蛋白质疏水电荷诱导色谱置换剂的多尺度分子设计
批准号:
20976126
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
孙彦
依托单位:
学科分类:
生物化工与合成生物工程
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
张麟、袁毅、赵国凤、黄波、吴韡、张娜、余林玲
中文摘要
疏水电荷诱导置换色谱是基于疏水电荷诱导色谱(HCIC)的置换色谱模式,具有高容量、高分辨率、易于介质再生和盐浓度操作范围宽等优点,具有广阔的应用前景。但置换剂是制约置换色谱发展的核心问题,目前尚无有效的置换剂设计理论和方法。针对此关键问题,本项目以建立HCIC置换剂的多尺度分子设计方法为目标,利用分子对接、分子动力学模拟、微观检测和宏观色谱实验等方法开展系统研究,在分子尺度上展示置换剂-配基-蛋白质之间相互作用的分子机理,探索置换剂设计的关键因素及其影响规律;在微观尺度上展示单粒子置换色谱过程,揭示置换色谱的微观机理;在宏观尺度上研究置换剂的实际分离效能及其影响因素,建立完整的HCIC置换剂的多尺度分子设计方法,进行高效置换剂的开发设计并应用于蛋白质的置换色谱分离纯化。本研究所建立的方法和理论不仅可推进基于HCIC的置换色谱发展,对其他置换色谱模式的发展和应用也将具有重要指导意义。
英文摘要
疏水电荷诱导置换色谱是基于疏水电荷诱导色谱(HCIC)的置换色谱模式,具有高容量、高分辨率、易于介质再生和盐浓度操作范围宽等优点,应用前景广阔。但置换剂是制约置换色谱发展的核心问题。本项目以建立HCIC置换剂的筛选方法为目标,开展了置换色谱过程的多尺度研究。首先利用分子动力学模拟研究了蛋白质表面吸附和解离行为,包括配基密度、配基分布和溶液条件等因素的影响。同时,构建了蛋白质的HCIC置换色谱的粗粒化模型,修正了力场参数,为介质表面理性设计和操作参数优化奠定了基础;进而建立了基于置换剂-固定化配基分子对接的置换剂虚拟筛选方法,以5-氨基吲哚为目标配基,从1800余种化合物中筛选得到了多种潜在置换剂,并利用激光扫描共聚焦显微镜(CLSM)在微观尺度上研究单粒子HCIC置换色谱过程,揭示了置换剂和蛋白质吸附作用和传质动力学影响置换色谱行为的微观机理;最后,利用CLSM研究了双组分蛋白质置换色谱的动态过程,在粒子水平上证明诱导盐浓度效应的存在,揭示了共吸附组分性质对等速置换列的显著影响。本项目研究成果对高效置换剂开发和蛋白质置换色谱发展具有重要理论意义。成果发表学术论文18篇,其中SCI收录17篇。
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Modification of Martini force field for molecular dynamics simulation of hydrophobic charge induction chromatography of lysozyme.
马蒂尼力场的修改用于溶菌酶疏水电荷诱导色谱的分子动力学模拟。
DOI:
10.1016/j.jmgm.2011.02.004
发表时间:
2011-06
期刊:
Journal of Molecular Graphics and Modelling
影响因子:
2.9
作者:
[Lin Zhang, Shu Bai, Yan Sun]
通讯作者:
Yan Sun
DOI:
10.1016/j.bej.2009.12.003
发表时间:
2010-02
期刊:
Biochemical Engineering Journal
影响因子:
3.9
作者:
[Lin Zhang;Y. Sun]
通讯作者:
Lin Zhang;Y. Sun
Molecular basis of the initial platelet adhesion in arterial thrombosis: Molecular dynamics simulations
动脉血栓形成中初始血小板粘附的分子基础:分子动力学模拟
DOI:
10.1016/j.jmgm.2012.04.002
发表时间:
2012-07-01
期刊:
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING
影响因子:
2.9
作者:
[Li, Jian, Zhang, Lin, Sun, Yan]
通讯作者:
Sun, Yan
DOI:
10.1016/j.seppur.2011.09.002
发表时间:
2011-10
期刊:
Separation and Purification Technology
影响因子:
8.6
作者:
[Guofeng Zhao;Lin Zhang;S. Bai;Y. Sun]
通讯作者:
Guofeng Zhao;Lin Zhang;S. Bai;Y. Sun
Molecular mechanism of the effects of salt and pH on the affinity between protein A and human immunoglobulin G1 revealed by molecular simulations
分子模拟揭示盐和pH对蛋白A与人免疫球蛋白G1亲和力影响的分子机制
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
Journal of Physical Chemistry B Materials
影响因子:
--
作者:
[Bo Huang, Fufeng Liu, Xiaoyan Dong, Yan Sun]
通讯作者:
Yan Sun
共 18 条
亚10纳米马达的设计及其对蛋白质聚集反应的调控作用
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:60万元
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批准年份:2021
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负责人:孙彦
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依托单位:
聚合物配基接枝表面蛋白质吸附和传质行为的微观解析
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批准号:21878222
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项目类别:面上项目
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资助金额:65.0万元
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批准年份:2018
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负责人:孙彦
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依托单位:
纳米马达对蛋白质聚集和解聚反应过程的调控与强化
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批准号:91634119
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项目类别:重大研究计划
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资助金额:67.0万元
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批准年份:2016
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负责人:孙彦
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依托单位:
静电排斥调控蛋白质复性的分子机理和应用
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批准号:21376173
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项目类别:面上项目
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资助金额:80.0万元
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批准年份:2013
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负责人:孙彦
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依托单位:
蛋白质色谱过程界面分子行为的解析和应用
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批准号:21236005
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项目类别:重点项目
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资助金额:300.0万元
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批准年份:2012
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负责人:孙彦
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依托单位:
新型高效蛋白质组学微柱电色谱方法的研究
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批准号:20776105
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项目类别:面上项目
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资助金额:28.0万元
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批准年份:2007
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负责人:孙彦
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依托单位:
蛋白质分离过程的分子工程理论与方法
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批准号:20636040
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项目类别:重点项目
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资助金额:190.0万元
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批准年份:2006
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负责人:孙彦
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依托单位:
蛋白质离子交换吸附平衡的多尺度方法学研究
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批准号:20476082
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项目类别:面上项目
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资助金额:23.0万元
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批准年份:2004
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负责人:孙彦
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依托单位:
新型双分散孔色谱介质及流通色谱理论研究
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批准号:20276051
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项目类别:面上项目
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资助金额:21.0万元
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批准年份:2002
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负责人:孙彦
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依托单位:
亲和反胶团分配层析的基础研究
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批准号:29876030
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项目类别:面上项目
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资助金额:12.0万元
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批准年份:1998
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负责人:孙彦
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依托单位:
多级亲和过滤过程的基础工学研究
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批准号:29576258
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项目类别:面上项目
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资助金额:9.0万元
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批准年份:1995
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负责人:孙彦
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依托单位:
应用配位体修饰的脂质体为担体进行酶的亲和分离的研究
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批准号:29100031
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:5.0万元
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批准年份:1991
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负责人:孙彦
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依托单位:
国内基金
海外基金