神经母细胞瘤DHRS4基因选择性剪接机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30970626
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    黄东阳
  • 依托单位：
    汕头大学
  • 学科分类：
    C0509.生物学过程与代谢
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

辅酶II依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)由申请者首先纯化并鉴定，其编码基因DHRS4在神经母细胞瘤(neuroblastoma，NB)中存在异常的转录与剪接现象，提示NB细胞可能存在特殊的转录辅助因子和/或RNA剪接因子。申请者拟应用免疫沉淀、DNA亲合层析、染色质免疫沉淀、转染、RNAi等技术，研究神经母细胞瘤细胞中DHRS4的转录和剪接机制，鉴定出NB中存在的异常转录辅助因子和/或RNA剪接因子，验证它们与NB发生的相关性，转录辅助因子和/或RNA剪接因子的异常与神经母细胞瘤的发生相关。课题研究结果除可以为NB的发生提供新的理论依据外，鉴定出的转录辅助因子和/或RNA剪接因子还有可能成为NB诊断、治疗的新靶点，具有较强的潜在应用价值。

结项摘要

DHRS4基因编码的蛋白NRDR是NADP(H)依赖的视黄醇氧化还原酶，本课题主要研究了DHRS4基因簇的选择性剪接亚型及转录相关的剪接调控因子。课题首先通过RT-PCR和蛋白质谱鉴定了DHRS4基因选择性剪接亚型编码的蛋白，以及亚型NRDRB1作为氧化还原酶对不同底物的催化活性。经过生物信息学分析比对课题组和数据库登录的DHRS4基因簇的剪接亚型，发现exon a剪接缺失的规律，并推测选择性启动子的剪接位点以及反义RNA可能参与DHRS4L2和DHRS4L1基因exon a剪接缺失。最后通过RNA干扰、实时定量PCR、染色质免疫共沉淀技术验证DHRS4自然反义转录本AS1DHRS4作为长的非编码RNA，在表观遗传学水平通过DNA甲基化和组蛋白修饰调控DHRS4、DHRS4L2和DHRS4L1基因的转录起始活性。

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
DHRS4基因簇缺失型神经母细胞瘤细胞株的克隆和鉴定
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    解剖学研究
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    苏中静;刘戈飞;宋旭红;陈海滨;常晓兰;黄东阳
  • 通讯作者：
    黄东阳
Bioinformatic analysis of the human DHRS4 gene cluster and a proposed mechanism for its transcriptional regulation
人类DHRS4基因簇的生物信息分析及其转录调控机制
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Bmc Molecular Biology
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Su Zhong-Jing;Huang Dong-Yang;Zhang Qiao-Xia;Liu Ge-Fei;Song Xu-Hong;Li Qi;Wang Rui-Jian;Chen Hai-Bin;Xu Xiao-Yuan;Sui Xu-Xia
  • 通讯作者：
    Sui Xu-Xia
AS1DHRS4, a head-to-head natural antisense transcript, silences the DHRS4 gene cluster in cis and trans
AS1DHRS4，一种头对头的天然反义转录物，以顺式和反式沉默 DHRS4 基因簇
  • DOI：
    10.1073/pnas.1116597109
  • 发表时间：
    2012-08-28
  • 期刊：
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子：
    11.1
  • 作者：
    Li, Qi;Su, Zhongjing;Huang, Dongyang
  • 通讯作者：
    Huang, Dongyang
DHRS4L1基因选择性剪接亚型的克隆及分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    解剖科学进展
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    苏中静;陈海滨;宋旭红;刘戈飞;李奇;王瑞俭;黄东阳
  • 通讯作者：
    黄东阳
人肝癌细胞辅酶Ⅱ-依赖性视黄醇脱氢/还原酶选择性剪接新亚型的鉴定和分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    汕头大学医学院学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    钱程;刘婷;闫银侠;宋旭红;黄东阳
  • 通讯作者：
    黄东阳

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  • 通讯作者：
    周福霖
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  • 期刊：
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    谭平;周福霖;黄东阳
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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