新疆红肉苹果杂种一代红肉株系类黄酮和着色差异机理的研究

Breeding functional apple with high flavonoid content for fresh and processing is the development direction of apple breeding. On the basis of building F1 and BC1 segregation population of Xinjiang wild red-flesh apple [Malus sieversii f. neidzwetzkyana（Dieck）Langenf.], identification the relationship between phenotypic traits of hybrids and MYB10 promoter genetypes, and obtaining five MYB transcription factors, MdMYB4, MdMYB12, MdMYB16, MdMYB22 and MdMYB111, which might positively or negatively regulate flavonoid synthesis by RNA-seq, we will clone and perform bioinformatics analysis of these five candidate transcription factors and study their spatial and temporal expression characteristics in two R6R1 genetype strains named 'Hongcui 1' and 'Hongcui 4' with low flavonoid content in fruit flesh and two R6R6 genetype strains named 'Zihong 1' and 'Zihong 2' with high flavonoid content in fruit flesh. Further, yeast two hybrid technology and other technology will be used to study the protein-protein interaction between these five candidate transcription factors and other flavonoid synthesis regulation transcription factors, such as bHLH3, in vitro and living conditions; EMSA and ChIP-PCR technique will be used to study the protein-DNA interaction characters and regulation functions between five candidate transcription factors and structure genes promoter of flavonoid synthesis, such as CHS, in vitro and living conditions. Their function in plant will be verified in transgenic plants. These results will elucidate the biosynthesis and regulation mechanism of flavonoid in hybrid progeny fruits of Malus sieversii f.neidzwetzkyana, and lay the theoretical basis of functional apple breeding.

选育类黄酮含量高、可鲜食或加工的功能型苹果是发展方向。本申请在已构建了新疆红肉苹果F1和BC1分离群体、明确了实生株系MdMYB10启动子基因型与表型特征以及通过RNA-seq等获得MdMYB4/12/22/16/111等5个候选正负调控转录因子的基础上，进一步以果肉颜色及类黄酮含量存在明显差异的新疆红肉苹果杂种一代４个红肉株系为试材，通过基因克隆和生物信息学分析等研究候选基因结构特征和时空表达特性及其与4个红肉株系果实类黄酮含量变化的关系；利用酵母双杂交等技术在离体和活体状态下研究候选基因与bHLH3等转录因子的蛋白互作，利用EMSA等技术在离体和活体条件下探讨候选基因与CHS等类黄酮生物合成结构基因启动子在蛋白-DNA水平上的互作特点及调控作用，并进行转基因功能验证及GFP亚细胞定位，从而探讨苹果红肉株系果实类黄酮与着色差异的分子机理，为完善功能型苹果育种的理论与技术体系提供科学依据。

选育类黄酮含量高、可鲜食或加工的功能型苹果是发展方向。本项目在已构建了新疆红肉苹果分离群体、明确了实生株系MdMYB10启动子基因型与表型特征的基础上，进一步以果肉颜色及类黄酮含量存在明显差异的后代株系为试材，探究了苹果红肉株系果实类黄酮与着色差异的分子机理。课题所有研究内容均按计划进行，主要取得了如下研究成果：①利用高通量测序及生物信息学技术，对亚洲、欧洲和美洲等世界范围苹果属的新疆野苹果等24个种、117份种质资源进行了全基因组重测序，共检测到720万个高质量的最小基因单位（SNPs）。研究发现，我国新疆境内的塞威士苹果保持较高的同源性、最原始。该研究为苹果资源挖掘和分子育种提供了海量有价值的基础数据。②以果肉颜色及类黄酮和花青苷含量存在明显差异的红脆1和4号（R6R1）及紫红1和2号（R6R6）等新疆野苹果杂种一代红肉株系为试材，研究了类黄酮及花青苷含量变化及其与相关基因表达量的关系。结果表明，MYB10、bHLH3 和TTG1等转录因子及ANS 和UFGT 等花青苷生物合成结构基因在果实发育后期高水平表达，可能是导致紫红2 号成熟期果肉花青苷含量高的主要原因，而MYB12、MYB16 和MYB111 等转录因子及DFR、FLS、LAR 和ANR 类黄酮生物合成相关结构基因的差异表达，可能是导致红脆1、2、4 号等3 个株系类黄酮组分及含量差异的主要原因。③克隆鉴定了调控苹果果实类黄酮及花青苷合成的MdMYB12、MdMYB22、MdMYB16、MdMYB111、MdMYBPA1、MdERF1B、MdBBX20、MdBBX24等正负调控转录因子，并阐明了其调控机理，解析了新疆红肉苹果杂种一代红肉株系类黄酮和着色差异机理，为完善功能型苹果育种的理论与技术体系提供科学依据。④课题发表项目资助号的论文38篇，其中SCI 论文24篇（影响因子>10的1篇，影响因子>5的3篇），授权发明专利34项，获植物新品种权6个，培养博士后2人，博士7人，其中毕业3人，在读4人，硕士18人，其中毕业5人，在读13人，均超额完成了项目计划任务指标。

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