埃博拉病毒宿主适应性突变位点的发现及其在感染中的作用研究

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AI项目解读

基本信息

项目摘要

From 2013 to 2016, a massive ebola outbreak in some west African countries has killed more than 11,000 people. As trade and personnel exchanges with Africa become more active, the risk of ebola entering China is very high. It is of great significance to understand the spread and evolution of ebola virus in our country. Previous studies have shown that the west African outbreak began with the successful transmissions of viruses from animal hosts to humans. The successful transmission of the virus in the new host is usually related to the acquisition of the host adaptive mutation. Previous sequencing studies have identified multiple mutation sites in the viral genome, but their role in ebola transmission and host adaptation remains unclear. In our previous study, multiple mutation sites related to virus transmission and mortality were found through evolutionary and epidemiological analysis. In this study, we want to discovery the key adaptive mutation sites of virus genome in the outbreak. And to detect the effects of these mutations on virus replication, infection and host susceptibility by using ebola virus infection cell model. The mechanism of action was revealed by analyzing the interaction between the virus proteins and host receptors. Finally, the results of this study will used to provide theoretical basis and technical support for the prevention and treatment of ebola hemorrhagic fever.
2013-2016年,西非国家爆发的埃博拉感染疫情危害严重,导致超过11000人死亡。随着与非洲商贸和人员交流日益活跃,埃博拉病毒进入我国的风险很大。认识埃博拉病毒感染与进化特点,对于防控疫情在我国的出现和蔓延具有重要意义。研究表明这次疫情开始于病毒从动物宿主到人类的成功跨物种传播。而病毒在新宿主体内的成功传播通常与宿主适应性突变的获得相关。前期高通量测序研究发现在疫情期间病毒基因组多个位点出现突变,但它们在埃博拉病毒感染和宿主适应性中的作用仍然不清楚。我们通过病毒进化和流行病学分析发现其中多个突变位点与病毒传播、患者死亡率相关。本研究拟以此为基础,针对发现的疫情爆发中病毒基因组突变位点;利用埃博拉假病毒模型,检测这些突变对病毒复制、感染、逃逸宿主天然免疫、宿主细胞易感性等的影响,鉴定病毒适应性相关的关键突变位点;并通过突变蛋白质与宿主相互作用研究揭示其作用机制,为埃博拉病毒感染防治提供理论基础和技术支撑。

结项摘要

埃博拉病毒是引起人类和灵长类动物发生出血热的烈性病毒,其引起的埃博拉出血热是当今世界上最致命的病毒性出血热。自1976年首次被发现以来,埃博拉出血热已在非洲国家多次爆发流行,2013-2016年在西非国家爆发的疫情导致超过11000人死亡。随着与非洲商贸和人员交流日益活跃,埃博拉病毒进入我国的风险很大。认识埃博拉病毒感染与进化特点,对于防控疫情在我国的出现和蔓延具有重要意义。在本项目中,我们开展了埃博拉病毒进化与传播规律研究,重构了埃博拉病毒的系统发育树,发现主要有13个埃博拉病毒亚群(lineage)在塞拉利昂传播,通过埃博拉病毒时空分布分析,揭示了该病毒不同亚群(lineage)具有不同的分布/传播特征。通过重建病毒的进化路径,发现60个适应性突变位点,含14个非同义突变中(5个位于L蛋白的mRNA-capping methyltransferase domain结构域,3个位于GP蛋白的GP1结构域)。通过与病人临床信息关联分析,发现不同的病毒亚群(lineage)具有不同的感染病人病死率(CFRs),发现了与CFRs显著相关的5个突变位点(T10479A,C16895T,G18240T,T5849C,G17848A)。建立了埃博拉假病毒模型(mini-genome报告系统),发现适应性点突变T5849C能够显著降低埃博拉病毒上游VP40基因(编码病毒基质蛋白,matrix protein)的表达水平。通过感染血液转录组学分析,明确了感染中主要免疫细胞类型的被激活/抑制状态,发现了病毒感染调控的天然免疫、抗原呈递等关键免疫通路。本项目的这些发现可以为埃博拉病毒感染防治提供理论基础。

项目成果

期刊论文数量(5)
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专利数量(0)
Protective Immunity Elicited by VP1 Chimeric Antigens of Bacterial Ghosts against Hand-Foot-and-Mouth Disease Virus
菌鬼VP1嵌合抗原对手足口病病毒的保护性免疫
  • DOI:
    10.3390/vaccines8010061
  • 发表时间:
    2020-03-01
  • 期刊:
    VACCINES
  • 影响因子:
    7.8
  • 作者:
    Gong, Saisai;Nan, Nan;Wang, Hui
  • 通讯作者:
    Wang, Hui
VP1 of Enterovirus 71 Protects Mice Against Enterovirus 71 and Coxsackievirus B3 in Lethal Challenge Experiment
在致死攻击实验中,肠道病毒 71 的 VP1 可保护小鼠免受肠道病毒 71 和柯萨奇病毒 B3 的侵害
  • DOI:
    10.3389/fimmu.2019.02564
  • 发表时间:
    2019-11-08
  • 期刊:
    FRONTIERS IN IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    7.3
  • 作者:
    Chen, Fang-Hong;Liu, Xiong;Wang, Hui
  • 通讯作者:
    Wang, Hui
Longitudinal Metabolomics Reveals Ornithine Cycle Dysregulation Correlates With Inflammation and Coagulation in COVID-19 Severe Patients.
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Li T;Ning N;Li B;Luo D;Qin E;Yu W;Wang J;Yang G;Nan N;He Z;Yang N;Gong S;Li J;Liu A;Sun Y;Li Z;Jia T;Gao J;Zhang W;Huang Y;Hou J;Xue Y;Li D;Wei Z;Zhang L;Li B;Wang H
  • 通讯作者:
    Wang H
Longitudinal and proteome-wide analyses of antibodies in COVID-19 patients reveal features of the humoral immune response to SARS-CoV-2.
对 COVID-19 患者抗体的纵向和全蛋白质组分析揭示了针对 SARS-CoV-2 的体液免疫反应的特征
  • DOI:
    10.1016/j.jare.2021.07.008
  • 发表时间:
    2022-03
  • 期刊:
    Journal of advanced research
  • 影响因子:
    10.7
  • 作者:
    Wang J;Yang Y;Liang T;Yang N;Li T;Zheng C;Ning N;Luo D;Yang X;He Z;Yang G;Li B;Gao J;Yu W;Gong S;Huang Y;Li J;Wang H;Zhang H;Zhang T;Li P;Li Y;Dai J;Zhang X;Li B;Yu X;Wang H
  • 通讯作者:
    Wang H
Gentamicin Induced Microbiome Adaptations Associate With Increased BCAA Levels and Enhance Severity of Influenza Infection.
庆大霉素诱导的微生物组适应与 BCAA 水平升高和流感感染严重程度增加相关
  • DOI:
    10.3389/fimmu.2020.608895
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Frontiers in immunology
  • 影响因子:
    7.3
  • 作者:
    Sun Y;He Z;Li J;Gong S;Yuan S;Li T;Ning N;Xing L;Zhang L;Chen F;Li Z;Wang J;Luo D;Wang H
  • 通讯作者:
    Wang H

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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张坚

其他文献

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新型多肽及修饰体抗感染性HUS活性及其作用机制研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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