本次研究选取马可波罗航次深海区域的南海盆地和南海北部陆坡两个站点的沉积柱状样为研究对象，采用分子生物学手段调查两个站点微生物代谢多样性，结合以往对陆架的研究结果，比较南海不同深度微生物群落结构，初步分析地形环境对微生物代谢多样性的影响；分析微生物在沉积柱状样垂向的代谢多样性，找出与地球化学过程相关的典型微生物，结合地球化学指标，分析这些微生物生物量在沉积物垂向上的变化趋势和相关元素在垂向上含量变化趋势，初步揭示微生物在南海沉积物早期成岩成矿中的生物地球化学作用。本研究是地球科学与生命科学在分子水平上相互结合的初步试验，为我国深部生物圈研究做准备，积累经验。