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基于人体口腔、肺及肠道微生物宏基因组大数据的肺腺癌发生发展机制及其早期预警模型的研究
结题报告
批准号:
81874038
项目类别:
面上项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
鲁海峰
依托单位:
学科分类:
H1813.肿瘤诊断
结题年份:
2020
批准年份:
2018
项目状态:
已结题
项目参与者:
汪路明、杨凤玲、陈燕飞、郭静、张华、郭丽华、叶建中、石鼎、方戴琼
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中文摘要
肺腺癌是近年来发病率和死亡率不断上升的肿瘤之一。现有的血清标志物浓度的异常并不能同步反映肺腺癌的发生发展,对其早期预警作用更差。寻找新型有效的肺腺癌预警监测和早期诊断的生物标志物需另辟新径。人类微生物组研究已成为肿瘤精准医学研究的重要领域之一。本项目以 “人体微生物基因组与人自身基因相互作用,共同决定人体免疫监视功能状态”为切入点,采用宏基因组学、免疫组学及大数据生物信息分析手段,解析肺腺癌患者口腔、肺及肠道微生物宏基因组和血清细胞因子变化特征,并与疾病进展关联分析,阐明人体微生态失衡参与肺腺癌发生发展的整合组学机制,确定与肺腺癌发生发展相关的生物标记物,建立基于人体微生物组大数据的肺腺癌早期预警监测模型。预期成果对肺腺癌病因、发病机制、防治具有重要意义。项目以国家重点实验室为支撑,聘请微生态学专家,成员曾在Nature、hepatology发表论文,工作基础扎实,可保证项目的顺利进行。
英文摘要
Lung Adenocarcinoma (LA) is one of cancers, which have been increasing in incidence and mortality in recent years. The abnormal concentration of the existing serum markers does not synchronously reflect the occurrence and development of LA, and is worse for early warning effect. Therefore, we need to develop a method to identify new and effective biomarkers for early warning monitoring and diagnosis of lung Adenocarcinoma. Currently, the study of the human microbiome has become one of the important fields in the research of tumor precision medicine. This study is according to “human microbiome determines the state of human immune surveillance in cooperation with host genes”. We apply multiple technologies, which include metagenomics, immunomics and bioinformatics to reveal the dynamic characteristics of oral, lung and gut microbiome and serum cytokines in health people and patients with LA. We will associate these alterations with disease progression to clarify the integrative metagenomics and immunomics mechanism, via which the oral, lung and gut microbial imbalances are involved in LA progression, and identify the key biomarkers for the early warning and monitoring model of LA based on large data of human microbiome. The expected results of this project are significant to etiology, pathogenesis, diagnosis and then treatment of LA. This study will be supported by the State Key Laboratory, supervised by a world-class microbial ecologist, and conducted by members who have published in Nature and Hepatology.
肺癌(Lung Cancer,LC) 是我国最常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率逐年增加,已严重危害我国人民健康。肺癌病理复杂,其中腺癌(Lung Adenocarcinoma, LAC )和鳞状细胞癌(Lung Squamous Cell Cancer, LSCC)两种非小细胞肺癌,约占肺癌总数的80-85%,其病情凶险,治愈率低,且易转移扩散,愈后差,其5年存活率极低(21%),大部分幸存者都不同程度地出现肺功能损伤、混合肺部感染等并发症。因此,肺癌防治工作重在预防。早预警、早干预是肺防治的有效途径。然而,肺癌的诱因至今仍不明确,可能与遗传、感染、免疫功能异常等有关。人体微生物在维持机体免疫系统的正常结构和功能发育等方面起着关键作用,与肠道固有结构和人体免疫系统形成一个复杂的有机整体。肠道细菌能塑造肺部免疫细胞指令。本项目采用微生物组学技术,以肺腺癌、肺鳞癌、及癌前病变患者与良性对照组共176例受试者为研究对象,解析肺癌患者肺部微生物组结构和功能差异,筛选与肺癌发生、发展密切相关的关键功能菌。结果发现,肺癌患者与良性对照组间菌群的差异性主要表现在核心菌群水平的差异,以及菌群功能基因富集的差异。其中良性对照组核心关键OTU16个,分别为OTU3358 (Aquabacterium), OTU3192 (Leptotrichia)等;LC核心OTU有2,分别为OTU4039 (Campylobacter)和OTU5177 (Solobacterium);AAH核心OTU有13,分别为OTU105 (Prevotella),OTU1141 (Brevibacterium),OTU1481 (Escherichia-Shigella)等。对肺部微生物功能基因富集分析,发现非典型腺瘤样增生的受试者与肺腺癌受试者相似,特别是高分化受试者肺部微生物功能基因同样富集于非典型腺瘤样增生的受试者。因此,对肺部微生物结构和功能基因进行分析,可以筛选肺腺癌高风险人群,从而为通过微生态调节剂对危险人群实现早期干预提供科学依据,对制定肺腺癌早期防控具有重要意义。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Tongue coating microbiome data distinguish patients with pancreatic head cancer from healthy controls
舌苔微生物组数据将胰头癌患者与健康对照区分开来。
DOI:10.1080/20002297.2018.1563409
发表时间:2019-01-01
期刊:JOURNAL OF ORAL MICROBIOLOGY
影响因子:4.5
作者:Lu, Haifeng;Ren, Zhigang;Li, Lanjuan
通讯作者:Li, Lanjuan
Fecal Microbiome Data Distinguish Liver Recipients With Normal and Abnormal Liver Function From Healthy Controls
粪便微生物组数据可区分肝功能正常和异常的肝受体与健康对照者
DOI:10.3389/fmicb.2019.01518
发表时间:2019-07-03
期刊:FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
影响因子:5.2
作者:Lu, Hai-Feng;Ren, Zhi-Gang;Li, Lan-Juan
通讯作者:Li, Lan-Juan
基于PacBioRS 平台的真菌18S rDNA全长测序技术探讨类风湿关节炎患者肠道真菌亚肠型结构
  • 批准号:
    81501431
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    鲁海峰
  • 依托单位:
国内基金
海外基金