Molecular basics of Mycorrhizal symbiosis

在Schwerpunktprogramms“Mykorrhiza”的Rahmen中，我们也可以将Ektomykorrhizatyp Genomprojekte auf Genexpressionsebene durchgeführt韦尔登用于Endo- als。以蒺藜苜蓿-摩西球囊霉-内菌根共生菌和山杨-毒鹅膏菌-外菌根共生菌为模型进行了研究。这是显而易见的，来自菌根的mRNA可以被单独的菌根化，而cDNA可以被遗传和克隆化。在对菌根真菌的pflanzliche和pilzliche cDNA进行分选时，需要大约15.000个cDNA-Sequenzen序列，并在DNA-FilterArrays韦尔登上鉴定出10.000个cDNA-Sequenzen。该菌根过滤器阵列艾伦SPP项目合作伙伴的表达suntersuchungen zur Verfügung。Mittels Bioinformatik韦尔登werden die berücksichtigten Gensequenzen annotiert.所有的序列和表达式数据都可以在SPP的一个特殊数据库中进行处理。

Im Rahmen des Schwerpunktprogramms "Mykorrhiza" sollen sowohl für den Endo- als auch für den Ektomykorrhizatyp Genomprojekte auf Genexpressionsebene durchgeführt werden. Dafür wurden die Medicago truncatula - Glomus mosseae-Symbiose für die Endomykorrhiza und die Populus tremula x tremuloides - Amanita muscaria-Symbiose für die Ektomykorrhiza als Modell-Interaktionen ausgesucht. Es ist beabsichtigt, mRNA aus mykorrhizierten Wurzeln beider Mykorrhizatypen zu isolieren und daraus cDNAs zu generieren und zu klonieren. Nach Sortierung in pflanzliche und pilzliche cDNAs sollen für beide Mykorrhizatypen insgesamt rund 15.000 nicht redundante cDNA-Sequenzen ermittelt und schätzungsweise 10.000 identifizierte Gensequenzen auf DNA-FilterArrays gebunden werden. Diese Mykorrhiza-Filter-Arrays stehen allen SPP-Projektpartnern für Expressionsuntersuchungen zur Verfügung. Mittels Bioinformatik werden die berücksichtigten Gensequenzen annotiert. Alle Sequenz- und Expressionsdaten werden in einer speziell für den SPP entwickelten Datenbank gespeichert und verarbeitet.