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基于翻译起始机制的原核基因组比较的生物信息学研究

批准号：
30770499
项目类别：
面上项目
资助金额：
27.0 万元
负责人：
朱怀球
依托单位：
北京大学
学科分类：
物理生物学
结题年份：
2010
批准年份：
2007
项目状态：
已结题
项目参与者：
姚新秋、胡钢清、高萌、郑晓斌、孙宗晓、康宏、刘永初、罗成伟
关键词：
生物信息学比较基因组学原核生物翻译起始机制

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项目成果

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中文摘要
以原核基因翻译起始机制为主要研究对象，发展刻画翻译起始位点及相邻序列的统计模型、基于概率统计的数学模型，致力于发展原核生物（细菌和古细菌）比较基因组学的新方法和新工具，在全基因组水平、全部基因、部分基因（如横向转移基因、Essential基因）以及基因在基因组上的排列关系（如操纵子结构）和功能分类等几个层次进行原核生物基因组的比较研究，着重选取一批具有物种分类代表性的细菌和古细菌基因组进行详尽研究，同时大规模分析已完成全基因组测序和注释的全部物种。进一步研究原核基因翻译起始机制的物种特异性和进化动力学机制，探讨翻译起始机制在原核生物基因组演化过程中的作用。
英文摘要
期刊论文列表
专著列表
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专利列表
基于剪接信号和调节元件序列特征的剪接位点预测方法
DOI： --
发表时间： --
期刊： 科学通报
影响因子： --
作者： [朱怀球, 孙宗晓, 桑凌洁, 居理宁]
通讯作者： 居理宁
Computational evaluation of TIS annotation for prokaryotic genomes.
原核生物基因组 TIS 注释的计算评估
DOI： 10.1186/1471-2105-9-160
发表时间： 2008-03-25
期刊： BMC BIOINFORMATICS
影响因子： 3
作者： [Hu, Gang-Qing, Zheng, Xiaobin, Ju, Li-Ning, Zhu, Huaiqiu, She, Zhen-Su]
通讯作者： She, Zhen-Su
ProTISA: a comprehensive resource for translation initiation site annotation in prokaryotic genomes.
ProTISA：原核基因组翻译起始位点注释的综合资源
DOI： 10.1093/nar/gkm799
发表时间： 2008-01
期刊： NUCLEIC ACIDS RESEARCH
影响因子： 14.9
作者： [Hu, Gang-Qing, Zheng, Xiaobin, Yang, Yi-Fan, Ortet, Philippe, She, Zhen-Su, Zhu, Huaiqiu]
通讯作者： Zhu, Huaiqiu
Prediction of translation initiation site for microbial genomes with TriTISA
使用 TriTISA 预测微生物基因组的翻译起始位点
DOI： 10.1093/bioinformatics/btn576
发表时间： 2009-01-01
期刊： BIOINFORMATICS
影响因子： 5.8
作者： [Hu, Gang-Qing, Zheng, Xiaobin, She, Zhen-Su]
通讯作者： She, Zhen-Su
共 12 条
    病毒宿主和感染性预测及病毒系统分类的算法研究
    • 批准号：
      32070667
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      60.0万元
    • 批准年份：
      2020
    • 负责人：
      朱怀球
    • 依托单位：
      北京大学
    微生物群落环境适应性的宏基因组学研究
    • 批准号：
      31671366
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      62.0万元
    • 批准年份：
      2016
    • 负责人：
      朱怀球
    • 依托单位：
      北京大学
    极端微生物宏基因组微进化的计算生物学研究
    • 批准号：
      91231119
    • 项目类别：
      重大研究计划
    • 资助金额：
      100.0万元
    • 批准年份：
      2012
    • 负责人：
      朱怀球
    • 依托单位：
      北京大学
    神经影像的时间信息提取及其在中枢药物疗效检测中的应用
    • 批准号：
      61131003
    • 项目类别：
      重点项目
    • 资助金额：
      280.0万元
    • 批准年份：
      2011
    • 负责人：
      朱怀球
    • 依托单位：
      北京大学
    国内基金
    海外基金