“尾对尾”式天然反义转录本在家鸡肌肉发育中的调控作用及机制研究
结题报告
批准号:
31972544
项目类别:
面上项目
资助金额:
58.0 万元
负责人:
罗文
依托单位:
学科分类:
家禽及其他经济动物种质资源与遗传育种学
结题年份:
2023
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
罗文
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中文摘要
肌肉分化主要指成肌细胞向肌管转化的过程,该过程可影响肌纤维的数量和粗细,是决定动物产肉潜力的关键。为挖掘可调控该过程的遗传因子,我们前期对家鸡成肌细胞和肌管进行三代全长转录组测序,发现一种“尾对尾”式天然反义转录本(TtT-NAT)广泛存在于调控肌肉分化的标记基因中。这类反义转录本只占所有天然反义转录本的5.06%,但却集中表达于影响肌肉分化的关键基因中,而且还表现出肌肉特异表达、分化期上调表达、“尾对尾”区域能与正义转录本形成dsRNA的特点,猜测它们可能通过影响正义转录本表达,调控家鸡肌肉发育。本项目将以调控肌肉分化标记基因的MyoNATs为研究对象,检测它们对家鸡肌肉发育的作用,找出决定它们表达的调控机制,阐述它们的作用机理,并探讨TtT-NAT在细胞分化中的生物学意义。项目的实施不仅对提升家鸡产肉潜力具有理论意义,而且可拓展天然反义转录本的作用方式,发掘出新的基因表达调控机制。
英文摘要
Muscle differentiation mainly refers to the process of myoblasts transforming into myotubes. This process can affect the number and size of muscle fibers and is the key to determine the meat production potential of animals. In order to discover the genetic factors that can regulate muscle differentiation, we sequenced the transcriptomes of chicken myoblasts and myotubes by using single-molecule full-length transcript sequencing. We found that many tail-to-tail natural antisense transcripts (TtT-NATs) were expressed in muscle differentiation marker genes. TtT-NATs account for only 5.06% of all natural antisense transcripts, but they are concentrated express in the key genes affecting muscle differentiation. Additionally, these TtT-NATs were muscle-specific expression, and they would up-regulated their expression during muscle differentiation. The “tail-to-tail” region of the TtT-NATs can form dsRNA with the corresponding sense transcript. Therefore, we suppose that the TtT-NATs can regulate chicken muscle development by interacting with their sense transcripts. This study will focus on the MyoNATs, which can regulate the muscle differentiation marker genes. We will detect the functions of MyoNATs in chicken muscle development, find out the regulatory mechanism that determines their expression, elaborate their mechanism of action, and explore the biological significance of TtT-NATs during cell development. The implementation of this study not only has theoretical significance to enhance the meat production potential of domestic chickens, but also can expand the roles of natural antisense transcript and find out new gene expression regulation mechanism.
期刊论文列表
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会议论文列表
专利列表
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.127629
发表时间:2023-11-01
期刊:INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES
影响因子:8.2
作者:Zhang,Zihao;Luo,Wen;Zhang,Xiquan
通讯作者:Zhang,Xiquan
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.129144
发表时间:2024-01-05
期刊:INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES
影响因子:8.2
作者:Chen,Genghua;Lin,Zetong;Luo,Wen
通讯作者:Luo,Wen
DOI:10.1016/j.bbrc.2023.04.050
发表时间:2023-04-25
期刊:BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
影响因子:3.1
作者:Yin,Yunqian;Chen,Genghua;Luo,Wen
通讯作者:Luo,Wen
DOI:10.1016/j.psj.2023.103341
发表时间:2024-02
期刊:POULTRY SCIENCE
影响因子:4.4
作者:Rongyang Pan;Lin Qi;Zhenqiang Xu;Dexiang Zhang;Qinghua Nie;Xiquan Zhang;Wen Luo
通讯作者:Wen Luo
DOI:10.1111/cpr.13545
发表时间:2023-09-13
期刊:CELL PROLIFERATION
影响因子:8.5
作者:Chen,Genghua;Chen,Jiahui;Luo,Wen
通讯作者:Luo,Wen
FOXO1基因侧翼区SNPs通过影响超级增强子活性和染色质三维结构调控鸡肌肉生长发育
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    54万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    罗文
  • 依托单位:
家鸡肌肉分化诱导MyoNATs表达的机制及功能研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    罗文
  • 依托单位:
GHR基因缺失突变导致鸡肌纤维数量减少和直径变小的机制研究
  • 批准号:
    31702105
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    罗文
  • 依托单位:
国内基金
海外基金