课题基金 / 基金详情

融合基因HPV-KLF12在HPV整合导致宫颈癌发病中的作用及机制研究

批准号:
82072895
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
吴鹏
依托单位:
学科分类:
肿瘤病因
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
吴鹏

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
高危型人乳头瘤病毒(high risk Human Papillomavirus;hrHPV)持续性感染是宫颈癌的主要致病因素, hrHPV人类基因组整合引起的基因组结构不稳定是宫颈癌发生最为关键的分子事件之一。我们前期围绕“hrHPV持续性感染与整合”利用三维测序等技术开展了系统深入的研究,并利用CRISPR/Cas9技术在正常鳞状上皮Hacat细胞染色体13q22.1位点插入HPV16 E6和E7序列,构建HPV整合细胞模型。本项目拟在体内外验证细胞模型并观察细胞恶性转化的生物学表型,采用三维测序技术(Hi-C),RNA-seq联合分析HPV整合引起的人类基因组结构变化以及RNA水平产生的融合基因。在此基础上,深入研究融合基因HPV-KLF12在宫颈癌恶性转化中的作用及机制。该项目是既往HPV整合产生融合基因的研究以及三维测序研究的深入和创新,具有一定的理论意义和临床应用前景。
英文摘要
High risk human papillomavirus (hrHPV) persistent infection is the main pathogenic factor of cervical cancer. In the process of hrHPV persistent infection, the instability of genome structure caused by HPV integration of human genome is one of the most critical events of cervical carcinogenesis. We carried out systematic and in-depth research on "hrHPV integration and persistent infection” by using three-dimensional sequencing in previous studies, and inserted HPV16 E6 and E7 sequences into the chromosome 13q22.1 of normal squamous epithelial HaCaT cells by using CRISPR / cas9 technology to build an integrated cell model of HPV. This project intends to verify the HPV integrated cell model in vitro and in vivo and observe the biological phenotype of malignant transformation of cells. Based on above observation, in the integrated cell model Hacat-HPV+, three-dimensional sequencing (Hi-C) and RNA-Seq will be applied to analyze the structural changes of human genome caused by HPV integration as well as the RNA level fusion genes produced by structural changes. Moreover, further role and mechanism of HPV-KLF12 fusion gene in cervical cancer malignant transformation will be carried out. This project is an in-depth and innovative research on the fusion gene generated by HPV integration and 3D sequencing, which has certain theoretical significance and important clinical application prospects.
人乳头瘤病毒(HPV)DNA整合到人类基因组被认为是宫颈癌的关键驱动因素。然而,HPV整合对染色质结构组织和基因表达的影响仍知之甚少。本研究分析了61个样本的队列,发现了一个位于19号染色体CCDC106基因的整合热点。选取了仅包含CCDC106整合位点且无HPV环形DNA的新鲜癌组织样本,并进行了全基因组、RNA、染色质免疫沉淀和高通量染色体构象捕获(Hi-C)测序,以揭示HPV整合在宫颈癌发生中的机制。分子分析显示,19号染色体表现出显著的基因组变异和差异表达密度,与三维3D结构变化和基因表达之间存在相关性。重要的是,HPV整合将一个拓扑相关域(TAD)分割为两个较小的TAD,并通过3D基因组结构重塑将一个增强子从PEG3劫持到CCDC106,导致PEG3表达下降和CCDC106表达上升。通过队列中的10个样本验证了上述表达失调现象。本研究揭示了HPV-CCDC106整合通过3D基因组结构重塑改变局部染色体架构并劫持增强子的现象,为宫颈癌发生的3D结构机制提供了新的见解。
宫颈癌肿瘤相关成纤维细胞促进巨噬细胞浸润和极化以重塑免疫微环境的机制研究
  • 批准号:
    82372929
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    49万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    吴鹏
  • 依托单位:
Ubiquitin B在逆转卵巢癌化疗耐药中的作用及机制研究
  • 批准号:
    81372806
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    吴鹏
  • 依托单位:
HDAC抑制剂逆转卵巢癌化疗耐药关键分子的筛选及其靶向阻遏
  • 批准号:
    30801224
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万元
  • 批准年份:
    2008
  • 负责人:
    吴鹏
  • 依托单位:
国内基金
海外基金