Entwicklung neuer Bayesscher Netzwerkmodelle für die Systembiologieforschung
Entwicklung neuer Bayesscher Netzwerkmodelle für die Systembiologieforschung
批准号:
193900987
负责人:
Dr. Marco Grzegorczyk
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2011
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2010-12-31 至 2013-12-31
中文摘要
从系统生物学的角度来看,这是一种普遍存在的机制。麻省理工学院的生物技术是大足的高通量的数据二次霍本,并在此基础上进行了大量的研究。他说:“我知道这是一件很糟糕的事情,所以我不会再做任何统计了。”Von Besonderem Interesse für die system biologie sind genRegator ische Netzwerke and Protein-Signal-Aktivierungskaskaden,die sowohl MIT DifferentialalgleicHungsmodellen以及MIT graph ischen modellen(U.A.Bayesschen Netzwerken)Aus DEM DatenMaterial Extrahiert。这是一种新的、更灵活的建模方式,它是一种新的、灵活的建模方式。[中英文摘要]在拟南芥中发现了一种新型的生物材料。这是一件非常有趣的事情,因为它不可能发生。他们是一名机械师,也是一名同步者,他们的内心深处是一种机械和数字标签。在德国,安文东将死于Auswirkung von fortschreitendem Brustkrebs auf Regulator ische Netzwerke im Tumorgewebe analysiert。这是大北基因组nach Netzwerk-Veränderungen,die z.B.MIT DEM组织学,Gesucht。
英文摘要
Die Systembiologie versucht die Regulierungsmechanismen der lebenden Zellen in ihrer gesamten Komplexität zu verstehen. Mit Biotechnologien werden dazu high-throughput Daten erhoben, auf deren Grundlage die zellulären Zusammenhänge untersucht werden. Die Messungen sind oft stark verrauscht, so dass für die Auswertung die Entwicklung solider statistischer Modelle notwendig ist. Von besonderem Interesse für die Systembiologie sind genregulatorische Netzwerke und Protein-Signal- Aktivierungskaskaden, die sowohl mit Differentialgleichungsmodellen als auch mit graphischen Modellen (u.a. Bayesschen Netzwerken) aus dem Datenmaterial extrahiert werden. Das Forschungsprojekt widmet sich der Weiterentwicklung Bayesscher Netzwerk Modelle: Neben einer Verbesserung der Modell-Flexibilität im Hinblick auf die Modellierung von nicht-linearen Regulierungsmechanismen und heterogenen dynamischen Regulierungsprozessen wird auch eine bessere Ausschöpfung von biologischem Prior-Wissen angestrebt. Die erste konkrete Anwendung beschäftigt sich mit der Modellierung der biologischen Uhr in Arabidopsis thaliana. Dabei wird der Einfluss des externen Faktors Licht untersucht. Das Einwirken von Licht nimmt Einfluss auf die genregulatorischen Mechanismen und sorgt für eine Synchronisierung zwischen der inneren molekularen Uhr und dem Tag/Nacht Zyklus. In der zweiten Anwendung wird die Auswirkung von fortschreitendem Brustkrebs auf regulatorische Netzwerke im Tumorgewebe analysiert. Es wird dabei genomweit nach Netzwerk-Veränderungen, die z.B. mit dem histologischen Tumorgrad einhergehen, gesucht.
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1515/sagmb-2013-0051
发表时间:
2014-06-01
期刊:
STATISTICAL APPLICATIONS IN GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
0.9
作者:
[Aderhold, Andrej, Husmeier, Dirk, Grzegorczyk, Marco]
通讯作者:
Grzegorczyk, Marco
Inferring bi-directional interactions between circadian clock genes and metabolism with model ensembles
通过模型集合推断生物钟基因和新陈代谢之间的双向相互作用
DOI:
10.1515/sagmb-2014-0041
发表时间:
2015
期刊:
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology
影响因子:
0.9
作者:
[Grzegorczyk, Husmeier, Aderhold]
通讯作者:
Aderhold
DOI:
10.1007/s10994-012-5326-3
发表时间:
2013-04-01
期刊:
MACHINE LEARNING
影响因子:
7.5
作者:
[Grzegorczyk, Marco, Husmeier, Dirk]
通讯作者:
Husmeier, Dirk
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