精神分裂症全基因组关联研究的通路分析及验证

批准号:
81071087
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
岳伟华
依托单位:
学科分类:
H1005.精神分裂症及精神病性障碍
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
潘成英、汤富磊、迟锐、胡晓凤、阮燕燕、张艳玲、陈雅光
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中文摘要
近年来,采用高通量单核苷酸多态性(SNP)芯片检测技术进行全基因组关联研究(GWAS),已成为探索精神分裂症等复杂疾病易感基因的有效策略,而基于GWAS数据的通路(pathway)分析也逐渐成为国际上复杂疾病遗传研究的热点。本研究将在课题组已完成的精神分裂症GWAS(Illumina 610K SNP芯片)基础上,结合KEGG, Biocarta, GO等经典公共生物信息学数据库,计算基于生物通路的遗传关联标准统计量,筛选与精神分裂症显著关联的生物通路;并采用Illumina BeadXpress定制SNP芯片基因型检测方法,在另外选取的病例-对照大样本中,进行精神分裂症GWAS通路结果分析的验证。本研究预期结果有望为精神分裂症的发病机制研究提供有益的线索资料。
英文摘要
本研究在课题组前期已完成的中国汉族人群精神分裂症GWAS(768例精神分裂症患者和1,733名正常对照者样本,Illumina 610K SNP芯片的448,734个SNPs)基础上,结合公共数据库蛋白-蛋白相互作用数据库(PINBA)及密集模块搜索方法(DMS)进行分析,发现了由多个与精神分裂症关联的基因集合,如:谷氨酸受体基因(GRM5), 氨基丁酸受体基因(GABRB1, GABARAP),以及MHC区域相关基因(HLA-C, TAP2, HIST1H1B)等。上述有意义生物通路主要与神经发育和免疫功能相关。. 采用精神病全基因组关联研究联合会(PGC)的数据,结合公共数据库GO的生物学信息进行分析,结果发现三个髓鞘相关通路:髓鞘(Myelin sheath)通路、髓鞘生成(Myelination)通路以及Compiled通路共同与精神分裂症及双相情感障碍显著关联。进一步采用中国汉族人群GWAS数据,对髓鞘化通路上613个基因的1144个SNPs位点进行病例-对照遗传关联分析发现,髓鞘相关基因PMP22, BCL2, EXOC4, MBP等与疾病关联;进一步在独立样本中进行验证发现,上述位点combined P值均<10-5,达到了Bonforroni校正统计学显著性水平。. 对多个精神分裂症神经发育相关易感基因(CACNA1C, BRAP, ATXN2等)进行关联分析与验证。并对CACNA1C和CAMKK2基因进行了不同人群大样本的meta分析,为遗传学研究提供循证医学证据。对部分基因进行影像遗传学分析(MTHFR, STON2)、eQTL分析(BRAP, NKAPL, TSPAN18, MYO5B)、miRNA关联分析、以及与临床特征及抗精神病药物疗效和不良反应的关联分析(NRXN1, NRXN3, FTO, DRD3, GHRL, ZNF804A, COMT等)。
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
免疫与代谢交互作用在精神分裂症发生发展中的机制及干预策略
- 批准号:82330042
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:220万元
- 批准年份:2023
- 负责人:岳伟华
- 依托单位:
精神分裂症全基因组水平的生物信息学分析与验证
- 批准号:81571313
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:57.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:岳伟华
- 依托单位:
精神分裂症与谷氨酸能突触传递相关易感基因的关联研究
- 批准号:30870896
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:32.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:岳伟华
- 依托单位:
精神分裂症神经发育假说相关易感基因数学模型的建立
- 批准号:30400149
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:26.0万元
- 批准年份:2004
- 负责人:岳伟华
- 依托单位:
国内基金
海外基金
