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Computergestütztes Moleküldesign für DNA-Motive für Anwendungen in der DNA-basierten Selbstorganisation und den Nanostrukturwissenschaften

Computergestütztes Moleküldesign für DNA-Motive für Anwendungen in der DNA-basierten Selbstorganisation und den Nanostrukturwissenschaften
DNA 基序的计算分子设计在基于 DNA 的自组装和纳米结构科学中的应用
批准号:
21563184
负责人:
Dr. Udo Feldkamp
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2006
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2005-12-31 至 2008-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
DNA-vermittelte组织分子和kolloidaler Komponenten spielt eine schlsselrolle in der DNA-basierten Selbstorganisation and the DNA-Computing。Von zentraler Bedeutung f<e:1> r die Effizienz der super molecular - ululen Selbstorganisation sind de Vermeidung Von Kreuzhybridisierungen und unerwnschten Sekundärstrukturen der bebeiligten dna - molek<e:1>, die dardar<s:1> berberhinaus eine einheitliche Hybridisierungseffizienz aufweisen m<e:1> ssen。Ziel dieses interdisziplinären projects ist die Entwicklung und Evaluierung iner Software zum Design von DNA-Sequenzen, die als Bausteine fr die Selbstorganisation verwendbar sind。在Vorarbeiten, erstellte方案sollen, r den Entwurf compplereer baustein, erwetert和bzl。这是一个非常乐观的世界。算法设计与序列设计[j] . Evolutionärer算法设计与序列设计。endentwurfsalingalgorithm werden迭代算法的验证,mit denen Die tatsächliche Qualität der in s/ffco entworfenmolek<e:1> in vitro <e:1> [j] [f]。本文研究了双交叉驱动、双交叉驱动、双交叉驱动、可逆固定、蛋白质和纳米颗粒- dna Konjugaten。
英文摘要
Die DNA-vermittelte Organisation molekularer und kolloidaler Komponenten spielt eine Schlüsselrolle in der DNA-basierten Selbstorganisation wie auch dem DNA-Computing. Von zentraler Bedeutung für die Effizienz der supramolekularen Selbstorganisation sind die Vermeidung von Kreuzhybridisierungen und unerwünschten Sekundärstrukturen der beteiligten DNA-Moleküle, die darüber hinaus eine einheitliche Hybridisierungseffizienz aufweisen müssen. Ziel dieses interdisziplinären Projekts ist die Entwicklung und Evaluierung einer Software zum Design von DNA-Sequenzen, die als Bausteine für die Selbstorganisation verwendbar sind. In Vorarbeiten erstellte Programme sollen für den Entwurf komplexerer Bausteine erweitert und bzgl. ihrer Erfolgswahrscheinlichkeit optimiert werden. Die Eignung mehrkriterieller Evolutionärer Algorithmen für das Sequenzdesign soll untersucht werden. Die Entwurfsalgorithmen werden iterativ anhand von mehreren Anwendungsbeispielen verfeinert, mit denen die tatsächliche Qualität der in s/ffco entworfenen Moleküle in vitro überprüft wird. Hierbei handelt es sich um die Herstellung von zweidimensionalen Arrays aus sogenannten Double-Crossover-Motiven, und die Verwendung solcher Arrays für die reversible Immobilisierung von Protein- und Nanopartikel-DNA Konjugaten.
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