Globale Suche und funktionelle Charakterisierung kleiner, nicht-kodierender RNAs in Bacillus subtilis
Globale Suche und funktionelle Charakterisierung kleiner, nicht-kodierender RNAs in Bacillus subtilis
批准号:
31641175
负责人:
Dr. Matthias Schmalisch
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Fellowships
财政年份:
2006
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2005-12-31 至 2008-12-31
中文摘要
转录,die im Gegensatz zur mRNA nicht in Proteine <e:1> bersetzt werden,现代ihre功能直接作用于Als rna - molek<s:1> l ausicnet <e:1>。转移- rna和核糖体- rna是两种不同类型的rna,一种不同类型的rna,一种不同类型的rna,一种不同类型的rna,一种不同类型的rna,一种不同类型的小rna。Die Funktionsprinzipien diesersrnas sind dabei vielfältig, and siericerfktion z. B. durch主持了rna - rna - interinteronder durch Protein-RNA-Wechselwirkung的研究。Anfänglich als Sonderform der genetischen Regulation bei Plasmiden, transposon and Phagen besheeben,这类非同源rna也被称为grppe von Regulatoren,在真核细胞中也被称为herausgestellt。从那时起,Jahren就开始系统化地研究Suchen nrna。Dabei konzentrierten siich die bemhungen hauptsächlich auf真核细菌与auf革兰氏阴性杆菌与大肠杆菌。在革兰氏阳性模型微生物枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)中,酶原蛋白(gengenwurdine)被系统化地表达,因此,每个晚上,不同的rna都被称为<s:1> hrt。在枯草芽孢杆菌的母系中,Anzahl对sRNAs进行了鉴定,并对其同源sRNAs进行了鉴定。研究了枯草芽孢杆菌(bacillus subtilis durchgefhrt werden)中不同种类rna的基因组序列。1. Der Schwerpunkt light dabei in Der Identifizierung neuer sRNAs, die durch zwei verschiedene Ansätze erfolgen solen。转录分析:hilife eines microarrays, der alle intergenischen Regionen von枯草芽孢杆菌enthält。2. kleiner rna转录本。《疾病质粒库》(Diese plasmidbibliothebediese plasmidlibrary)已在中国鉴定出5种sRNAs,并在生物信息学系统中进行了分析。在einem weinterinteren Aspekt, Arbeit sollen, mit hilife, eines neuen Ansatzes, Zielgene, identifiziert werden, mit denen bekannte, abnoch - night näher特征isierna interinterinteren。
英文摘要
Als nicht-kodierende RNAs bezeichnet man Transkripte, die im Gegensatz zur mRNA nicht in Proteine übersetzt werden, sondern ihre Funktion direkt als RNA-Molekül ausüben. Neben den transfer-RNAs und den ribosomalen-RNAs gibt es noch eine Fülle weiterer nicht-kodierender RNAs, die man aufgrund ihrer geringen Größe auch als small RNAs (sRNAs) bezeichnet. Die Funktionsprinzipien dieser sRNAs sind dabei vielfältig, und sie üben ihre Funktion z. B. durch direkte RNA-RNA-Interaktion oder durch Protein-RNA-Wechselwirkung aus. Anfänglich als Sonderform der genetischen Regulation bei Plasmiden, Transposons und in Phagen beschrieben, haben sich nicht-kodierende RNAs als wichtige Gruppe von Regulatoren sowohl in Pro- als auch in Eukaryonten herausgestellt. In den letzten Jahren begannen daher mehrere systematische Suchen nach sRNAs. Dabei konzentrierten sich die Bemühungen hauptsächlich auf Eukaryonten und auf gram-negative Bakterien wie z. B. Escherichia coli. In dem gram-positiven Modellorganismus Bacillus subtilis hingegen wurde bis jetzt keine systematische Suche nach nicht-kodierenden RNAs durchgeführt. Die Anzahl bekannter sRNAs in B. subtilis ist daher gering, und es sind vor allem homologe sRNAs, die bis jetzt identifiziert wurden. Aus diesem Grund soll im Rahmen dieser Arbeit die erste genomweite Suche nach nichtkodierenden RNAs in B. subtilis durchgeführt werden. Der Schwerpunkt liegt dabei in der Identifizierung neuer sRNAs, die durch zwei verschiedene Ansätze erfolgen soll: 1. Transkriptionsanalysen mit Hilfe eines Mikroarrays, der alle intergenischen Regionen von B. subtilis enthält. 2. Die Herstellung einer Plasmidbibliothek kleiner RNA-Transkripte. Diese Plasmidbibliothek soll darüber hinaus helfen sRNAs zu identifizieren, die in bekannte Regulationssysteme eingreifen. In einem weiteren Aspekt dieser Arbeit sollen mit Hilfe eines neuen Ansatzes Zielgene identifiziert werden, mit denen bekannte, aber noch nicht näher charakterisierte RNAs interagieren.
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