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利用大规模测序技术研究水稻条纹病毒的群体结构
结题报告
批准号:
31272015
项目类别:
面上项目
资助金额:
85.0 万元
负责人:
吴建祥
依托单位:
学科分类:
C1401.植物病理学
结题年份:
2016
批准年份:
2012
项目状态:
已结题
项目参与者:
徐毅、卢莉娜、胡涛、车静、王震成、宋西娇
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中文摘要
水稻条纹病毒引起的水稻条纹叶枯病严重影响我国水稻生产,而水稻条纹病毒群体变异进化规律的阐明对该水稻病毒病的防治具有重要意义。本项目在已有水稻条纹病毒研究结果的基础上,拟首次用植物病毒生物学、Solexa deep-sequencing大规模测序及生物信息学等技术建立水稻条纹病毒在寄主水稻及非寄主本氏烟植物中群体变异进化的研究体系,分析水稻条纹病毒在寄主植物和非寄主植物中的群体变异进化及不同寄主对水稻条纹病毒变异进化的生物学作用,分析RSV的起源与分子变异进化机制,揭示水稻条纹病毒群体变异进化规律,从而为阐明水稻条纹叶枯病发生流行的灾变机制、培育抗病品种及防治该水稻病毒病提供理论依据,并可填补水稻条纹病毒在该研究领域的空白。
英文摘要
Rice stripe virus disease caused by Rice stripe virus (RSV) has brought severe damage to rice production in China. Elucidation of rules of variation and evolution of RSV population had important significance for the prevention and cure of RSV. Based on the existing research results of RSV, the project plans to establish research systems of variation and evolution of RSV population in rice and N. benthamiana plants using technology of plant virus biology, large-scale solexa deep-sequencing and biologica informatics. The project plans to analyze variation and evolution of RSV population in host and non-host plants and effects of different hosts on biologica function of the variation and evolution of RSV, and the origin and the mechanism of molecular variation and evolution of RSV. The project further plans to disclose the rule of the variation and evolution of RSV population. Sequentially, the research results can provide theory bases for elucidating the disaster change mechanism of occurrence and prevalence of rice stripe virus disease, breeding anti-RSV rice varieties and preventing and curing the rice virus disease. The research results also can supply the lack in this research field of rice stripe virus.
用植物病毒生物学、Solexa deep-sequencing大规模测序及生物信息学等技术建立了水稻条纹病毒在寄主水稻及非寄主本氏烟植物中群体变异进化的研究体系,分析水稻条纹病毒在寄主植物和非寄主植物中的群体变异进化及不同寄主对水稻条纹病毒变异进化的生物学作用。水稻条纹病毒在寄主水稻和非寄主本氏烟中连续继代接种至11代,对初代和第11代水稻及初代、第2代和第11代本氏烟中RSV的群体进行大规模全基因组测序,生物信息学比较RSV在两种植物上群体结构的变化。结果发现,RSV变异主要采用点突变和插入缺失的变异方式,点突变发生比较均匀,而插入缺失变异主要发生在基因间隔区和5’和3’端的非编码区。RSV群体在水稻和本氏烟连续传代后碱基替换概率及替换类型没有明显不同,且插入缺失突变没有明显规律,但插入片段的序列均来自病毒本身。RSV在水稻中传播11代后病毒的致病性和遗传多样性差异都不大,而RSV在本氏烟中传播11代后病毒的致病性增强,碱基替换发生的频率和同义非同义替换水平明显高于在水稻寄主中的RSV,遗传多样性提高,且病毒RNA1编码的RdRP上6个核苷酸位点和RNA4编码的MP上1543位点发生替换突变能稳定遗传。这些水稻条纹病毒群体变异进化规律的揭示为阐明水稻条纹叶枯病发生流行的灾变机制、培育抗病品种及防治该水稻病毒病提供新的理论依据。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Monoclonal antibody-based serological methods for maize chlorotic mottle virus detection in China
基于单克隆抗体的中国玉米褪绿斑驳病毒检测血清学方法
DOI:10.1631/jzus.b1200275
发表时间:2013-07
期刊:Journal of Zhejiang University-Science B
影响因子:5.1
作者:Liu, Huan;Qian, Ya-juan;Xie, Yan;Zhou, Xue-ping
通讯作者:Zhou, Xue-ping
Genetic variability and evolution of rice stripe virus
水稻条纹病毒的遗传变异和进化
DOI:10.1631/jzus.b1300014
发表时间:2013-10-01
期刊:JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY-SCIENCE B
影响因子:5.1
作者:Huang, Ling-zhe;Rao, Li-xia;Wu, Jian-xiang
通讯作者:Wu, Jian-xiang
Rice Stripe Tenuivirus Nonstructural Protein 3 Hijacks the 26S Proteasome of the Small Brown Planthopper via Direct Interaction with Regulatory Particle Non-ATPase Subunit 3
稻条细病毒非结构蛋白 3 通过与调节颗粒非 ATP 酶亚基 3 直接相互作用劫持小褐飞虱的 26S 蛋白酶体
DOI:10.1128/jvi.03055-14
发表时间:2015-02
期刊:Journal of Virology
影响因子:5.4
作者:Fu, Shuai;Li, Chenyang;Zhu, Zeng-Rong;Zhou, Xueping
通讯作者:Zhou, Xueping
Development and use of three monoclonal antibodies for the detection of rice black-streaked dwarf virus in field plants and planthopper vectors.
三种单克隆抗体的开发和使用,用于检测田间植物和飞虱媒介中的水稻黑条矮缩病毒
DOI:10.1186/1743-422x-10-114
发表时间:2013-04-10
期刊:Virology journal
影响因子:4.8
作者:Wu J;Ni Y;Liu H;Rao L;Zhou Y;Zhou X
通讯作者:Zhou X
DOI:--
发表时间:2017
期刊:Journal of Integrative Agriculture
影响因子:4.8
作者:Chen Zhe;Zhang Minghao;Zhou Xueping;Wu Jianxiang
通讯作者:Wu Jianxiang
自噬在灰飞虱与水稻黑条矮缩病毒互作中的作用机制
  • 批准号:
    31972234
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    吴建祥
  • 依托单位:
水稻黑条矮缩病毒P6蛋白与水稻的分子互作机制
  • 批准号:
    31772125
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    吴建祥
  • 依托单位:
水稻黑条矮缩病毒外壳蛋白与灰飞虱传毒介体间的分子互作机制
  • 批准号:
    31571976
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    吴建祥
  • 依托单位:
中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNAβ编码的RNA沉默抑制子的作用机理研究
  • 批准号:
    30670087
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    吴建祥
  • 依托单位:
国内基金
海外基金