Elementary mode analysis: a useful metabolic pathway analysis tool for characterizing cellular metabolism.
Elementary mode analysis: a useful metabolic pathway analysis tool for characterizing cellular metabolism.
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DOI：
10.1007/s00253-008-1770-1
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发表时间：
2009-01
影响因子：
5
通讯作者：
Srienc F
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Trinh CT;Wlaschin A;Srienc F
基本模式分析是一种有用的代谢途径分析工具，可识别将细胞表型与相应基因型联系起来的代谢网络的结构。该分析可以将由高度互连的反应组成的复杂代谢网络分解为独特组织的途径。这些途径由一组最小的酶组成，可以支持细胞代谢的稳态运行，代表独立的细胞生理状态。这种途径的定义为系统地表征细胞表型、代谢网络调节、稳健性和脆弱性提供了严格的基础，有助于理解细胞生理学和代谢工程策略的实施。这篇小综述旨在概述基本模式分析作为研究细胞生理学的代谢途径分析工具和代谢工程基础的发展和应用。
Elementary Mode Analysis is a useful Metabolic Pathway Analysis tool to identify the structure of a metabolic network that links the cellular phenotype to the corresponding genotype. The analysis can decompose the intricate metabolic network comprised of highly interconnected reactions into uniquely organized pathways. These pathways consisting of a minimal set of enzymes that can support steady state operation of cellular metabolism represent independent cellular physiological states. Such pathway definition provides a rigorous basis to systematically characterize cellular phenotypes, metabolic network regulation, robustness, and fragility that facilitate understanding of cell physiology and implementation of metabolic engineering strategies. This mini-review aims to overview the development and application of elementary mode analysis as a metabolic pathway analysis tool in studying cell physiology and as a basis of metabolic engineering.
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