 刘榜
Cloning, chromosomal localization, expression profile and association analysis of the porcine WNT10B gene with backfat thickness
猪WNT10B基因的克隆、染色体定位、表达谱及与背膘厚的关联分析
DOI: 10.1007/s11033-010-9978-4
发表时间: 2011-06
期刊: Molecular Biology Reports
影响因子: 2.8
作者: [Liu, Bang, He, Xiaoping, Liu, Chuxin, Fan, Bin, Gao, Hui]
通讯作者: Gao, Hui
Porcine CSRP3: polymorphism and association analyses with meat quality traits and comparative analyses with CSRP1 and CSRP2
猪CSRP3:与肉质性状的多态性和关联分析以及与CSRP1和CSRP2的比较分析
DOI: 10.1007/s11033-009-9632-1
发表时间: 2009
期刊: Molecular Biology Reports
影响因子: 2.8
作者: [Fan, Bin, Yuan, Fan, Xu, Xuewen, Du, Zhi-Qiang, Liu, Bang, Qiu, Haifang, Rothschild, Max F.]
通讯作者: Rothschild, Max F.
Mapping and expression analyses during porcine foetal muscle development of 12 genes involved in histone modifications
猪胎儿肌肉发育过程中涉及组蛋白修饰的 12 个基因的定位和表达分析
DOI: 10.1111/j.1365-2052.2008.01818.x
发表时间: 2009-04-01
期刊: ANIMAL GENETICS
影响因子: 2.4
作者: [Peng, Y. B., Yerle, M., Liu, B.]
通讯作者: Liu, B.
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    基于PRRSV人工感染资源群体解析猪蓝耳病抗病性状的遗传基础
    • 批准号:
      31930104
    • 项目类别:
      重点项目
    • 资助金额:
      299.0万元
    • 批准年份:
      2019
    • 负责人:
      刘榜
    • 依托单位:
    中外猪品种4个候选基因的CNVs差异验证、边界鉴定及其在NF-кB通路中的免疫功能研究
    • 批准号:
      31572374
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      63.0万元
    • 批准年份:
      2015
    • 负责人:
      刘榜
    • 依托单位:
    猪拷贝数变异(CNVs)的全基因组发掘及肌肉生长相关基因的鉴定
    • 批准号:
      31072012
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      40.0万元
    • 批准年份:
      2010
    • 负责人:
      刘榜
    • 依托单位:
    在体外骨骼肌卫星细胞中研究猪差异表达新基因CMYA1 的功能
    • 批准号:
      30571007
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      23.0万元
    • 批准年份:
      2005
    • 负责人:
      刘榜
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金